PL
Transpozony są to odcinki DNA zdolne do zmiany swojej lokalizacji w genomie. Polimorfizm insercji transpozonów stanowi wartościowe i coraz częściej wykorzystywane narzędzie analizy zmienności genetycznej na poziomie molekularnym. System DcMaster Transposon Display (DcMTD) pozwala na identyfikację polimorficznych miejsc insercji transpozonów z rodziny DcMaster w genomie marchwi. Przy wykorzystaniu ośmiu kombinacji nukleotydów selekcjonujących, zidentyfikowano 232 markery DcMTD, z których 42 były charakterystyczne tylko dla pojedynczych obiektów, a pozostałe 190 występowało przynajmniej u dwóch odmian. Stwierdzono, że istnieje różnica pomiędzy odmianami europejskimi a azjatyckimi. Odmiany amerykańskie wykazywały podobieństwo zarówno do materiałów europejskich, jak i do azjatyckich, a większość odmian japońskich mieściła się w puli azjatyckiej. Zaobserwowano odrębność lokalnej odmiany Long Red pochodzącej z Etiopii oraz rosyjskiej odmiany miejscowej Moskovskaja Zimniaja, co wskazuje na możliwą aktywność transpozonów DcMaster indukowaną stresem abiotycznym w toku adaptacji do skrajnych warunków klimatycznych. Przedstawione wyniki pozwolą na przeprowadzenie bardziej systematycznych analiz poziomu różnorodności marchwi uprawnej i dzikiej.
EN
Transposons are defined as segments of DNA capable of changing their genomic position. Transposon insertion polymorphism is a valuable and frequently used tool for evaluation of genetic diversity on the molecular level. DcMaster Transposon Display (DcMTD) allows the identification of polymorphic insertion sites of DcMaster-like transposons in the carrot genome. Using eight combinations of selective nucleotides we identified 232 DcMTD markers, of which 42 were unique for a single accession, the remaining 190 being shared by two or more accessions. A difference between the European and Asian germplasm could be noticed. American cultivars were similar to both European and Asian material, while most Japanese cultivars fell within the Asian genepool. Local cultivars Long Red from Ethiopia and Moskovskaja Zimniaja from Russia were separate, which suggests a possible activity of DcMaster-like transposons induced by abiotic stresses in the course of adaptation to unfavorable climatic conditions. The presented preliminary results will facilitate a more systematic analysis of diversity in the cultivated carrot and its wild relatives.