Preferencje help
Polish version English version Język
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników

Znaleziono wyników: 5

Liczba wyników na stronie
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 1 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników

Wyniki wyszukiwania

help Sortuj według:

help Ogranicz wyniki do:
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 1 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników
1
Artykuł dostępny w postaci pełnego tekstu - kliknij by otworzyć plik
Content available

Databases and associated bioinformatic tools in studies of food allergens, epitopes and haptens - a review

100%
Bucholska J., Minkiewicz P., Darewicz M., Iwaniak A.
Polish Journal of Food and Nutrition Sciences
|
2018
|
tom 68
|
nr 2
Allergies and/or food intolerances are a growing problem of the modern world. Diffi culties associated with the correct diagnosis of food allergies result in the need to classify the factors causing allergies and allergens themselves. Therefore, internet databases and other bioinformatic tools play a special role in deepening knowledge of biologically-important compounds. Internet repositories, as a source of information on different chemical compounds, including those related to allergy and intolerance, are increasingly being used by scientists. Bioinformatic methods play a signifi cant role in biological and medical sciences, and their importance in food science is increasing. This study aimed at presenting selected databases and tools of bioinformatic analysis useful in research on food allergies, allergens (11 databases), epitopes (7 databases), and haptens (2 databases). It also presents examples of the application of computer methods in studies related to allergies.
2
Artykuł dostępny w postaci pełnego tekstu - kliknij by otworzyć plik
Content available

Nadwrażliwość pokarmowa białek ryb

100%
Bucholska J., Darewicz M., Minkiewicz P., Starowicz P.
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
|
2015
|
tom 583
Niepożądane reakcje organizmu człowieka związane ze spożyciem żywności to nietolerancje pokarmowe lub alergie. Immunologiczna odpowiedź organizmu na składniki żywności jest wywoływana przez wiele czynników. Alergia objawia się w postaci wielu niespecyficznych reakcji. Epitopy białek, odpowiadające za oddziaływania z przeciwciałami dzielimy na liniowe (ciągłe fragmenty łańcucha białkowego) i konformacyjne (reszty aminokwasowe sąsiadujące w wyniku tworzenia struktury drugo- i trzeciorzędowej). Białka posiadające epitopy o podobnej budowie mogą wykazywać reakcje krzyżowe. Wśród alergii pokarmowych ważne miejsce zajmuje immunologiczna nadwrażliwość pokarmowa na białka ryb. Stabilność termiczna białek ryb powoduje, że zachowują one właściwości alergenne pomimo stosowanych procesów technologicznych. Molekularne aspekty identyfikacji i charakterystyki alergenów pokarmowych, w tym alergenów ryb, są podstawą ich wykorzystania w praktyce klinicznej. W niniejszej pracy scharakteryzowano immunologiczną nadwrażliwość pokarmową na przykładzie białek ryb, molekularne aspekty alergennych białek ryb oraz wybrane metody ich identyfikacji.
3
Artykuł dostępny w postaci pełnego tekstu - kliknij by otworzyć plik
Content available

Evaluation of in silico prediction possibility of epitope sequences using experimental data concerning allergenic food proteins summarised in BIOPEP database

88%
Minkiewicz P., Dziuba J., Darewicz M., Bucholska J., Mogut D.
Polish Journal of Food and Nutrition Sciences
|
2012
|
tom 62
|
nr 3
The aim of the study was to evaluate the possibility of predicting potential epitope sequences and location in allergenic proteins from food using EVALLER program by comparison with experimental epitopes summarised in the BIOPEP database of allergenic proteins. Sequences of experimental epitopes from food allergens, present in the BIOPEP database of allergenic proteins were used in the study. Sequences of potential epitopes were found using EVALLER program. The Positive Predictive Value (PPV) has been used as a measure of prediction quality. The potential epitopes fully or partially overlapping with the experimental ones were considered as true positive results whereas these unrelated to the experimental ones as false positive results. The PPV for entire dataset containing 310 potential epitopes was 80.6%. The PPV varied signifi cantly among particular allergen families defi ned according to the AllFam database. Caseins revealed PPV=100% (with one exception), proteins from tropomyosin family and proteins from papain-like cystein protease family – exceeding 50%. The last two families possess also relatively low frequency of epitope occurrence. The predictive potential was poor (less than 50%) for plant allergens from cupin superfamily. Families such as lipocalins from milk and EF-hand family (parvalbumins) revealed high variability within family. The EVALLER program may be used as a tool for the prediction of epitope location although its potential varies considerably among allergen families. High PPV is associated with a high number of known experimental epitopes (such as in caseins) and/or a high degree of sequence conservation within family (caseins, tropomyosins).
4
Artykuł dostępny w postaci pełnego tekstu - kliknij by otworzyć plik
Content available

Hybrid approach in the analysis of bovine milk protein hydrolysates as a source of peptides containing di- and tripeptide bitterness indicators

88%
Iwaniak A., Minkiewicz P., Hrynkiewicz M., Bucholska J., Darewicz M.
Polish Journal of Food and Nutrition Sciences
|
2020
|
tom 70
|
nr 2
The aim of this study was to employ a hybrid approach combined with a fragmentomic idea of research used to analyze bovine milk protein hydrolysates as a source of peptides with a potential bitter taste. Firstly, selected sequences of bovine milk proteins were in silico hydrolyzed using bromelain, ficin, papain, and proteinase K. Hydrolysis was simulated using the BIOPEP-UWM “Enzyme(s) action” tool. Potentially released peptides (called parent peptides) were analyzed for the presence of shorter peptide regions with bitter taste. Some of them were defined as peptide bitterness indicators. Then, in silico results were verified in the in vitro experiments with the use of a bovine milk protein concentrate (MPC) as a substrate. The verification included the MPC hydrolysis and identification of peptides in MPC hydrolysates using RP-HPLC and RP-HPLC-MS/MS, respectively. The hybrid analysis of bovine milk protein hydrolysates showed that all released peptides contained fragments with bitter taste and some of them were bitterness indicators, which could potentially determine the taste of a whole sequence. However, the results of in silico and in vitro hydrolysis were divergent. It was also reflected by the ranking of enzymes acting in silico and in vitro. Despite above discrepancies, our predictions concerning the release of peptides that may affect the bitter taste of a hydrolysate, contribute to bringing more insights into the taste of foods, especially if unwanted. However, before introducing a food product to the market, sensory studies are required to confirm (or not) its taste. Hybrid analysis of bovine milk protein hydrolysates showed that all released peptides contained fragments with bitter taste and some of them were bitterness indicators, which could potentially decide about the taste of a whole sequence. However, the results of in silico and in vitro hydrolysis were divergent. It was also reflected by the ranking of enzymes acting in silico and in vitro. Despite above discrepancies, our predictions concerning the release of peptides that may have influence on bitter taste of a hydrolysate, contribute to giving more insights on the taste of foods, especially if unwanted. However, before the introducing of food to the market, sensory studies confirming (or not) taste of the product are required.
5
Artykuł dostępny w postaci pełnego tekstu - kliknij by otworzyć plik
Content available

Biologicznie aktywne peptydy pochodzące z białek żywności: badania in silico, in vitro i in vivo, aspekty aplikacyjne oraz ocena bezpieczeństwa

76%
Minkiewicz P., Darewicz M., Iwaniak A., Borawska J., Bucholska J., Hrynkiewicz M.
Żywność Nauka Technologia Jakość
|
2015
|
tom 22
|
nr 5
Bioaktywne peptydy obecne w żywności mogą przyczynić się do zmniejszenia występowania chorób przewlekłych. W produktach spożywczych peptydy zazwyczaj są uwalniane poprzez hydrolizę enzymatyczną białek. W pracy przedstawiono wybrane metody analityczne, chemometryczne i bioinformatyczne, stosowane w badaniach molekularnych i biologicznych właściwości peptydów pochodzących z białek żywności. Opisano także metody zwiększania biodostępności peptydów oraz wybrane aspekty oceny ich bezpieczeństwa. Zrozumienie aspektów molekularnych biologicznej aktywności peptydów stwarza podstawy postępu w wykorzystaniu tych związków jako składników żywności zapobiegających chorobom dietozależnym.
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 1 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.