Badania geologiczne prowadzone w licznych dolinach rzecznych na obszarze Niżu Polskiego wykazują, że formy te mają często charakter poligeniczny. Ważnym czynnikiem genetycznym, kształtującym ich budowę geologiczną były procesy związane z wkraczaniem i zanikiem lądolodów skandynawskich. Rzeki wykorzystują na swoje doliny pozostałe po deglacjacji obniżenia wytopiskowe, tworzące ciągi jezior przepływowych. Występowanie w odcinkach pojeziornych dolin rzecznych słaboprzepuszczalnych utworów niealuwialnej genezy (jeziornych i zastoiskowych), a także obecność w podłożu dolin i w ich strefach krawędziowych zaburzeń układu warstw, związanych z glacjalną genezą odcinka doliny, może powodować utrudnienia w zasilaniu rzeki odpływem podziemnym. Złożoność procesów powstawania poligenicznego odcinka doliny jest także przyczyną zróżnicowania struktur wodonośnych w tych dolinach.