Opracowano wiele testów wykorzystujących cechy morfologiczne, biochemiczne i fizjologiczne bakterii w celu ich identyfikacji i klasyfikacji. W artykule zaprezentowano krótki opis wybranych metod genetycznych stosowanych w identyfikacji, klasyfikacji i różnicowaniu mikroorganizmów: analizę polimorfizmu fragmentów po trawieniu enzymami restrykcyjnymi, elektroforezę w zmiennym polu elektrycznym, elektroforezę w gradiencie czynnika denaturującego, analizę polimorfizmu fragmentów pojedynczoniciowego DNA, amplifikację techniką PCR losowych fragmentów DNA. Opisane metody zwiększają możliwości analityczne ograniczone ilością komercyjnie dostępnych zestawów diagnostycznych, a tym samym pozwalają na rzetelną i szybką identyfikację mikroorganizmów.