Wystandaryzowano technikę łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) do wykrywania genów M. pneumoniae kodujących białko PI, pod jednostkę 16S rRNA i czynnik ekongacyjny Tu. Stwierdzono, że PCR jest techniką umożliwiającą wykrycie poszukiwanych genów nawet wtedy, gdy w 1 ml hodowli znajduje się od 10(2) do 10(4) komórek M. pneumoniae.