W pracy przedstawiono wyniki badań jakości wód jezior Niepruszewskiego i Tomickiego, usytuowanych w rolniczej zlewni Samicy Stęszewskiej. Badania stanowią część szerokiego projektu badawczego, dotyczącego obiegu biogenów w agroekosystemach i zanieczyszczania wód. Zlewnię cechuje przewaga gruntów ornych (72% pow.), mała lesistość (12%), duży udział gleb lekkich, intensywna gospodarka rolna i dość gęsta zabudowa wiejska. Woda w Jeziorze Niepruszewskim w 1999 roku nie odpowiadała normom z powodu wysokiej wartości miana coli. W 2000 roku zarówno w Jez. Niepruszewskim jak i w Jez. Tomickim jakość wody odpowiadała III klasie czystości. Wysoki poziom składników biogennych, chlorofilu i suchej masy sestonu oraz mała widzialność krążka Secchiego świadczą o postępującej eutrofizacji obydwu jezior. W stosunku do wcześniejszych badań PIOŚ (1994 r.) w Jeziorze Niepruszewskim nastąpiło obniżenie wielkości BZT₅ oraz zawartości azotu mineralnego chlorofilu, pogorszyły się natomiast warunki tlenowe, widzialność krążka Secchiego, poziom fosforu oraz miano coli. W stosunku do badań OBKOŚ (1982 r.) w Jeziorze Tomickim zmniejszyła się zawartość fosforu i wielkość BZT₅, pogorszył się natomiast stan sanitarny, poziom azotu mineralnego i warunki tlenowe.