Wykorzystanie techniki PCR-RFLP do porownawczej analizy wybranych chorobotworczych paleczek Escherichia coli

• Autorzy: Skwark M. , Furowicz A.J.

Warianty tytułu

EN

Using the PCR-RFLP method for comparative analysis of the pathogenic Escherichia coli strains

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Analiza genotypowa z zastosowaniem metody PCR-RFLP wykazała, że wszystkie badane szczepy E. coli, zarówno fermentujące sacharozę, jak i nie rozkładające tego cukru, charakteryzowały się tym samym wzorem restrykcyjnym, złożonym z 2 fragmentów DNA o wielkości 161 pz i 110 pz. Odnotowano, iż szczepy te wykazują wewnątrzgatunkowe podobieństwo genotypowe w obrębie genu cscA.

EN

The purpose of the study was to find differences and similarities between Escherichia coli strains which utilize or do not utilize disacharide sucrose by PCR-RFLP method. Investigations have been done on chromosomal DNA level using cscA gene associated with conservative sequences. The cscA gene may be find in all of the analysed strains. Genotypie analysis demonstrated presence of the same restriction model consisted of 2 DNA fragments with size of 161 bp and 110 bp in all of E. coli strains. Results of these investigetions have shown that there are no differences between E. coli strains.

Słowa kluczowe

PL

gen cscA; szczepy bakteryjne; Escherichia coli; lancuchowa reakcja polimerazy; metoda RFLP; analiza genotypowa; chorobotworczosc; bakterie

• Wydawca: -
• Czasopismo: Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia
• Rocznik: 2004
• Tom: 56
• Numer: 2
• Opis fizyczny: s.173-177,rys.,tab.,bibliogr.

Twórcy

autor

Skwark M.

• Akademia Rolnicza, Szczecin

autor

Furowicz A.J.

Bibliografia

• 1. Bisping W Colour Atlas for the Diagnosis of Bacterial Pathogens in Animals: Paul Parey Scientific Publishers, Berlin — Hamburg 1988.
• 2. Bockmann J, Heuel H, Lengeier JW. Characterization of a chromosomally encoded, non-PTS metabolic pathway for sucrose utilization in Escherichia coli EC3132. Mol Gen Genet 1992; 235: 22-32.
• 3. ChanawongA, M'Zali FH, Heritage J, LulitanondA, Hawkey PM. SHV-12, SHV-5, SHV-2a and VEB-1 extended-spectrum ß-lactamases in Gram-negative bacteria isolated in a university hospital in Thailand. J Antimicrob Chemoth 2000; 48: 839-52.
• 4. Ewing WH. W: Edwards and Ewing's identification of Enterobacteriaceae, 4th Ed. Elsevier, New York-Amsterdam- Oxford 1986, 509-30.
• 5. Frillingos S, Sahin-Toth M, Lengeier JW, Kaback RH. Helix Packing in the sucrose permease of Escherichia coli: Properties of enineered charge pairs between helices VII і IX. Bioch. 1995; 34: 9368-73.
• 6. Furowicz AJ, Karakulska J, Perużyńska A. Bakteryjna ureaza — wskaźnik diagnostyczny і element patogenności drobnoustrojów jelitowych. Med Wet 2004; 60: 119-23.
• 7. Garcia GEA. Animal health and foodborne pathogenes: enterohaemorrhegic 0157: H7 strains and other pathogenic Escherichia coli virotypes. Polish J Vet Scie 2002; 5:103-15.
• 8. Jahreis K, Bentier L, Bockmann J i inni. Adaptation of sucrose metabolism in the Escherichia coli wild-type strain EC3132. J Bacteriol 2002; 19: 5307-16.
• 9. Karakulska J. Biochemiczne właściwości enterotoksycznych i enterokrwotocznych szczepów E. coli. Med Dośw Mikobiol 2002; 54: 215-23.
• 10. Konopka M. Enterokrwotoczne szczepy Escherichia coli 0157: H7- chorobotwórczość, diagnostyka i epidemiologia zakażeń. Nowa Med 1997; 4: 10-6.
• 11. Kur J. Metody diagnostyczne oparte na analizie DNA (PCR). Materiały kursu organizowanego przez Katedrę Mikrobiologii Politechniki Gdańskiej oraz DNA-Gdańsk we współpracy z A&A Biotechnology, P. G. Gdańsk, 1994.
• 12. Lehmacher A, Meier H, Stojanka A, Bockemźhl J. Detection of Hemolysin Variants of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli by PCR and Culture on VancomycinCefixime-Cefsulodin Blood Agar Appl Environ Microbiol 1998; 64: 2449-53.
• 13. Paton JC, Paton AW. Pathogenesis and diagnosis of Shiga toxin-producing Escherichia coli infections. Clin Microbiol Rev 1998; 11: 450-4.
• 14. Piérard D, Muyldermans G, Moriau L i inni. Identification of new verocytotoxin type 2 variant B-subunit genes in human and animal Escherichia coli isolates. Journ Clinic Microbiol 1998; 36: 3317-22.
• 15. Sahin-Toth M, Lengyel Z, Tsunekawa H. Cloning, sequencing, and expression of cscA invertase from Escherichia coli B-62. Can J Microbiol 1999; 45: 418-22.
• 16. Skwark M, Czyżewska I. Fenotypowa i genotypowa charakterystyka procesu fermentacji sacharozy przez patogenne szczepy Escherichia coli. Med Dośw Mikrobiol 2003; 55: 219-24.
• 17. Sussman M. Escherichia coli. Mechanisms and Virulence, Cambridge University Press, Cambridge 1997.
• 18. Tarasiuk K, Truszczyński M. Znaczenie fenotypowych i genotypowych metod klasyfikacji bakterii w epidemiologii i zwalczaniu chorób zakaźnych. Medycyna Wet. 1995; 51: 323-6.
• 19. Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV. How to select and interpret molecular strain typing methods for epidemilogical studies of bacterial infections: a review for healthcare epidemiologist. Inf Contr Hosp Epidemiol 1997; 18: 426-39.
• 20. Zhang WL, Bielaszewska M, Bockemźhl J i inni. Molecular analysis of H antigens reveals that human diarrheagenic Escherichia coli O26 strains that carry the eae gene belong to the H11 clonal complex. Journ Clinic Microbiol 2000, 38: 2989-93.