Wykorzystanie markerów DNA do oszacowania zmienności w polskiej kolekcji zasobów genowych marchwi (Daucus carota L.)

• Autorzy: Baranski R. , Grzebelus D. , Kotlinska T. , Michalik B.

Warianty tytułu

EN

The use of DNA markers for evaluation of genetic diversity in the Polish germplasm collection of carrot (Daucus carota L.)

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Ocenę zróżnicowania genetycznego prowadzono dla 27 obiektów należących do rodzajów Daucus, Caucalis, Orlaya i Torilis w oparciu o 144 markery różnicujące badane obiekty, spośród których 67 otrzymano techniką RAPD, a 77 techniką AFLP. Macierze dystansu genetycznego były podobne, niezależnie od wybranego rodzaju markerów. Analiza pozwoliła na wyróżnienie trzech głównych grup obiektów obejmujących odpowiednio obiekty należące do rodzaju Torilis, Orlaya /Caucalis oraz Daucus. Porównanie macierzy podobieństw genetycznych dla siedmiu obiektów powtórzonych w trzech latach badań wskazało na bardzo dużą zgodność otrzymanych wyników, co zostało potwierdzone bardzo zbliżonym układem obiektów na dendrogramach. Uzyskane wyniki są wykorzystywane przez kuratora kolekcji do racjonalizacji zarządzania polskimi zasobami genowymi marchwi.

EN

Genetic diversity was evaluated for 27 accessions belonging to genera Daucus, Caucalis, Orlaya and Torilis on the basis of 144 molecular markers differentiating them, out of which 67 were obtained using RAPD, and 77 using AFLP techniques. Genetic distance matrices were similar regardless the kind of marker. Analysis allowed for the identification of three clusters grouping accessions belonging to genera Torilis, Orlaya/Caucalis and Daucus. Comparison of similarity matrices for seven accessions evaluated in all three years showed that the results were highly reproducible, which was confirmed by a similar tree topology. The results are utilized by the curator as a tool for more rational management of the collection.

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2004
• Tom: 497
• Numer: 1
• Opis fizyczny: s.201-207,tab.,rys.,bibliogr.

Twórcy

autor

Baranski R.

• Katedra Genetyki, Hodowli i Nasiennictwa, Akademia Rolnicza im.H.Kołłątaja w Krakowie, Al.29 Listopada 54, 31-425 Kraków

autor

Grzebelus D.

• Katedra Genetyki, Hodowli i Nasiennictwa, Akademia Rolnicza im.H.Kołłątaja w Krakowie, Al.29 Listopada 54, 31-425 Kraków

autor

Kotlinska T.

• Pracownia Zasobów Genowych, Instytut Warzywnictwa im.Emila Chroboczka, ul.Konstytucji 3 Maja 1/3, 96-100 Skierniewice

autor

Michalik B.

• Katedra Genetyki, Hodowli i Nasiennictwa, Akademia Rolnicza im.H.Kołłątaja w Krakowie, Al.29 Listopada 54, 31-425 Kraków

Bibliografia

• Bradeen J.M., Bach I.C., Briard M., Le Clerc V., Grzebelus D., Senalik D., Simon P.W. 2002. Molecular diversity analysis of cultivated carrot (Daucus carota) and wild Daucus populations reveals a genetically nonstructured composition. J. Amer. Soc. Hort. Sci. 127: 383-391.
• Briard M., Le Clerc V., Grzebelus D., Senalik D., Simon P.W. 2000. Modified protocols for rapid extraction of plant genomic DNA, AFLP™ analysis, and visualization with radioisotope or silver stain in carrots. Pl. Mol. Biol. Rep. 18: 235-241.
• Grzebelus D., Barański R., Jagosz B., Michalik B., Simon P.W. 2001a. Comparison of RAPD and AFLP techniques used for the evaluation of genetic diversity of carrot breeding materials. Acta Hort. 546: 413-416.
• Grzebelus D., Senalik D., Jagosz B., Simon P.W., Michalik B. 2001b. The use of AFLP markers for the identification of carrot breeding lines and F1 hybrids. Plant Breeding 120: 526-528.
• Le Clerc V., Briard M., Revollon P. 2002. Influence of number and map distribution of AFLP markers on similarity estimates in carrot. Theor. Appl. Genet. 106: 157-162.
• Nakajima Y., Oeda K., Yamamoto T. 1998. Characterization of genetic diversity of nuclear and mitochondrial genomes in Daucus varieties by RAPD and AFLP. Plant Cell Rep. 17: 848-853.
• Shim S.I., Jřrgensen R.B. 2000. Genetic structure in cultivated and wild carrots (Daucus carota L.) revealed by AFLP analysis. Theor. Appl. Genet. 101: 227-233.