Utajony wirus oliwki 1 (Olive latent virus 1) z pomidora

• Autorzy: Pospieszny H. , Borodynko N. , Hasiow-Jaroszewska B.

Warianty tytułu

EN

Olive latent virus 1 on tomato

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W roku 2008, z liści pomidora z objawami nekroz, rosnącego w szklarni w województwie wielkopolskim, wyizolowano wirusa, którego oznaczono jako CM1. Wirus posiada cząstki sferyczne o średnicy około 30 nm i genom w postaci jednoniciowego RNA, o wielkości 3700 nukleotydów. Wirus przeniesiony mechanicznie na rośliny testowe porażał szeroki zakres różnych gatunków roślin, na których powodował objawy lokalne z wyjątkiem Nicotiana benthamiana i N occidentalis, które porażał także systemicznie. RT-PCR ze starterami wiążącymi się niespecyficznie do matrycy (ang. random hexamer primers) oraz sekwencjonowanie uzyskanych produktów pozwoliły na wstępną identyfikację utajonego wirusa oliwki 1 (Olive latent virus 1, OLV-1). Na podstawie sekwencji OLV-1 dostępnych w Banku Genów zaprojektowano startery amplifikujące gen kodujący białko płaszcza (CP) wirusa. Porównanie uzyskanych sekwencji CP potwierdziło identyfikację i wykazało istotne różnice pomiędzy izolatami z pomidora a pozostałymi, i tak: podobieństwo z sekwencją izolatu OLV-1 z tulipana wynosiło 92,5%, z izolatem z oliwki 91,8% i z drzewa cytrusowego 89,5%. Jest to zarówno pierwsza identyfikacja OLV-1 w Polsce, jak i stwierdzenie nowego jego gospodarza jakim jest pomidor.

EN

In 2008 an unknown virus from greenhouse (the Wielkopolska region) tomato plants which showed leaf necrosis symptoms was isolated in Poland and designed as CM1. The particles were isometric with a diameter of approximately 30 nm. The viral genome consisted of one ssRNA molecule of about 3700 nucleotides. The virus was propagated on several plant species but the host range and symptoms could not be attributed to any known virus which infects tomato. The RT-PCR with random primers and further sequencing of obtained products revealed homology to Olive latent virus 1. Then, primers for amplification of the coat protein gene were designed using sequences available in the Gen Bank database. Sequence identities of tomato CM1 isolate with these of olive and citrus isolates are 91.8% and 89.5%, respectively. The CM1 isolate shared 92.5% sequence identity with the tulip isolate. It is the first report describing Olive latent virus 1 in Poland and on tomato plants in the world.

Słowa kluczowe

PL

pomidory szklarniowe; rosliny zywicielskie; wirusy; utajony wirus oliwki 1; nekroza lisci; izolaty grzybowe; analiza filogenetyczna; identyfikacja

EN

greenhouse tomato; host plant; virus; leaf necrosis; fungal isolate; phylogenetic analysis; identification

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2010
• Tom: 554
• Opis fizyczny: s.177-182,fot.,bibliogr.

Twórcy

autor

Pospieszny H.

• Zakład Wirusologii i Bakteriologii, Instytut Ochrony Roślin - Państwowy Instytut Badawczy, ul.W.Węgorka 20, 60-318 Poznań

autor

Borodynko N.

autor

Hasiow-Jaroszewska B.

Bibliografia

• Félix M.R., Cardoso Varanda C.M.R., Oliviera S., Clara M.I. 2005. Complete nucleotide sequence of an Olive latent virus 1 isolate from olive trees. Arch. Virol. 150: 2403-2406.
• Félix M.R., Cardoso J.M.S., Oliveira S., Clara M.I. 2007. Biological and Molecular Characterization of Olive latent virus 1. Plant Viruses. Global Science Books: 170-176.
• Félix M.R., Clara M.I. 1998. Caracterissticas biológicas e bioquimicas da estirpe G1, do Necrovirus Olive Latent 1 isolado de Olea europaea L. Actas da 2a Reuniăo Bienal da Sociedade Portuguesa de Fitopatologia: 67.
• Gallitelli D., Savino V. 1985. Olive latent virus 1, an isometric virus with a single RNA species isolated from olive in Apulia, Southern Italy. Ann. Appl. Biol. 106: 295-303.
• Grieco F., Savino V., Martelli G.P. 1996. Nucleotide sequence of the genome of a citrus isolate of olive latent virus 1. Arch. Virol. 141: 825-838.
• Hall T.A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series 41: 95-98.
• Kanematsu S., Taga Y., Morikawa T. 2001. Isolation of Olive latent virus 1 from Tulip in Toyama Prefecture. J. Gen. Plant Pathol. 67: 333-334.
• Kumar S., Tamura K., Nei M. 2004. MEGA3: Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and sequence alignment. Brief Bioinform 5: 150-163.
• Martelli G.P., Sabanadzovic S., Savino V., Abu-Zurayk A.R., Masannat M. 1995. Virus-like diseases and viruses of olive in Jordan. Phytopathol Mediterr 34: 133-136.
• Martelli G.P., Yilmaz M.A., Savino V., Baloglu S., Grieco F., Güldür M.E., Greco N., Lafortezza R. 1996. Properties of a citrus isolate of olive latent virus 1, a new necrovirus. Eur. J. Plant Pathol. 102: 527-536.
• Van Regenmortel M.H.V., Fauquet C.M., Bishop D.H.L., Carstens E.B., Estes M.K., Lemon S.M., Maniloff J., Mayo M.A., Mcgeoch D.J., Pringle C.R., Wickner R.B. 2000. Virus Taxonomy. Academic Press, San Diego, California, USA: 1162 ss.
• Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. 1989. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York.