Identification of pear cultivars with RAPD and ISSR markers

• Autorzy: Lisek A , Rozpara E.

Warianty tytułu

PL

Zastosowanie markerow RAPD i ISSR do identyfikacji odmian gruszy

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

RAPD and ISSR techniques were used in identification of 26 pear cultivars. As a result of reactions carried out with RAPD 25 primers, 103 polymorphic DNA frag­ments were obtained. The largest number of polymorphic dNa fragments (7-8) was produced in reactions with the following primers: OPT 15, OPG 16 and OPG 19. Identification of cultivars and rootstocks was achievable with the use of OPT 15, OPG 19 and OPU 07 primers. In the reactions performed with 22 ISSR primers, 135 markers of pear cultivars were obtained. The size of fragments varied from 280 to 1790 bp. The greatest number of polymorphic products (9) was obtained in the reac­tions with primers: 830, 840 and 844. Primers 840 and 844 enabled identification of all tested genotypes. Degree of DNA polymorphism was estimated at 56.3% (RAPD) and 71.5% (ISSR). Results of the research confirm the usefulness of both techniques in identifying pear cultivars.

PL

Grusza jest gatunkiem powszechnie uprawianym w klimacie umiarkowanym, a owoce jej są cenione przez konsumentów ze względu na walory smakowe. Produk­cja owoców gruszy wymaga umiejętności odróżniania odmian w szkółkach i w sa­dach. Ocena dokonywana na podstawie cech morfologicznych może być bardzo trud­na z powodu dużego podobieństwa w wyglądzie drzew i owoców, dlatego do precy­zyjnej identyfikacji genotypów stosuje się techniki biologii molekularnej. Celem pracy było odróżnienie 26 odmian gruszy z użyciem technik RAPD i ISSR przez określenie markerów DNA identyfikujących testowane odmiany. W wyniku przepro­wadzonych reakcji z 25 starterami RAPD otrzymano 103 polimorficzne fragmenty DNA. Najwięcej fragmentów polimorficznych (7-8) otrzymano w reakcjach ze starte­rami OPT 15, OPG 16 i OPG 19. Odróżnienie odmian i podkładek było możliwe przy użyciu starterów OPT 15, OPG 19, OPU 07. W reakcjach z 22 starterami ISSR uzy­skano 135 markerów odmian gruszy. Wielkość fragmentów wahałk się od 280 pz do 1790 pz. Najwi ęcej polimorficznych produktów (9) uzyskano w reakcjach ze starte­rami 830, 840 i 844. Użycie starterów 840 i 844 umożliwiło odróżnienie wszystkich testowanych genotypów. Stopień polimorfizmu DNA określono na poziomie 56,3% (RAPD) i 71,5% (ISSR). Wyniki badań potwierdzają przydatność obu technik do rozró żniania odmian gruszy.

Słowa kluczowe

EN

Pyrus communis; pear; identification; plant cultivar; rootstock; RAPD marker; ISSR marker; molecular marker; DNA polymorphism; Poland

• Wydawca: -
• Czasopismo: Journal of Fruit and Ornamental Plant Research
• Rocznik: 2010
• Tom: 18
• Numer: 2
• Opis fizyczny: p.17-22,ref.

Twórcy

autor

Lisek A

• Research Institute of Pomology and Floriculture, Pomologiczna 18, 96-100 Skierniewice, Poland

autor

Rozpara E.

Bibliografia

• Brini W., Mars M., Hormaza J.I. 2008. Genetic diversity in local Tunisian pears (Pyrus communis L.) studied with SSR markers. SCI. HORT. 115: 337-341.
• Doyle J.J., Doyle J.L. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. FOCUS 12: 13-15.
• Kim C.S., Lee C.H., Park K.W., Kang S.J., Shin I.S., Lee G.P. 2005. Phylogenetic relationships among Pyrus pyrifolia and P. communis detected by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and conserved rDNA sequences. SCI. HORT. 106: 491-501.
• Manganaris A.G., Tsipouridis C.G. 2002. Isoenzymic polymorphism in pear. ACTA HORT. 596: 177-181.
• Monte-Corvo L., Cabrita L., Oliveira C., Leitao J. 2000. Assessment of genetic relationships among Pyrus species and cultivars using AFLP and RAPD markers. GEN. RES. CROP EVOL. 47: 257-265.
• Monte-Corvo L., Goulao L., Oliveira C. 2001. ISSR analysis of cultivars of pear and suitability of molecular markers for clone discrimination. J. AMER. SOC. HORT. SCI. 126: 517-522.
• Monte-Corvo L., Goulao L., Oliveira C. 2002. Discrimination of pear cultivars with RAPD, AFLP and ISSR. ACTA HORT. 596: 187-191.
• Sharifani M.M., Jackson J.F. 2000. Characterization of pear species and cultivas using RAPD primers. ACTA HORT. 538: 499-504.
• Wünsch A., Hormaza J.I. 2007. Characterization of variability and genetic similarity of European pear using microsatellite loci developed in apple. SCI. HORT. 113: 37-43.
• Yamamoto T., Kimura T., Sawamura Y., Manabe T., Kotobuki K., Hayashi T., Ban Y., Matsuta N. 2002. Simple sequence repeats for genetic analysis in pear. EUPHYTICA 124: 129-137.
• Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. 1994. Genome figerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. GENOMICS 20: 176-183.