EN
Calpastatin (CAST) is a specific inhibitor of the ubiquitous calcium-dependent proteases – μ-calpain and m-calpain, found in mammalian tissues. The level of components included into the calpain-calpastatin system determine the rate of post mortem tenderization of meat.In the coding region of the bovine CAST gene (CAST) the new nucleotide sequence polymorphism was found being a substitution G→C at position 61 nt within the exon 1C (consensus sequence – GenBank AF117813). This sequence fragment of SNP position has already been deposited in the GenBank database under accession no. AY258325. Consensus of bovine CAST sequence with that of human (GenBank M86257 and M28230) revealed that G→C substitution was located at position 1460 nt of exon 12. Computer analysis of the mutation showed the Ser→Thr substitution at position 20 of amino acid sequence of CAST protein. The mutation creates a new AluI restriction site and,therefore, can be easily detected with PCR-RFLP.The CAST RFLP-AluI polymorphism was studied in 138 bulls of seven breeds, including the native Polish Red (PR, preserved), and Polish Black-and-White (BW) breed. The frequency of alleles C and G varied between the breeds considered, the mean reaching 0.69 and 0.31, respectively. No homozygous genotype GG was found in Red Angus, Charolaise and Hereford bulls.
PL
Opisano nowy polimorfizm w eksonie 1C genu CAST bydła. Polimorfizm analizowano metodą PCRSSCP,a następnie poddawano sekwencjonowaniu próbki DNA odbiegające od siebie wzorcem SSCP.Analiza sekwencyjna wykazała istnienie SNP polegającego na transwersji G→C w pozycji 61 nt (GenBank nr. AF117813). Substytucja ta znajduje się w kodonie seryny (AGC) i wywołuje zamianę na kodon treoniny (ACC). Mutację można rozpoznać metodą RFLP stosując enzym restrykcyjny AluI. W grupie 138 opasanych buhajów siedmiu ras stwierdzono występowanie dwóch alleli – C i G – i trzech genotypów – CC, GC i GG. Genotyp GG nie występował u buhajów angus, charolaise i hereford. Częstość występowania alleli C i G wynosiła odpowiednio 0,69 i 0,31.Związek między polimorfizmem genu CAST a jakością wołowiny (mięsień najdłuższy grzbietu) badano na 84 buhajach rasy cb. Mięso zwierząt o genotypie GC okazało się najmniej wartościowe pod względem kulinarnym. Charakteryzowało się ono większym wyciekiem termicznym niż stwierdzony w mięsie buhajów CC (P<0,05) i GG (P<0,01). Mięso buhajów GC było ciemniejsze (P<0,01) niż mięso zwierząt o genotypie GG. Ogólna zawartość barwników hemowych oznaczona metodą Hornsey’a była najwyższa w mięsie buhajów o genotypie GC i różniła się (P<0.05) od stwierdzonej w mięsie zwierząt CC. Wnioskuje się, że CAST można traktować jako gen kandydujący na marker jakości wołowiny