PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
2004 | 51 | 1 |

Tytuł artykułu

Conformational investigation of alpha,beta-dehydropeptides. XIII. Conformational properties of N-acetyl-alpha,beta-dehydrovaline N',N'-dimethylamide

Warianty tytułu

Języki publikacji

EN

Abstrakty

EN
The crystal structure of Ac-ΔVal-NMe2 (ΔVal = a,β-dehydrovaline) was determined by X-ray crystallography. The found angles φ = -60o and Ψ = 125° correspond exactly to the respective values of the (i + 1)th residue in idealised yS-turn II/VIa. Ab in­itio/DFT studies revealed that the molecule adopts the angle Ψ restricted only to about |130° | and very readily attains the angle φ about -50°. This is in line with its solid-state conformation. Taken together, these data suggest that the ΔVal residue combined with a C-terminal tertiary amide is a good candidate at the (i + 1)th posi­tion in a type II/VIa β-turn.

Wydawca

-

Rocznik

Tom

51

Numer

1

Opis fizyczny

p.145-152,fig.,ref.

Twórcy

autor
  • University of Opole, Oleska 48, 45-052 Opole, Poland
autor
autor

Bibliografia

  • Allen FH, Baalham CA, Lommerse JPM, Raithby PR. (1998) Acta Cryst.; B54: 320-9. Ciszak E, Pietrzynski G, Rzeszotarska B. (1992) Int J Pept Protein Res.; 39: 218-22.
  • El-Masdouri L, Aubry A, Boussard G, Marraud M. (1992) Int J Pept Protein Res.; 40: 482-6; Erratum, ibid.; 41: 612.
  • Frisch MJ etal. (1998) Gaussian 98. Revision A.3. Gaussian Inc., Pittsburgh.
  • Head-Gordon T, Head-Gordon M, Frisch MJ, Brooks III ChL, Pople JA. (1991) J Am Chem Soc.; 113: 5989-97.
  • Herzberg O, Moult J. (1991) Proteins.; 11: 223-9.
  • Kim K, Friesner RA. (1997) J Am Chem Soc.; 119: 12952-61.
  • MacArthur MW, Thornton JM. (1996) J Mol Biol.; 264: 1180-95.
  • Maccallum PH, Poet R, Milner-White EJ. (1995) J Mol Biol.; 248: 374-84.
  • Makker J, Dey S, Mukherjee S, Vijayaraghavan R, Kumar P, Singh TP. (2003) J Mol Struct.; 654: 119-24.
  • Ramachandran GN, Sasisekharan V. (1968) AdvProtein Chem.; 23: 283-437.
  • Richardson JS. (1981) Adv Protein Chem.; 34: 167-339.
  • Rose GD, Gierasch LM, Smith JA. (1985) Adv Protein Chem.; 37: 1-109.
  • Rzeszotarska B, Siodlak D, Broda MA, Koziol AE, Dybala I. (2002) J Pept Res.; 59: 79-89.
  • Sheldrick GM. (1997a) SHELXS-97: Program for Structure Solution. University of Gottingen, Gottingen, Germany.
  • Sheldrick GM. (1997b) SHELXL-97: Program for the Refinement of Crystal Structures from Diffraction Data. University of Gottingen, Gottingen, Germany.
  • Singh TP, Kaur P. (1996) Prog Biophys Mol Biol.; 66: 141-65.
  • Siodlak D, Broda MA, Rzeszotarska B, Koziol AE, Dybala I. (2001) Acta Biochim Polon.; 48: 1179-83.
  • Siodlak D, Broda MA, Rzeszotarska B, Dybala I, Koziol AE. (2003) J Pept Sci.; 9: 64-74.
  • Siodlak D, Broda MA, Rzeszotarska B. (2004a) J Mol Struct (Theochem).; 668: 75-85.
  • Siodlak D, Broda MA, Rzeszotarska B, Kolodziejczyk E, Koziol AE. (2004b) Z Kristallogr.; in press.
  • Smelka L, Rzeszotarska B, Broda MA, Kubica Z. (1997) Org Prep Proced Int.; 29: 696-701.
  • Steiner T. (2002) Angew Chem Int Ed Engl. ; 41: 49-76.
  • Thormann M, Hofmann H-J. (1998) J Mol Stru.ct(Theochem).; 431: 79-96.
  • Vargas R, Garza J, Friesner RA, Stern H, Hay BP, Dixon DA. (2000) J Am Chem Soc.; 122: 4750-5. Vargas R, Garza J, Friesner RA, Stern H, Hay BP, Dixon DA. (2001) JPhys Chem A.; 105: 4963-8. Venkatraman J, Shankaramma SC, Balaram P. (2001) Chem Rev.; 101: 3131-52. Vijayaraghavan R, Kumar P, Dey S, Singh TP. (2001) Acta Crystallogr C.; 57: 1220-1. Winkler FK, Dunitz JD. (1971) J Mol Biol.; 59: 169-82.
  • Zimmerman SS, Pottle MS, Nemethy G, Scheraga HA. (1977) Macromolecules.; 10: 1-9.

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikatory

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.agro-article-615721b9-386e-44bc-9674-5bc4bf238d07
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.