PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
2001 | 48 | 1 |

Tytuł artykułu

Molecular docking-based test for affinities of two ligands toward vasopressin and oxytocin receptors

Warianty tytułu

Języki publikacji

EN

Abstrakty

EN
Molecular docking simulations are now fast developing area of research. In this work we describe an effective procedure of preparation of the receptor-ligand complexes. The amino-acid residues involved in ligand binding were identified and described.

Wydawca

-

Rocznik

Tom

48

Numer

1

Opis fizyczny

p.131-135,fig.

Twórcy

autor
  • University of Gdansk, J.Sobieskiego 18, 80-952 Gdansk, Poland
autor
autor

Bibliografia

  • 1.Kirkpatrick, S., Gelate, C.D., Jr. & Vecchi, M.P. (1983) Optimization by simulated annealing. Science 220, 671-680.
  • 2.Cambridge Structural Database System. Cambridge Crystallographic Data Centre, Cambridge, U.K.
  • 3.Pogozheva, I.D., Lomize, A.L. & Mosberg, H.I. (1998) Opioid receptor three-dimensional structures from distance geometry calculations with hydrogen bonding constraints. Biophys. J. 75, 612-634.
  • 4.SYBYL v. 6.1 (1994) Tripos Inc., St. Louis, MO, U.S.A.
  • 5.Palczewski, K., Kumasaka, T., Hori, T., Behnke, C.A., Motoshima, H., Fox, B.A., Le Trong, I., Teller, D.C., Okada, T., Stenkamp, R.E., Yamamoto, M. & Miyamoto, M. (2000) Crystal structure of rhodopsin: A G protein-coupled receptor. Science 289, 739-745.
  • 6.AMBER 5.0(2000) Pearlman, D.A., Case, D.A., Caldwell, J.W., Cheatham, III, T.E., Ross, W.S., Simmerling, C., Darden, T., Merz, K.M., Stanton, R.V., Cheng, A., Vincent, J.J., Crowley, M., Ferguson, D.M., Radmer, R., Seibel, G.L., Singh, U.C., Weiner, P. & Kollman, P.A., University of California, San Francisco.
  • 7.GAMESS 98(1993) Schmidt, M.W., Baldridge, K.K., Boatz, J.A., Elbert, S.T., Gordon, M.S, Jensen, J.H., Koseki, S., Matsunaga, N., Nguyen, K.A., Su, S., Windus, T.L., Dupuis, M. & Montgomery, J.A. J. Comput. Chem. 14, 1347-1363.
  • 8.Morris, G.M., Goodsell, D.S., Halliday, R.S., Huey, R., Hart, W.E., Belew, R.K. & Olson, A.J. (1998) Automated docking using a Lamarckian genetic algorithm and empirical binding free energy function. J. Comput. Chem. 19, 1639-1662.
  • 9.Solis, F.J. & Wets, R.J.-B. (1981) Minimization by random search techniques. Mathematical Operations Res. 6, 19-30.

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikatory

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.agro-article-bf1b467d-64ea-4775-b829-f234a8e502c0
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.