Państwowa Inspekcja Sanitarna (PIS) w województwie warmińsko-mazurskim obejmuje nadzorem ponad trzynaście tysięcy obiektów żywnościowo - żywieniowych w zakresie produkcji, magazynowania, transportu i obrotu, a także materiały i wyroby kontaktujące się z żywnością. Ocenie podlega również jakość żywienia w zakładach zamkniętego żywienia zbiorowego. Poszerzenie zakresu badań laboratoryjnych próbek żywności w 2004 roku o pestycydy, mykotoksyny i barwniki Sudan i para-Red, czynniki mikrobiologiczne takie jak: Listeria, Yersinia, Cambylobacter dodatkowo zabezpiecza wymagania higieniczne. Oceny jakości zdrowotnej środków spożywczych, przedmiotów użytku i badań sanitarnych dokonywano w ramach urzędowej kontroli żywności oraz monitoringowych badań laboratoryjnych. Ocena jakości zdrowotnej środków spożywczych została przeprowadzona w oparciu o badania mikrobiologiczne, chemiczne, fizyczne, organoleptyczne oraz w kierunku znakowania. Najistotniejszym problemem były stwierdzane zanieczyszczenia mikrobiologiczne. Jakość zdrowotna krajowych środków spożywczych w 2006r., uległa nieznacznemu pogorszeniu w porównaniu do roku 2005, o 0,7% ale jest zdecydowanie lepsza w zestawieniu do roku 2004.