Analysis of CAG/AAG polymorphism incidence at codon 171 of the ovine prion protein gene

• Autorzy: Markowska A. , Wisniewska E. , Szkudlarek-Kowalczyk M. , Mroczkowski S.

Warianty tytułu

PL

Badanie obecności polimorfizmu CAG/AAG w kodonie 171 genu białka prionowego owiec

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

The ovine PRNP gene is responsible for the production of cell prion protein and its polymorphism significantly affects the sheep susceptibility/resistance to scrapie. The aim of the study presented herein was to detect variation (CAG/AAG) occurring at codon 171 of the ovine prion protein gene. The test covered 241 animals from the following sheep breeds: Polish Merino, Blackheaded Mutton Sheep, Polish Mountain Sheep, Ile de France, Berrichon du Cher and Suffolk. The test itself was conducted with the application of the PCR-RFLP method and with the use of the MboI enzyme. A lysine coding triplet was found in the 171 position in case of the Blackheaded Mutton Sheep group. The XXK allele occurred in a heterozygous combination with a frequency of 0.69%, constituting 1.33% of genotypes of the analysed Blackheaded Mutton Sheep group and 0.4% of genotypes of the whole population subject to study.

PL

Owczy gen PRNP odpowiedzialny jest za produkcję białka prionowego komórkowego prawidłowego, a jego polimorfizm ma znaczący wpływ na podatność/oporność owiec na trzęsawkę (scrapie). Celem badań była detekcja zmienności (CAG/AAG) występującej w kodonie 171 owczego genu białka prionowego. Przebadano 241 osobników ras: merynos polski, czarnogłówka, polska owca górska, ile de france, berrichon du cher oraz suffolk metodą PCR-RFLP przy użyciu enzymu MboI. W pozycji 171 wykryto triplet kodujący lizynę w grupie owiec rasy czarnogłówka. Allel XXK wystąpił w układzie heterozgotycznym z częstością 0,69%, co stanowiło 1,33% genotypów przebadanej populacji czarnogłówki oraz 0,4% genotypów całej populacji objętej badaniam

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Naukowe. Zootechnika. Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy w Bydgoszczy
• Rocznik: 2010
• Tom: 38
• Opis fizyczny: p.19-26,fig.,ref.

Twórcy

autor

Markowska A.

• Department of Genetics and General Animal Breeding, Faculty of Animal Breeding and Biology, University of Technology and Life Sciences in Bydgoszcz, Mazowiecka 28, 85-084 Bydgoszcz, Poland

autor

Wisniewska E.

autor

Szkudlarek-Kowalczyk M.

autor

Mroczkowski S.

Bibliografia

• [1] Acin C., Martin-Burriel I., Goldmann W., Lyahyai J., Monzon M., Bolea R., Smith A., Rodellar C., Badiola J.J., Zaragoza P., 2004. Prion protein gene polymorphisms in healthy and scrapie-affected Spanish sheep. J. Gen. Virol. 85, 2103–2110.
• [2] Acutis P.L., Martucci F., Mazza M., Peletto S., Iulini B., Corona C., Bozzetta E., Casalone C., Caramelli M., 2006. A case of scrapie in a sheep carrying the lysine-171 allele of the prion protein gene. Arch. Virol. 151, 1875–1880.
• [3] Acutis P.L., Sbaiz L., Verburg F., Riina M.V., Ru G., Moda G., Caramelli M., Bossers A., 2004. Low frequency of the scrapie resistance-associated allele and presence of lysine-171 allele of the prion protein gene in Italian Biellese ovine breed. J. Gen. Virol. 85, 3165–3172.
• [4] Benkela B.F., Valleb E., Bissonnettec N., Farida A.F., 2007. Simultaneous detection of eight single nucleotide polymorphisms in the ovine prion protein gene. Mol. Cell. Probes. 21, 363–367.
• [5] Billinis C., Psychas V., Leontides L., Spyrou V., Argyroudis S., Vlemmas I., Leontides S., Sklaviadis T., Papadopoulos O., 2004. Prion protein gene polymorphism in healthy and scrapie-affected sheep in Greece. J. Gen. Virol. 85, 547–554.
• [6] DEFRA, 2006. In National Scrapie Plan for Great Britain.
• [7] DeSilva U., Guo X., Kupfer D.M., Fernando S.C., Pillai A.T.V., Najar F.Z., So S., Fitch G.Q., Roe B.A., 2003. Allelic variants of ovine prion protein gene (PRNP) in Oklahoma sheep. Cytogenet. Genome Res. 102, 89–94.
• [8] Goldmann W., Baylis M., Chichota C., Stevenson E., Hunter N., 2005. Frequencies of PrP gene haplotypes in British sheep and the implications for breeding programmes. J. Appl. Microbiol. 98, 1294–1302.
• [9] Goldmann W., Houston F., Stewart P., Perucchini M., Foster J.,Hunter N., 2006. Ovine prion protein variant A136R154L168Q171 increases resistance to experimental challenge with bovine spongiform encephalopathy agent. J. Gen. Virol. 87, 3741–3745.
• [10] Gombojav A., Ishiguro N., Horiuchi M., Serjmyadag D., Byambaa B., Shinagawa M., 2003. Amino acid polymorphisms of PrP gene in Mongolian sheep. J. Vet. Med. Sci. 65(1), 75–81.
• [11] Guo X., Kupfer D.M., Fitch G.Q., Roe B.A., DeSilva U., 2003. Identification of a novel lysine-171 allele in the ovine prion protein (PRNP) gene. Anim. Genet. 34, 302–318.
• [12] Kutzer T., Pfeiffer I., Breng B., 2002. Identification of new allelic variants in the ovine prion protein (PrP) gene. J. Anim. Breed. Genet. 119, 201–208.
• [13] Lan Z., Wang Z.L., Liu Y., Zhang X., 2006. Prion protein gene (PRNP) polymorphisms in Xinjiang local sheep breeds in China. Arch. Virol. 151, 2095–2101.
• [14] Lee I.Y., Westaway D., Smit A.F., Wang K., Seto J., Chen L., Acharya C., Ankener M., Baskin D., Cooper C., Yao H., Prusiner S.B., Hood L.E., 1998. Complete genomic sequence and analysis of the prion protein gene region from three mammalian species. Genome. Res. 8, 1022–1037.
• [15] Lühken G., Lipsky S., Peter C., Erhardt G., 2008. Prion protein polymorphisms in autochthonous European sheep breeds in respect to scrapie eradication in affected flocks. Small Ruminant Res. 75, 43–47.
• [16] Niżnikowski R., Lühken G., Strzelec E., Lipsky S., Popielarczyk D., Erhard G., 2006. Consorcium ECONOGENE PRNP gene polymorphism in 136, 154 and 171 codons in Polish sheep breeds. Med. Wet. 62, 938–941.
• [17] Thorgeirsdottir S., Sigurdarson S., Thorisson H.M., Georgsson G., Palsdottir A., 1999. PrP gene polymorphism and natural scrapie in Icelandic sheep. J. Gen. Virol. 80, 2527–2534.
• [18] Zhou H., Hickford J.G.H., Fang Q., 2005. Determination of alleles of the ovine PRNP gene using PCR-single-strand conformational polymorphism analysis. J. Anim. Sci. 83, 745–749.

Uwagi

PL

Rekord w opracowaniu.