Analiza zmian jakości wody przeprowadzona na podstawie średnich z pięciu lat (1997-2001) stężeń wskaźników biogennych wykazała zależności wynikające ze zmiennego charakteru koryta rzecznego. Stwierdzono, że w anastomozującym odcinku rzeki nastąpiło obniżenie przeciętnych stężeń, które dla P-P0₄³ˉ, P og. i chlorofilu a wynosiło odpowiednio po 8,9; 21,6 i 60,0%. Wzrost dotyczył wapnia, magnezu, potasu, azotu amonowego i azotanowego, co należy przypisać dostawie składników ze zlewni. W odcinku poniżej Parku, gdzie Narew płynie sztucznie wyprofilowanym korytem, odnotowano wzrost wszystkich przeciętnych wartości omawianych parametrów. Wpływ na jakość wód Narwi w tym odcinku ma dopływ silnie zanieczyszczonych wód Horodnianką oraz wzrost oddziaływań gospodarczych w dolinie rzecznej i na terenach do niej przyległych.