Ograniczanie wyników

Czasopisma help
Autorzy help
Lata help
Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników

Znaleziono wyników: 55

Liczba wyników na stronie
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 3 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych:  Bacillus anthracis
help Sortuj według:

help Ogranicz wyniki do:
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 3 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników
In recent years, insilico approaches have been predicting novel drug targets. The present day development in pharmaceutics mainly ponders on target based drugs and this has been aided by structure based drug designing and subtractive genomics. In the present study, the computational genome subtraction methodology was applied for identification of novel, potential drug target against Bacillus anthracis, cause of deadly anthrax. The potential drug target identified through subtractive genomics approach was considered as polysaccharide deacetylase. By virtual screening against NCI database and Drugbank chemical libraries, two potential lead molecules were predicted. Further the potential lead molecules and target protein were subjected for docking studies using Autodock.
Flow cytometry is a method of identification biological agents that has various applications. It has been applied for identifying many types of antigens in various materials, including environmental samples. Recently it has been noticed that this method could be used for molecular detection of biological agents. The purpose of this work was to apply flow cytometry with nested-PCR for the molecular identification of B. anthracis. Paramagnetic streptavidin-coated beads were used to capture the resulting fluorophore-labeled sequences. The results show that flow cytometry can be successfully used to detect specific fluorescein- dUTP and a biotin marked sequences.
Rapid and accurate diagnostic tools for detection and identification of Y. pestis, B. anthracis and F. tularensis are essential for timely initial appropriate treatment of exposed individuals, which will be critical to their survival, as well as for reduction of the public health impact and the spread of the disease. The paper presents application of fast polymerases and fast dry electrophoresis in conventional PCR as an alternative for real-time PCR application for detection and identification of the above pathogens. The proposed method takes less than 50 min. to obtain final results of the tests and is cheaper than real-time PCR.
Przeprowadzono badania nad zastosowaniem bioluminometrii do szybkiego wykrywania obecności przetrwalników Bacillus anthracis w zawiesinie i w wodzie. Czułość metody bioluminometrycznej wynosiła 29.700 CFU/ml. Statystycznie znamienne wyniki w porównaniu z kontrolą otrzymano przy stężeniu przetrwalników Bacillus anthracis 10⁴ CFU/ml po 10 minutach inkubacji.
Przeprowadzono ocenę wybranych markerów chromosomalnych oraz metod biologii molekularnej pod kątem ich przydatności do identyfikacji Bacillus att- thracis. W pracy przedstawiono wyniki oceny uzyskane dla markerów SG-749, SG-300 oraz SG-450. Posłużono się techniką RFLP-PCR i MSSCP oraz różnymi metodami rozdziału elektroforetycznego. Wyniki badań dostarczyły informacji nie tylko na temat swoistości analizowanych markerów, ale także o możliwości skrócenia czasu potrzebnego na uzyskanie wyniku.
Badano wpływ promieniowania gamma na przetrwalniki B. anthracis. Do naświetlania zastosowano dawkę jednorazową i frakcjonowaną promieniowania gamma. Stwierdzono, że na efektywność procesu sterylizacji wpływa sposób naświetlania oraz liczba przetrwalników w 1 ml zawiesiny. Objętość wodnej zawiesiny przetrwalników nie ma wpływu na skuteczność sporobójczą sterylizacji radiacyjnej zarówno przy zastosowaniu dawki jednorazowej jak i dawek frakcjonowanych.
The aim of the study was to apply the real-time PCR method with the intercalating dye SYBR Green I for the detection of genes of Bacillus anthracis located on plasmids pXO1 and pXO2 and the specific chromosomal rpoB sequence. The research was conducted on one vaccinal and four field strains of Bacillus anthracis. The assessment of the specificity of the tests involved isolates of other species of the genus Bacillus as well as strains of six other species of microorganisms. The studies were conducted with the PCR QuantiTect kit (Qiagen) and primers specific for the gene pag coding PA protein, gene cap coding capsule, and primers for the amplification of the specific chromosomal sequence. PCR enabled the detection of all genes under examination by the observation of amplification curves. The specificity of real-time PCR was confirmed by estimating melting temperatures of PCR products. It was shown that the melting temperatures of amplicons obtained in the reaction were 78°C, 79°C and 76°C in cases of detecting the chromosomal rpoB sequence, pag gene, and cap-C gene, respectively. The sensitivity and linearity of the reactions were determined using a regression coefficient. A high regression coefficient of 0.99 was demonstrated for all the reactions. The real-time tests were highly sensitive and specific.
93 environmental samples were collected and tested using molecular biology techniques. The presence of chromosomal sequence Ba813 was detected in three soil samples (SS1, SS3, ZL2) and in three dental pulp samples (ZZ3, ZZ5, ZZ8). The presence of pag gene (210 bp) was observed in SS3 and ZL2 samples. There were no positive reactions with primers targeting the capsule encoding gene (777 bp). Multiplex PCR reaction enables identification of capC gene (264 bp) in five samples: SS3, ZL2, ZZ3, ZZ5, ZZ8. The presence of pag gene (SS3, ZL2) and cap gene (SS3, ZL2, ZZ5) were observed in standard PCR. Bacillus anthracis spores were detected by SMART test in three samples: SS3, ZL2 and ZZ5. These strains were non-hemolytic, sensitive to penicillin and gamma phage. The PCR positive for pag gene isolates were able to produce PA (protective antigen).
Repetitive element polymorphism-PCR (REP-PCR) is one of the tools that has been used to elucidate genetic diversity of related microorganisms. Using the MB1 primer, REP-PCR fingerprints from 110 Bacillus strains within the "B.cereus group" have identified eighteen distinct categories, while other more distantly related bacterial species fell within six additional categories. All Bacillus anthracis strains tested were found to be monomorphic by fluorophore-enhanced REP-PCR (FERP) fingerprinting using the MB1 primer. In contrast, other non- B.anthracis isolates displayed a high degree of polymorphism. Dendrogramic analysis revealed that the non- B.anthracis strains possessing the Ba813 chromosomal marker were divided into two clusters. One of the clusters shared identity with the B.cereus strains examined.
Nine strains belonging to Bacillus cereus group has been isolated from food and environmental samples. Their taxonomic position was confirmed by RFLP analysis of 16S rRNA gene digested with Taq\. The detection of DNA sequences encoding the hemolysin BL complex and enterotoxin NHE, was studied in Bacillus sp. isolates. Set of primers was used to amplify fragment of hblD gene by PCR. For the detection of nheB gene a new primer set was developed which allowed to amplify 273 bp fragment from wide number of strains belonging to B. cereus group. The hblD gene was present in 7 out of 9 isolates whereas nheB gene occurred in all of them. Reference strains of B. cereus LOCK 0807, and B. thuringiensis NCAIM 01262 contained both genes. Strains of B. subtilis ATCC 6633 and B. pumilus LOCK 0814 do not contain both genes. Obtained results showed that B. thuringiensis NCAIM 01262 contains both genes and therefore may be harmful for human beings.
Przebadano proces zakażania i kolonizacji próbek skóry świńskiej przez B. anthracis w trakcie ekspozycji przez nakładanie na hodowle agarowe lub przez zanurzanie w hodowlach płynnych. Wyniki badań potwierdzają przypuszczenie, że przy dłuższym magazynowaniu skór (np. dłuższy transport) i w warunkach optymalnej wegetacji bakterii, istnieje możliwość zakażania i kolonizacji laseczkami wąglika partii zdrowych skór przez przypadkowo umieszczoną skórę zakażoną.
The aim of the study was to use selected genetic analysis to differentiate plasmid cured strains of Bacillus anthracis from transitional strains (Bacillus sp. Ba 813). Two different research techniques (macro restriction analysis and PCR) were used and they confirmed that the PCR technique facilitated detecting the presence of the Ba 813 chromosomal sequence in both strains (plasmid cured Bacillus anthracis strain and Bacillus sp. Ba 813). This result indicated that applying the PCR method to differentiate plasmid cured Bacillus anthracis strains from Bacillus sp. Ba 813 was not possible. The macro restriction method, however, facilitated a precise differentiation of plasmid cured Bacillus anthracis strains from transitional Bacillus sp. Ba 813.
W prezentowanej pracy podjęto próbę zróżnicowania szczepionkowego szczepu Sterne 34F2 i atypowych izolatów B. anthracis wyosobnionych w Polsce drogą wykorzystania 10 loci VNTR, a także sprawdzenia czy takie czynniki jak: anthrolizyna O (gen alo), cereolizyna (gen clo), hemolityczna enterotoksyna HBL (gen hblA) i mutacja typu stop w genie plcR mogą być związane z hemolityczną aktywnością tych izolatów. Potwierdzono klonalne pokrewieństwo szczepów hemolizujących i nie wykazujących tej cechy. Mimo, że nie zidentyfikowano czynnika genetycznego warunkującego zdolność do hemolizy badanych szczepów, to wykazano, że badane szczepy posiadały geny alo, clo i mutację typu stop w genie plcR przy braku obecności genu hblA. Zebrane informacje umożliwiły pełniejszą charakterystykę hemolizujących szczepów B. anthracis izolowanych na terenie kraju.
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 3 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.