Alternatywne metody badania stanu mikrobiologicznego wody oparte na technologii zdefiniowanych substratów stanowią doskonałe uzupełnienie metod referencyjnych, dostarczając istotnych informacji w krótkim czasie i umożliwiając podjęcie działania w sytuacjach krytycznych. W artykule opisano system Colilert-18/Quanti-Tray 2000 stanowiący przykład zastosowania technologii zdefiniowanych substratów, umożliwiający równoczesną detekcję bakterii grupy coli i E. coli bezpośrednio w badanej próbie wody. Wchodzące w skład pożywki substraty ONPG (chromogenny o-nitrofenylo- β-D-galaktopiranozyd) i MUG (fluorogenny 4-metyloumbeliferylo- β-D-glukuronid) są metabolizowane przez enzymy bakterii grupy coli i E. coli obecne w badanej próbie wody, w wyniku czego uwalniany jest żółty (β-D-galaktozydaza) lub fluoryzujący (β-D-glukuronidaza) produkt. Wysoka specyficzność enzymów, zastosowanych w omawianym systemie wyeliminowała konieczność wykonywania testów potwierdzających.