Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników

Znaleziono wyników: 15

Liczba wyników na stronie
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 1 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych:  genetic map
help Sortuj według:

help Ogranicz wyniki do:
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 1 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników
A linkage map of pea was constructed based on a 104 RIL population derived from the cross combination Wt10245 x Wt11238. The map, which consisted of 204 morphological, isozyme, AFLP, ISSR, STS, CAPS and RAPD markers, was used for interval mapping of the QTLs controlling the stem length and internode number of pea. In the characterization of a given QTL, we included an identification of its position with reference to the flanking markers, an estimation of the part of variance explained by it, and a determination of gene action. Six QTLs per trait were identified as demonstrating linkage to ten intervals on five linkage groups. As many as seven QTLs influencing the analysed traits were mapped on linkage group II, indicating the important role of this region of the pea genome in plant height control.
The majority of published genetic maps are based on Kosambi distances or on Haldane distances. For a comparison of both map distance measures, their random variability is of particular interest. For the statistic ‘variance’, this paper presents a relationship between Kosambi distances and Haldane distances. The results suggest that Kosambi distances exhibit a smaller random variability. The theoretical results are applied to an experimental data set for molecular AFLP markers linked to the bolting gene of sugar beet (Beta vulgaris L.).
Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP), Simple Sequence Repeat (SSR) and Single Nucleotide Polymorphism (SNP), were applied to the tomato genome for assessment of polymorphism and for mapping. The polymorphism of AFLP was studied in twenty-one commercial tomato (L. esculentum) varieties. Four AFLP primer combinations produced 298 elear bands; an average of 75 bands per combination. SSR markers were generated from two sources: (1) size-selected genomic libraries screened with (AT)n, (CT)n, (GT)n, (ATT)n and (CTT)n probes. (2) GeneBank database. Primers were designed for 114 loci and used for genotyping 13 tomato varieties and three Lycopersicon species. Eighteen markers were used to evaluate the polymorphism among the commercial cultivars and were found to be a useful tool for cultivar identification. In-silico comparison of DNA sequences (ESTs and genes) of L. pennellii and L. esculentum, yielded 312 SNPs. Ten L. pennelli genomic fragments were sequenced and the comparison with L. esculentum yielded 22 SNPs. Another 19 SNPs were discovered by sequencing and comparing L. pennellii genomic DNA to L. esculentum DNA fragments containing SSRs. The average SNP frequency was found to be one in a few tens of base pairs. A total of 52 microsatellites, 159 polymorphic AFLP markers and six SNPs were mapped using the Introgression Lines generated by [1]. Map location and markers’ distribution are presented.
DNA markers are used not only to estimate genetic similarity and distance but also to select and identify desirable forms, to assess the adjustment of breeding material, to confirm crossbreeding efficiency, to determine seed purity, and to identify the genes which determine important functional traits. In the case of oat, DNA markers were used to construct and increase the density of genetic maps both in hexaploid and diploid species. The development of markers for some important traits provides a fast selection of genotypes containing dwarf genes as well as the resistance genes to crown rust and powdery mildew. Numerous analyses of genetic similarity between different species belonging to the genus Avena which are currently carried out may contribute to explaining the process of evolution within this genus and may also explain the development of particular species of oat.
Location of the loci that control preharvest sprouting and alpha-amylase activity in rye was studied based on intercross S120×S76, consisting of 110 genotypes of F2 and F3 progenies. The genetic map currently consists of 141 loci distributed in 11 linkage groups, covering a distance of 506.4 cM, and was enriched during this study with 24 sequence-specific markers (7 SCARs, 7 SSRs, and 10 STSs). The extended map was applied for composite interval mapping of the loci controlling preharvest sprouting and a-amylase activity, revealing 3 significant QTLs for preharvest sprouting, located on chromosomes 3R, 5R and 6R (in 1999), and one QTL for a-amylase activity found on chromosome 2R (in 2000).
Opracowanie i wprowadzenie nowocześniejszych metod badawczych, przyczynia się do dokładnego poznania zmienności genetycznej genomów roślinnych. Analiza molekularna na poziomie DNA pozwala ocenić zmienność genetyczną z pominięciem obserwacji fenotypów i wyeliminowaniu wpływu środowiska, które często modyfikuje ekspresję genów. Zastosowanie markerów molekularnych umożliwia bezpośrednie wykrywanie różnic pomiędzy allelami danego genu. Spośród wielu opisanych metod molekularnych, najczęściej do analizy genomu roślinnego wykorzystywane są następujące techniki: PCR, RAPD, RFLP, AFLP oraz mikrosatelity SSR i ISSR. Wymienione metody molekularne DNA są stosowane również z dużym powodzeniem w badaniach genetycznych nad żytem.
Technologia DArT (ang. Diversity Arrays Technology) opracowana z wykorzystaniem technologii mikromacierzy pozwala na jednoczesną analizę wielu sekwencji polimorficznych, których zmienność wynika z różnic genetycznych rozpoznawanych przez enzymy restrykcyjne. Technologię DArT zastosowano dotychczas w badaniach genetycznych 58 gatunków, w tym 53 gatunków roślin, kilku gatunków zwierząt i mikroorganizmów. Umożliwia ona tworzenie profili genetycznych gatunków bez względu na poziom dostępnej informacji molekularnej. Ze względu na automatyzację charakteryzuje się bardzo wysoką wydajnością generowania markerów (kilkaset - kilka tysięcy markerów w jednym eksperymencie), jest tania i wysoce powtarzalna (do 99,8%). Technologia DArT jest przydatna do konstrukcji silnie zagęszczonych map genetycznych w oparciu o same markery DArT lub w połączeniu z innymi typami markerów, do identyfikacji QTL oraz analizy pokrewieństwa genetycznego. Z udziałem markerów DArT skonstruowano mapy molekularne, m.in. dla jęczmienia, pszenicy, sorga, Arabidopsis thaliana, trzciny cukrowej i żyta. Analizowano zmienność genetyczną form w obrębie gatunków strączkowych, pszenicy, jęczmienia, sorga, bananów, eukaliptusa i wielu innych. Technologia DArT jest również wykorzystywana w badaniach mikroorganizmów, w tym w metagenomice oraz w badaniach molekularnych opartych na analizie całego genomu i w poszukiwaniu markerów sprzężonych z ważnymi cechami, przydatnych w hodowli roślin.
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 1 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.