PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
2005 | 504 | 2 |
Tytuł artykułu

Zastosowanie analizy PCR-RFLP do wykrywania i identyfikacji fitoplazm w roślinach ozdobnych

Autorzy
Treść / Zawartość
Warianty tytułu
Języki publikacji
PL
Abstrakty
PL
Rośliny ozdobne - tulipan, lilia, dalia i serduszka okazała (Dicentra spectabilis) - ze zmianami w zabarwieniu i deformacją liści i kwiatów, zaburzeniami w kwitnieniu i zamieraniem pąków kwiatowych oraz nadmiernym wybijaniem pędów bocznych, zostały przetestowane na obecność fitoplazm przy pomocy analizy PCR-RFLP. Do wykrywania fitoplazm zastosowano dwuetapową reakcję PCR - do pierwszego etapu użyto parę starterów uniwersalnych dla fitoplazm (P1/P7) a do drugiego trzy pary starterów uniwersalnych (R16F2n-R16R2, fA-rA, Pc399-P1694) oraz startery specyficzne dla fitoplazm z grupy żółtaczki astra (R16IF1-R16IR1) i proliferacji jabłoni (fAT-rAS). Identyfikację fitoplazm przeprowadzono na pod­stawie wyników analizy restrykcyjnej wykonanej przy użyciu sześciu enzymów (Hpall, Rsal, Alul, MseI, Sspl, oraz Hhal). Na postawie analizy PCR-RFLP w testowanych roślinach stwierdzono obec­ność dwóch grup fitoplazm. W tulipanach, serduszkach okazałych i jednej odmianie lilii wykryto fitoplazmy z grupy żółtaczki astra (AY, 16SrI), przy czym w serduszkach okazałych stwierdzono obecność fitoplazm z dwóch podgrup: I-B lub I- A, natomiast w lilii wykryto fitoplazmę z podgrupy I-A. Fitoplazmę z grupy proli­feracji jabłoni (AP, 16SrX) wykryto w jednej odmianie lilii, natomiast w bada­nych daliach stwierdzono obecność mieszaniny fitoplazm AY i AP.
EN
Diseased ornamental plants - tulips, lilies, dahlias and bleeding hearts (Di- centra spectabilis) - with symptoms of flower and leaf discolouration and malformation, flower bud deficiency and abnormal shoot production were tested for the presence of phytoplasmas using PCR-RFLP assay. Phytoplasmas were detected by two-step PCR assay. The first round was done using P1-P7 primer set, universal for phytoplasmas. The nested PCRs were done with universal (R16F2n-R16R2, fA-rA, Pc399-P1694) and aster yellows group-specific (R16IF1-R16IR1) or apple proliferation group-specific (fAT-rAS) primer pairs. Identification of phytoplasmas was accomplished through RFLP analysis using Hpall, Rsa\,Alu\, MseI, Sspl, or Hha\ endonucleases. On the basis of PCR-RFLP analysis, two different phytoplasma groups were identified in tested plants. Phytoplasmas belonging to the subgroup I-B or I-A of aster yellows group (AY, 16SrI) were found in samples collected from tulips, bleeding hearts and one lily cultivar. One lily cultivar was infected with phytoplasma from apple proliferation group (AP, 16SrX), whereas mix of two different phytoplasmas - belonging to AY and AP groups - were detected in the tested dahlias.
Słowa kluczowe
Wydawca
-
Rocznik
Tom
504
Numer
2
Opis fizyczny
s.705-711,fot.,bibliogr.
Twórcy
autor
  • Katedra Roślin Ozdobnych Akademia Rolnicza im. H. Kołłątaja al. 29 Listopada 54 31-425 KRAKÓW
autor
  • Katedra Roślin Ozdobnych Akademia Rolnicza im. H. Kołłątaja al. 29 Listopada 54 31-425 KRAKÓW
Bibliografia
  • Ahrens U., Seemuller E. 1992. Detection of plant pathogenic mycoplasmalike orga­nisms by a polymerase chain reaction that amplifies a sequence of the 16S rRNA gene. Phytopathology 82: 828-832.
  • Gundersen D. E., Lee I.-M. 1996. Ultrasensitive detection of phytoplasmas by nested -PCR assay using two universal pńmer pairs. Phytopath. Medit. 35: 144-151.
  • Kamińska M. 2000. Choroby fitoplazmatyczne roślin ozdobnych w Polsce. Zesz. Nauk. Inst. Sadown. i Kwiaciarstwa 7: 79-86.
  • Kamińska M., Korbin M. 2000. Phytoplasma infection in Lilium sp. plants. Phytopa- thol. Pol. 20: 45-57.
  • Kamińska M., Rudzińska-Langwald A., Korbin M. 1999. Occurrence and identifica­tion of aster yellows related phytoplasma in Gladiolus in Poland. Acta Physiol. Plant. 21: 419-425.
  • Kamińska M., Śliwa H. 2002. Molecular evidence for phytoplasma infection in tulip plants. Phytopathol. Pol. 24: 47-56.
  • Kamińska M., Śliwa H. 2003. Effect of antibiotics on the symptoms of stunting disease of Magnolia liliiflora plants. J. Phytopathol. 151: 59-63.
  • Kamińska M., Śliwa H. 2004. First report of phytoplasma belonging to apple prolifera­tion group in roses in Poland. Plant Dis. 88: 1283.
  • Kamińska M., Śliwa H., Startek L. 2001. First report of phytoplasma infection in free- sia plant. Plant Dis. 85: 336.
  • Kamińska M., Zawadzka В. 1970. Badania nad proliferacją (miotlastością) jabłoni w Polsce. II. Wyniki badań nad szkodliwością proliferacji jabłoni. Acta Agrobot. 23: 341-351.
  • Lee I.-M. 1999. Molecular-based methods for the detection and identification of phy­toplasmas. First Internet Conference on Plant Pathogenic Mollicutes. http/www.uniud.it/phytoplasma.
  • Lee I.-M., Gundersen-Rindal D.E., Davis R.E., Bartoszyk I.M. 1998. Revised classifi­cation scheme of phytoplasma based on RFLP analyses of 16S rRNA and ribosomal protein gene sequences. Int. J. Syst. Bacteriol. 48: 1153-1169.
  • Lee I.-M., Gundersen D.E., Hammond R.W., Davis R.E. 1994. Use of mycoplasmalike organisms (MLO) group-specific oligonucleotide primers for nested-PCR assays to detect mixed-MLO infections in a single host plants. Phytopathology 84: 559-566.
  • Malinowski т., Żandarski J., Komorowska В., Zawadzka В. 1996. Application of DAPI staining and PCR amplification of DNA for identification of pear decline phy- toplasma in declining trees in Poland. Phytopathol. Pol. 12: 103-110.
  • Skrzeczkowski LJ., Howell W.E., Eastwell K.C. 2001. Bacterial sequences interfe­ring in detection of phytoplasmas by PCR using primers derived from the ribosomal RNA operon. Acta Hort. 550: 417-424.
  • Schneider В., Seemuller E., Smart C.D., Kirkpatrick B.C. 1995. Phylogenetic classifi­cation of plant pathogenic mycoplasmalike organisms or phytoplasmas, w: Molecular and diagnostic procedures in mycoplasmology. Academic Press, San Diego, t. I: 369-380.
  • Seemuller E., Marcone C., Lauer U., Ragozzino A., Goschl M. 1998. Current status of molecular classification of the phytoplasmas. J. Plant Pathol. 80: 3-26.
  • Smatr C.D., Schneider В., Blomquist C.L., Guerra L.J., Harrison N.A., Ahrens U., Lorenz K.-H., Seemuller E., Kirkpatrick B.C. 1996. Phytoplasma-specific PCR pri­mers based on sequences of the 16S-23S rRNA spacer region. Appl. Environ. Microbiol. 62: 2988-2993.
  • Śliwa H., Kamińska M. 2004. Experimental transmission of phytoplasmas from dis­eased magnolias to Catharanthus roseus test plants by grafting. Phytopathol. Pol. 32: 21-31.
Typ dokumentu
Bibliografia
Identyfikatory
Identyfikator YADDA
bwmeta1.element.agro-9b28d5ce-1099-423e-a05e-4edddb0056b4
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.