W procesie pakowania żywności ryzyko wystąpienia zakażenia wtórnego jest dość wysokie, co może mieć niekorzystne skutki dla jej jakości i zdrowotności. Wpływ takich czynników, jak specyfika technologii produkcji, konstrukcja maszyn i urządzeń pakujących, rodzaj opakowań, liczba i stan higieny personelu, zanieczyszczenie pomieszczeń i powietrza oraz organizacja procesu pakowania powoduje, że proces, który ma na celu chronić produkt przed szkodliwym działaniem otoczenia, może być dla niego przyczyną poważnych zagrożeń. Dlatego zachowanie wysokich standardów bezpieczeństwa higienicznego tego etapu produkcji jest tak istotne i stawia się mu coraz wyższe wymagania, przede wszystkim w zakresie wpływu na jakość pakowanych produktów. Odpowiednio zorganizowany proces pakowania jest (oprócz jakości samego surowca) w wielu wypadkach najważniejszym elementem decydującym o uzyskanym produkcie.