Identyfikacja i wykrywanie Xanthomonas hortorum pv. pelargonii w materiale roślinnym metodą PCR

• Autorzy: Wojtania A. , Pulawska J.

Warianty tytułu

EN

Identification and detection of Xanthomonas hortorum pv. pelargonii in plant material using the PCR method

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Xanthomonas hortorum pv. pelargonii (X. h. pv. pelargonii) jest sprawcą bakteryjnej zarazy pelargonii, zaliczanej do najbardziej szkodliwych chorób pelargonii rabatowych i bluszczolistnych. Z roślin Pelargonium x hortorum z objawami choroby, pochodzących z gospodarstw ogrodniczych zlokalizowanych w województwie dolnośląskim i mazowieckim, wyizolowano bakterie, które tworzyły na pożywce YNA bladożółte, błyszczące, śluzowate kolonie. Wyselekcjonowane 2 izolaty powodowały w teście patogeniczności na roślinach pelargonii typowe objawy zarazy. Podjęto próbę opracowania metody wykrywania X. h. pv. pelargonii w materiale roślinnym z zastosowaniem techniki PCR i pary specyficznych starterów XcpM1, XcpM2. Testowano 2 sposoby przygotowywania próbki i izolacji bakteryjnego DNA. Stwierdzono, że po 2-dniowej preinkubacji wyosobnionych z roślin bakterii na pożywce YNA, wykrycie X. h. pv. pelargonii w różnych częściach rośliny (pędy, ogonki i blaszki liściowe) było możliwe, zarówno gdy DNA izolowano na kolumnach Genomic Mini (A&A Biotechnology), jak i metodą termicznej ekstrakcji.

EN

Xanthomonas hortorum pv. pelargonii (X. h. pv. pelargonii) is the causal agent of bacterial blight on Pelargonium, leading to serious losses in crops of this plants. Bacteria isolated from Pelargonium x hortorum plants with the symptoms of bacterial blight formed cream colony on YNA medium. Two selected isolates were tested for pathogenicity on healthy Pelargonium plants. An attempt was made to work out the method of X. h. pv. pelargonii detection using PCR with specific primer (XcpM1, XcpM2). Two methods of sample preparation and bacterial DNA isolation were tested. It was noted, that after the preincubation of extracted from plant bacteria on YNA medium, the X. h. pv. pelargonii detection was possible in different part of plants (stem, petiole and leaf blade), both when DNA was isolated on Genomie Mini columns and by ineubation at 100°C.

Słowa kluczowe

PL

choroby roslin; bakteryjna zaraza pelargonii; Xanthomonas hortorum pv.pelargonii; bakterie chorobotworcze; wykrywanie; identyfikacja; metody wykrywania; material roslinny; lancuchowa reakcja polimerazy

EN

plant disease; Xanthomonas hortorum pv.pelargonii; pathogenic bacteria; detection; identification; detection method; plant material; polymerase chain reaction

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2010
• Tom: 554
• Opis fizyczny: s.323-329,fot.,bibliogr.

Twórcy

autor

Wojtania A.

• Instytut Sadownictwa i Kwiaciarstwa im.Szczepana Pieniążka, ul.Waryńskiego 14, 96-100 Skierniewice

autor

Pulawska J.

Bibliografia

• Digat В. 1987. Methods for detecting pathogenic bacteria in pelargonium and structure of French phytosanitary certification scheme. EPPO Bull. 17: 281-286.
• Dougherty D.E., Powell C.C., Larsen P.O. 1974. Epidemiology and control of bacterial leaf spot and stem rot of Pelargonium hortorum. Phytopathology 64: 1081-1083.
• Dunbar K.B., Stephens Ch.T. 1989. An in vitro screen for detecting resistance in Pelargonium somaclones to bacterial bliglit of geranium. Plant Disease 73: 910-912.
• Griesbach E., Olbricht K. 2002. Resistance to Xanthomonas hortorum pv. pelargonii in the genus Pelargonium. J. Plant Dis. Protec. 109: 553-568.
• Kennedy W., Pfleger F.L. Denny R. 1987. Bacterial leaf and stem rot of geranium in Minnesota. Plant Disease 71: 821-823.
• Kim S.H., Olson T.N., Schaad N.W., Moorman G.W. 2003. Ralstonia solanacearum race 3, biovar 2, the causal agent of brown rot of potato, identified in geraniums in Pennsylvania, Delaware, and Connecticut. Plant Disease 87: 450.
• Lelliott R. A., Stead D.E. 1987. Methods for the diagnosis of bacterial diseases of plants. Blackwell Scientific Publications for the British Society of Plant Pathology. Orford, UK.
• Llop P., Caruso P., Cubero J., Morente C., Lopez M.M. 1999. A simple extraction procedure for efficient routine detection of pathogenic bacteria in plant material by polymerase chain reation. J. Microbiol. Methods 37: 23-31.
• Lopez M.M., Bertolini E., Olmos A., Caruso P., Gorris M.T., Llop P., Penyalver R., Cambra M. 2003. Innovative tools for detection of plant pathogenic viruses and bacteria. Int. Microbiol. 6: 233-243.
• Łojkowska E. 2001. Diagnostyka molekularna roślin, w: Biotechnologia roślin. S. Malepszy (Red.), PWRiL Warszawa: 462-483.
• Mahuku G.S. 2004. A simple extraction metod suitable for PCR-based analysis of plant, fungal and bacterial DNA. Plant Mol. Biol. Rep. 22: 71-81.
• Manulis S., Chalupowicz L., Dror O., Kleitman F. 2002. Molecular diagnostic procedures for production of pathogen-free propagation material. Pest Manag. Sci. 58: 1126-1131.
• Manulis S., Valinsky L., Lichter A., Gabriel D. 1994. Sensitive and specific detection of Xanthomonas campestris pv. pelargonii with DNA primers and probes identified by random amplified polymorpluc DNA analysis. Appl. Environ. Microbiol. 60: 4094-4099.
• Marco-Noales E., Bertolini, Morente C., Lopez M.M. 2008. Integrated approach for detection of nonculturable cells of Ralstonia solanacearum in asymptomatic Pelargonium spp. cuttings. Phytopathology 98: 949-956.
• Nameth S.T., Daughtrey M.L., Moorman G.W., Sulzinsky M.A. 1999. Bacterial blight of geranium: a history of diagnostic challenges. Plant Disease 83: 204-209.
• Orlikowski L. 1997a. Pelargoniom w Polsce zagrażają choroby. Ogrodnictwo 1: 21-23.
• Orlikowski L. 1997b. Bakteriozy i choroby grzybowe, w: Ochrona pelargonii. L. Orlikowski (Red.), PLANTPRESS, Kraków: 25-42.
• Puławska J., Sobiczewski P. 2005. Development of a semi-nested PCR based method for sensitive detection of tumorigenic Agrobacterium in soil. J. Appl. Microbiol. 98: 710-721.
• Sakthivel N., Mortensen C.N., Mathur S.B. 2001. Detection of Xanthomonas oryzae pv. oryzae in artificially inoculated and naturally infected rice seeds and plants by molecular techniques. Appl. Microbiol. Biotechnol. 56: 435-441.
• Saddler G.S., Bradbury J.F. 2005. Genus I. Xanthomonas, w: Bergeyʼs Manual of Systematic Bacteriology 2. The Proteobacteria, 2nd edn., G. Garrity (Red.): 63-89.
• Schaad N.W., Jones J.B., Chun W. 2001. Laboratoiy guide for identification of plant pathogenic bacteria. Third edition. APS Press, Minnesota, USA.
• Sobiczewski P., Schollenberger M. 2002. Bakteryjna zaraza pelargonii, w: Bakteryjne choroby roślin ogrodniczych. PWRiL Warszawa: 120-122.
• Stephens Ch.T., Tuinier J. 1989. Disease sympthomatology and variation in susceptibility of seed-propagated hybrid geranium varieties to Xanthomonas campestris pv. pelargonii. Plant Disease 73: 559-562.
• Sulzinski M.A., Moorman G.W., Schlagnhaufer B., Romaine C.P. 1996. Characteristics of a PCR-based assay for in planta detection Xanthomonas campestris pv. pelargonii. J. Phytopathol. 144: 393-398.
• Sulzinski M.A., Schlagnhaufer B., Moorman G.W., Romaine C.P. 1998. PCR-based detection of artificial latent infections of geranium by Xanthomonas campestris pv. pelargonii. J. Phytopathol. 146: 111-114.
• Vauterin L., Hoste B., Kersters K. 1995. Reclassification of Xunthomonas. Intern. J. Syst. Bacteriol. 45: 472-489.
• Wojtania A. 2009. Mikrorozmnażanie pelargonii i wykrywanie Xanthomonas hortorum pv. pelargonii. Praca doktorska ISK, Skierniewice: 118 ss.