Korzyści wynikające z zastosowania komórek immobilizowanych wpływają na znaczny wzrost zainteresowania aplikacją takich systemów w procesach biotechnologicznych. Najczęściej takie systemy są wykorzystywane przy produkcji etanolu, gdzie komórki utrzymywane są przez adsorbcję, samoagregację lub usidlenie wewnątrz nośnika. Poza tym komórki immobilizowane znalazły zastosowanie w piwowarstwie, winiarstwie, w przemyśle owocowo-warzywnym, do produkcji octu, w fermentacji propionowej i w przemyśle mleczarskim (kultury starterowe i produkcja fermentowanych napojów mlecznych). Jednak wprowadzenie tych technologii na skalę przemysłową musi być poprzedzone wieloma badaniami.