Markery RAPD w identyfikacji genotypów Salix purpurea L.

• Autorzy: Sulima P. , Przyborowski A.

Warianty tytułu

EN

RAPD markers for genotype identification in Salix purpurea L.

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W pracy przedstawiono wyniki badań nad przydatnością markerów RAPD w identyfikacji genotypów S. purpurea. Materiał roślinny stanowiło 14 genotypów z gatunku S. purpurea. Spośród 60 testowanych, do badań wybrano 38 oligonukleotydowych starterów, które generowały polimorficzne produkty amplifikacji o stabilnych i wyraźnych wzorach prążkowych. Uzyskano 169 produktów amplifikacji, wśród których zaobserwowano 9 specyficznych genotypowo fragmentów DNA. Każdy specyficzny genotypowo marker generowany był tylko u jednego genotypu S. purpurea. Za pomocą tych markerów można potwierdzić tożsamość 6 badanych genotypów S. purpurea. Wysoką użytecznością charakteryzowały się startery A-04 oraz В-06, po zastosowaniu których zaobserwowano odpowiednio 3 oraz 2 markery specyficzne. Genotypowe markery specyficzne zapewniają szybką i skuteczną identyfikację poszczególnych form i mogą być stosowane w wielu etapach tworzenia nowych odmian.

EN

The work contains results of the studies on usefulness of RAPD markers in the identification of genotypes of S. purpurea. The plant material comprised 14 genotypes of S. purpurea. The experiment involved 38 of 60 tested oligonucleotide primers generating polymorphic amplification products with stable and elear band patterns. From among a total number of 169 obtained amplification products, nine genotype-specific DNA fragments were noted, each observed in only a single S. purpurea genotype. These markers generate possibilities of confirmation of the identity of six investigated S. purpurea genotypes. Especially useful were A-04 and В-06 primers, which generated 3 and 2 specific markers, respectively. Genotype-specific markers could be a valuable tool in a rapid and effective identification of various forms and could be used in many stages of breeding new varieties.

Słowa kluczowe

PL

genotyp; hodowla roslin; identyfikacja genetyczna; markery genetyczne; markery RAPD; metody molekularne; Salix purpurea; wierzba purpurowa

EN

genotype; plant breeding; genetic identification; genetic marker; RAPD marker; molecular marker; Salix purpurea; purple willow

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2010
• Tom: 555
• Opis fizyczny: s.419-425,tab.,fot.,bibliogr.

Twórcy

autor

Sulima P.

• Katedra Hodowli Roślin i Nasiennictwa, Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie, Plac Łódzki 3, 10-724 Olsztyn-Kortowo

autor

Przyborowski A.

Bibliografia

• Argus G.W. 1997. Infrageneric classification of Salix in the New World. Syst. Bot. Monogr. 52: 1-121.
• Bisset N., Wichtl M. 2001. Herbal drugs and phytopharmaceuticals. CRC, London: 437-439.
• Chandra A., Saxena R., Roy A.K. 2006. Polymorphism and genotype-specific markers for Dichanthium identified by random amplified polymorphic DNA. Genet. Resour. Crop Evol. 53: 1521-1529.
• European Pharmacopoeia 2004. 5th edition. Council of Europe, Strasbourg, France: 3562.
• Fritsch P., Rieseberg L.H. 1996. The use of random amplified polymorphic DNA (RAPD) in conservation genetics, w: Molecular genetic approaches in conservation, Smith T.B., Wayne R.K. (red.). Oxford Univ. Press, London: 54-73.
• Hammad I. 2009. Genetic variation among Bougainvillea glabra cultivars (Nyctaginaceae) detected by rapd markers and isozymes patterns. Research Journal of Agriculture and Biological Sciences 5(1): 63-71.
• Jones C.J., Edwards K.J., Castaglione S., Winfield M.O., Sala F., Van De Wiel C., Bredemeijer G., Vosman B., Matthes M., Daly A., Brettschneider R., Bettini P., Buiatti M., Maestri E., Malceschii A., Marmiroli N., Aert R., Volckaert G., Rueda T., Linacero R., Vazques A., Karp A. 1997. Reproducibility testing of RAPD, AFLP and SSR markers in plants by a network of European laboratories. Mol. Breed. 3: 381-390.
• Lin D., Hubbes M., Zsuffa L. 1994. Differentiation of poplar and willow clones using RAPD fingerprints. Tree Physiology 14: 1097-1105.
• Meier B., Lehmann D., Sticher O., Bettschart A. 1985. Identifikation und Bestimmung von je acht Phenolglykosiden in Salix purpurea und Salix daphnoides mit moderner HPLC. Pharm. Acta Helv. 60: 269-275.
• Milligan B.G. 1998. Total DNA isolation, w: Molecular genetic analysis of populations: A practical approach. 2nd ed. Hoelzel A.R. (red.). Oxford Univ. Press, Охford, UK: 29-64.
• Neumann A. 1981. Die mitteleuropäischen Salix-Arten. Mitt Forstlichen Bundesversuchsanstalt, Wien: 152 ss.
• Penner G.A., Bush A., Wise R., Kim W., Domier L., Kasha K., Laroche A., Scoles G., Molner S.J., Fedak G. 1993. Reproducibility of random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis among laboratories. PCR Methods Appl. 2: 341-345.
• Pobłocka-Olech L., Van Nederkassel A.M., Vander Heyden Y., Krauze-Baranowska M., Głód M.D., Baczek T. 2007. Chromatographic analysis of salicylic compounds in different species of the genus Salix. J. Sep. Sci. 30: 2958-2966.
• Rajora O.P., Rahman M.H. 2003. Microsatellite DNA and RAPD fingerprinting, identification and genetic relationships of hybrid poplar (Populus x canadensis) cultivars. Theor. Appl. Genet. 106: 470-477.
• Sarmah P., Barua P.K., Sarma R.N., Sen P., Deka P.C. 2007. Genetic diversity among rattan genotypes from India based on RAPD-marker analysis. Genet. Resour. Crop Evol. 54: 593-600.
• Schmid B., Kotter I., Heide L. 2001. Pharmacokinetics of salicin after oral administration of standard willow bark extract. Eur. J. Clin. Pharmacol. 57: 387-391.
• Seneta W., Dolatowski J. 2003. Dendrologia. PWN, Warszawa: 95-118
• Skvortsov A.K. 1999. Willows of Russia and adjacent countries. Taxonomical and geographical revision. University of Joensuu, Faculty of Mathematics and Natural Sciences report series number 39, Joensuu, Finland: 307 ss.
• Sulima P., Przyborowski J.A., Wiwart M. 2006. Willow bark - herbal raw material harvested from arable lands. Herba Polonica 54: 18-25.
• Thieme H. 1965. Die Phenolglykoside der Salicaceen. Pharmazie 20: 570-574.
• Welsh J., McClelland M. 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucl. Acids Res. 18: 7213-7218.
• Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 18: 6531-6535.