Molekularna charakterystyka fitoplazm porazajacych roze w Polsce

• Autorzy: Sliwa H , Malinowski T. , Kaminska M.

Warianty tytułu

EN

Molecular characterisation of phytoplasmas infecting roses in Poland

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Na naturalnie porażonych różach odm. Frisco i Suela w uprawie pod osłonami obserwowano chlorozę a następnie żółknięcie liści oraz zamieranie pędów. Obecność fitoplazm w różach wykazano stosując łańcuchową reakcję polimeryzacji (PCR) z wykorzystaniem starterów R16F1/R0 i P1/P7 w pierwszej rundzie PCR oraz starterów R16F2n/R2, R16(I)F1/R1, fA/rA, Pc399/P1694, Pl/fArev w drugiej rundzie PCR. Trawienie enzymatyczne produktów amplifikacji (otrzymanych przy użyciu pary starterów R16F2n/R2) wykonano stosując restryktazy AluI, MseI, HpaII i RsaI. Otrzymany wzór restrykcyjny był taki sam dla wszystkich PCR-pozytywnych prób z róż. Wzór ten był identyczny z profilem otrzymanym dla izolatu wzorcowego AY1 - fitoplazmy z grupy żółtaczki astra (16SrI). Produkty drugiej rundy PCR z róż 'Suela' i 'Frisco' sekwencjonowano z obu nici DNA. Analiza otrzymanych sekwencji potwierdziła, że obie odmiany róż porażone były tą samą fitoplazmą, należącą do fitoplazm z pierwszej grupy, podgrupy B.

EN

Symptoms of shoot dieback and leaf yellowing followed by leaf chlorosis were observed in naturally infected roses 'Frisco' and 'Suela', cultivated in a commercial greenhouse in Poland. The presence of phytoplasma was demonstrated in affected plants by nested polymerase chain reaction (PCR) with R16Fl/RO and Pl/p7 primer pairs in the first round followed by a second one with RI6F2n/R2, fNrA, Pc399/p1694, R16(1)Fl/Rl and PllfArev primer pairs. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of PCR products (primed with primers R16F2n/R2) was done using enzymes Alul, Msel, Rsal and HpaII. Restriction profiles obtained with these enzymes were identical to those of reference strain AYl belonging to aster yellows phytoplasma group, subgroup l-B (16SrI-B). Nested PCR products from roses 'Frisco' and 'Suela' were sequenced. Analysis of sequences confirmed that the phytoplasma infecting those roses could be classified to aster yellows phytoplasma group, subgroup B.

Słowa kluczowe

PL

sekwencjonowanie; roze; choroby roslin; czynniki chorobotworcze; fitoplazmy; amplifikacja; charakterystyka molekularna; krzewy ozdobne; metoda PCR-RFLP; produkty amplifikacji; identyfikacja

EN

sequencing; rose; plant disease; pathogenic factor; phytoplasma; amplification; molecular characteristics; ornamental shrub; PCR-RFLP method; amplification product; identification

• Wydawca: -
• Czasopismo: Acta Agrobotanica
• Rocznik: 2002
• Tom: 55
• Numer: 1
• Opis fizyczny: s.325-334,fot.,bibliogr.

Twórcy

autor

Sliwa H

• Instytut Sadownictwa i Kwiaciarstwa, ul.Pomologiczna 18, 96-100 Skierniewice

autor

Malinowski T.

autor

Kaminska M.

Bibliografia

• Ahrens U., Seemüller E., 1982. Detection of DNA of plant pathogenic mycoplasma- like organisms by a polymerase chain reaction that amplifies a sequence of that 16SrRNA gene. Phytopathology 82: 828-832.
• Alma A., Davis R.E., Danielli A., Bosco D., Arzone A., 1966. Mixed infection of grapevines in Northern Italy by phytoplasmas including 16S rRNA RFLP subgroup 16SrI-B strains previously unreported in this host. Plant Dis. 80 (4): 418-421.
• Bos L.F., Perquin W., 1975. Rose bud proliferation, a disorder of still unknown etiology. Neth. J. Plant Pathol. 81: 187-198.
• Davis R.E., Lee I.-M., 1993. Cluster-specific polymerase chain reaction amplification of 16S rDNA sequences for detection and identification of mycoplasmalike organisms. Phytopathology 83 (9): 1008-1011.
• Devergne J.C., Coujon C., 1975. Ètude d'anomalies de croissance chez le rosier de serre. Ann. Phytopathol. 7: 71-79.
• Fry P.R., Hammett K.R.W., 1971. Rose wilt virus in New Zealand. J. Agric. Res. 14: 735-743.
• Grieve B.J., 1931. Rose wilt and dieback. A virus disease occuring in Australia. Aust. J. Exp. Biol. Med. Sci. 8: 107-121.
• Gromadka R., 1995. Szybka izolacja DNA z agarozy. W: Inżynieria genetyczna i biologia molekularna. Metody. Podręcznik laboratoryjny IBB PAN, Instytut Biochemii i Biofizyki PAN, Warszawa, 1995: 6-7.
• Gundersen D.E., Lee I.-M., Schaff D.A., Harrison N.A., Chang C.J., Davis R.E., Kingsbury D.T., 1996. Genomic diversity and differentiation anong phytoplasma strain in 16S rRNA gruops I (aster yellows and related phytoplasmas) and III (X-disease and related phytoplasmas). Int. J. Syst. Bacteriol. 46: 64-75.
• Jomantiene R., Davis R.E., Maas J., Dally E.L., 1998. Classification of new phytoplasma associated with diseases of strawberry in Florida, based on analysis of 16S rRNA and riB o somal protein gen operon sequences. Int. J. Syst. Bacteriol. 48: 269-277.
• Kamińska M., Dziekanowska D., 2001. Występowanie, wykrywanie i identyfikacja choroby degeneracji róży. Rocz. AR Pozn. CCCXXIII, Ogrodn. 31 (I): 71-77.
• Kamińska M., Dziekanowska D., Rudzińska-Langwald A., 2001. Detection of phytoplasma infection in rose, with degeneration symtoms. J. Phytopathology 148: 1-10.
• Kamińska M., Korbin M., 1999. The incidence of phytoplasma and symptom expression of stunt and flower bud deficiency disease in lilies over two years. Phytopathol. Pol. 18: 27-36.
• Kamińska M., Korbin M., Rudzińska-Langwald A., 1999. Occurrence and identification of aster yellows related phytoplasma in annual statice in Poland. Phytopathol. Pol. 18: 37-45.
• Kamińska M., Śliwa H., Rudzińska-Langwald A., 2001. The association of phytoplasma with stunting, leaf necrosis and witches' broom symptoms in magnolia plants. J. Phytopathology 149: 719-724.
• Keane G., Edwards A., Clark M.F., 1996. Differentiation of group 16SrI-B aster yellows phytoplasma with monoclonal antibodies. W: 1966 BCPC Symposium Proceedings. Diagnostic in crop production 65: 263-268.
• Lee I.-M., Davis R.E., Chen T.A., Chiykowski L.N., Fletcher J., Hiruki C., Scaff D.A., 1992. A genotype-based system for identification and classification of mycoplasmalike organisms (MLOs) in the aster yellows MLO strain cluster. Phytopathology 82 (9): 977-985.
• Lee I.-M., Gundersen-Rindal D.E., Davis R.E., Bartoszyk I.M., 1998. Revised classification scheme of phytoplasmas based on RFLP analyses of 16S rRNA and riB o somal protein gene sequences. Int. J. Syst. Bacteriol. 48:1153-1169.
• Lee I.-M., Gundersen D.E., Hammond R.W., Davis R.E., 1994. Use of mycoplasmalike organism (MLO) group-specific oligonucleotide primers for nested- PCR assays to detect mixed-MLO infections in a single host plant. Phytopathology 84: 559-566.
• Marcone G., Ragozzino A., 1996. Detection of an elm yellows-related phytoplasma in eucalyptus trees affected by little-leaf disease in Italy. Plant Dis. 80 (6): 669-673.
• Namba S., Oyaizu H., Kato S., Iwanami S., Tsuchizaki T., 1993. Phylogenetic diversity of phytopathogenic mycoplasmalike organisms. Int. J. Syst. Bacteriol. 43 (3): 461-467.
• Schneider B., Seemüller E., Smart C.D., Kirkpatrick B.C., 1995. Phylogenetic classification of plant pathogenic mycoplasmalike organisms or phytoplasmas. W: Molecular and Diagnostic Procedures in Mycoplasmology, vol.1: 369-380. San Diego: Academic Press.
• Seemüller E., Marcone G, Lauer U., Ragozzino A., Göschl M., 1998. Current status of molecular classification of the phytoplasmas. J. Plant Pathol. 80: 3-26.
• Skrzeczkowski L.J., Howell W.E., Eastwell K.C., 2001. Bacterial sequences interfering in detection of phytoplasma by PCR using primers derived from the riB o somal RNA operon. Acta Hort. 550: 417-424.
• Slack S.A., Traylor J.A., Williams H.E., Nyland G., 1976. Rose leaf curl, a distinct component of a disease complex which resembles roes wilt. Plant. Dis. Reptr. 60: 178-182.
• Śliwa H., Malinowski T., Kamińska M., 2001. Zastosowanie techniki PCR do identyfikacji fitoplazm w róży z objawami kędzierzawki liści w Polsce. Folia Horticulturae 13/1A: 161-167.
• Thomas B.J., 1979. Some degeneration and dieback diseases of the rose. Ann. Report Glasshouse Crops Res. Ins. 1979: 178-190.