Ściśle chroniony gatunek, kotewka orzech wodny Trapa natans wymieniony jest w Polskiej Czerwonej Księdze Roślin wśród gatunków krytycznie zagrożonych (CR), zaś w Czerwonej liście roślin i grzybów Polski w kategorii taksonów wymierających (E). W 2008 roku odnotowano dwa nowe stanowiska tego gatunku na terenie jezior: Kozienickiego i Opatkowickiego (Nizina Środkowomazowiecka, kwadrat ATPOL FD90). Populacja Trapa natans na Jeziorze Opatkowickim składała się z kilkunastu osobników (56 rozet liściowych), na terenie Jeziora Kozienickiego – zaledwie z kilku osobników (12 rozetek liściowych). Ze względu na duże walory przyrodnicze Jeziora Opatkowickiego (m.in. bogate stanowisko salwinii pływającej Salvinia natans i groszku błotnego Lathyrus palustris) zaproponowano objęcie go ochroną rezerwatową. Dla zachowania populacji Trapa natans i Salvinia natans konieczne są zabiegi ochrony czynnej, polegające na utrzymaniu lub niewielkim podwyższeniu istniejącego poziomu wody oraz systematycznym usuwaniu ekspansywnych helofitów i hydrofitów.