Mikrobiologia prognostyczna opiera się na szczegółowej wiedzy o zachowaniu się mikroorganizmów i przewidywaniu ich zachowań z wykorzystaniem modeli matematycznych. Szacowanie terminów przydatności do spożycia wg Rozporządzenia (WE) nr 2073/2005 w sprawie kryteriów mikrobiologicznych dotyczących środków spożywczych powinno odbywać się z zastosowaniem modeli prognostycznych. Szeroki dostęp do nich jest możliwy dzięki bazom danych w Internecie. Pionierskim opracowaniem tego rodzaju jest baza ComBase powstała w 2003 roku, złożona z przeglądarki ComBase, ComBase Predictor, modeli żywnościowych oraz DMFit. W 2018 roku w wyniku realizacji projektu Inkubator Innowacyjności+ została opracowana polska baza matematycznych modeli prognostycznych ProgBaz SGGW. Zaletą opracowania jest to, że dane do opracowania matematycznych modeli prognostycznych pochodzą z układu realnego produktu (modelowego lub rynkowego), a także rodzima mikroflora produktów wykorzystanych jako baza do kontaminacji bakteriami patogennymi. W najbliższym czasie planowany jest rozwój ProgBaz poprzez zwiększanie liczby modeli oraz ich sukcesywną walidację.