Mapowanie genomu lubinu waskolistnego [Lupinus angustifolius L.] z wykorzystaniem markerow STS z Medicago trancatula GAERTN. i Pisum sativum L.

• Autorzy: Chudy M , Lesniewska K , Swiecicki W , Wolko B , Pawlowicz I , Gawlowska M , Boersma J G

Warianty tytułu

EN

Mapping of the narrow-leafed lupin [Lupinus angustifolius L.] genome using STS markers designed for Medicago trancatula GAERTN. and Pisum sativum L.

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W pracy opisano mapowanie genetyczne markerów zdefiniowanych sekwencyjnie, zaprojektowanych dla rośliny modelowej Medicago truncatula Gaertn. u gatunku uprawnego łubinu (Lupinus angustifolius L.). Prace te są częścią Projektu Europejskiego realizowanego w ramach 6. Programu Ramowego Unii Europejskiej „Grain Legumes Integrated Project” (GLIP). Populację mapującą stanowiło 89 linii wsobnych kombinacji krzyżówkowej 83A:476 (linia hodowlana) x P27255 (typ dziki). Markery STS wygenerowano za pomocą reakcji PCR, przy użyciu starterów zaprojektowanych w oparciu o bazy danych sekwencyjnych M. truncatula i P sativum. Przetestowano 257 par starterów dostarczonych przez partnera projektu GLIP. Większość starterów amplifikowała produkt monomorficzny. W przypadku 29 wykrytych produktów polimorficznych segregacja alleli mogła być przetestowana na całej populacji mapującej. Do chwili obecnej 22 markery STS zostały zlokalizowane na mapie sprzężeń opartej o markery MFLP, opracowanej przez grupę australijską. Pozycja pozostałych 6 markerów nie została jeszcze ustalona. Wzbogacenie opublikowanej mapy o markery STS zwiększyło jej długość do 1953 cM, a średnią odległość pomiędzy markerami do 4,14 cM.

EN

The aim of this research is a genetic mapping of the STS markers derived from a model legume Medicago truncatula Gaertn. in lupin crop (Lupinus angustifolius L.). This study was undertaken within the framework of VI EU „Grain Legumes Integrated Project” (GLIP). The mapping population consists of 89 recombinant inbred lines of a cross between a domesticated line and a wild type (83A:476 x P27255). STS markers were generated by the PCR, using primer pairs designed on the basis of M. truncatula and P. sativum genomic sequences. Up till now 257 primer pairs designed and delivered by the Hungarian partner of the project have been tested. Most of the primers amplified a monomorphic product. In the case of 29 detected polimorphic products, segregation of alleles could be analyzed in the whole mapping population. 22 of these markers were located on the genetic linkage map based on the MFLP markers constructed by the Australian group. The position of the remaining 6 markers is still uncertain. Supplementing the published map with the STS markers increased its length to 1953 cM and the average marker distance into 4.1 cM.

Słowa kluczowe

PL

mapowanie genomu; Medicago truncatula; Lupinus angustifolius; Pisum sativum; technika STS; genetyka roslin; mapowanie porownawcze; lubin waskolistny

EN

genome mapping; Medicago truncatula; Lupinus angustifolius; Pisum sativum; STS marker; plant genetics; comparative mapping; narrow-leaved lupin

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2007
• Tom: 517
• Numer: 1
• Opis fizyczny: s.215-223,rys.,tab.,bibliogr.

Twórcy

autor

Chudy M

• Instytut Genetyki Roslin PAN, ul.Strzeszynska 34, 60-479 Poznan

autor

Lesniewska K

• Instytut Genetyki Roslin PAN, ul.Strzeszynska 34, 60-479 Poznan

autor

Swiecicki W

• Instytut Genetyki Roslin PAN, ul.Strzeszynska 34, 60-479 Poznan

autor

Wolko B

• Instytut Genetyki Roslin PAN, ul.Strzeszynska 34, 60-479 Poznan

autor

Pawlowicz I

• Instytut Genetyki Roslin PAN, ul.Strzeszynska 34, 60-479 Poznan

autor

Gawlowska M

• Instytut Genetyki Roslin PAN, ul.Strzeszynska 34, 60-479 Poznan

autor

Boersma J G

• Ministerstwo Rolnictwa Zachodniej Australii, Perth

Bibliografia

• Boersma J.G, Pallotta M., Li C., Buirchell B.J., Sivasithamparam K., Yang H. 2005. Construction of a genetic linkage map using MFLP and identification of molecular markers linked to domestication genes in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.). Cell Molecular Biological Letters 10(2): 331-44.
• Choi H.K., Mun J.H., Kim D.J., Zhu H., Baek J.M., Mudge J., Roe B., Ellis N., Doyle J., Kiss GB., Young N.D., Cook R.D. 2004. Estimating genome conservation between crop and model legume species. Proc Natl Acad Sci USA 101(43): 15289-15294.
• Eujayl I., Baum M., Powell W., Erskine W., Pehu E. 1998. A genetic linkage map of lentil (Lens sp.) based on RAPD and AFLP markers using recombinant inbred lines. Theor. Appl. Genet. 97: 83-89.
• Jones C.J., Edwards K.J., Castaglioni S., Winfield M.O., Sala F., van de Wiel C., Bredemeijer G, Vosman B., Matflies M., Daly A., Brettschneider R., Bettini P., Buiatti M., Maestri E., Malcevschi A., Marmiroli N., Aert R., Volckaert G., Rueda Linacero R., Vazquex A., Karp A. 1997. Reproducibility testing of RAPD, AFLP and SSR markers in plants by a network of European laboratories. Molecular Breeding 3: 381-390.
• Knox M., Ellis T. 2001. Stability and inheritance of methylation states at Pst I sites in Pisum. Mol. Genet. Genomics 265: 497-507.
• Knox M., Ellis T. 2002. Excess Heterozygosity Contributes to Genetic Map Expansion in Pea Recombinant Inbred Populations. Genetics 162: 861-871.
• Lewis G., Schrire B., Mackinder B., Lock M. 2005. Legumes of the World. The Royal Botanic Gardens, Kew: 16-19.
• Phan H.T., Ellwood S.R., Ford R., Thomas S., Oliver R. 2006. Differences in syntenic complexity between Medicago truncatula with Lens culinaris and Lupinus albus. Functional Plant Biology 33: 775-782.
• Puchalski T. 1973. Wnioskowanie statystyczne. PWN, Warszawa: 346 ss.
• Saliba-Colombani V., Causse M., Gervais L., Philouze J. 2000. Efficiency of RFLP, RAPD, AFLP markers for the construction of an intraspecific map of tomato genome. Genome 43: 29-40.
• Staub J.E., Serquen F.C., Gupta M. 1996. Genetic markers, map construction and their application in plant breeding. Hort Science 31(5): 729-740.
• Zhu H., Choi H. K., Cook D.R., Shoemaker R.C. 2005. Bridging model and crop legumes through comparative genomics. Plant Physiology 137(4): 1189-96.