Szkolenie specjalistów w różnych dziedzinach medycyny (dla lekarzy i lekarzy dentystów) oraz w dziedzinach mających zastosowanie w ochronie zdrowia (dla osób posiadających zawodowy tytuł magistra) jest realizowane pod nadzorem Centrum Medycznego Kształcenia Podyplomowego, według programów opracowanych przez zespoły powołane przez specjalistów krajowych w danej dziedzinie medycyny, z udziałem korporacji zawodowych (Izba Lekarska, Izba Weterynaryjna, Izba Diagnostów Laboratoryjnych). To powoduje, że programy specjalizacji w tych samych dziedzinach nie zawsze są ze sobą spójne.