Analiza struktury genetycznej koni rasy American Quarter

• Autorzy: Kania-Gierdziewicz J. , Gierdziewicz M. , Stankowska-Zoladz E.

Warianty tytułu

EN

Genetic structure analysis of American Quarter Horses

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Celem pracy było oszacowanie poziomu inbredu i spokrewnienia w populacji koni rasy American Quarter (AQ) hodowanych w stadninie Roleski Ranch w Starych Żukowicach w Małopolsce. Dane stanowiły rodowody 76 koni rasy AQ (40 ogierów, 36 klaczy) urodzonych w latach 1993-2012. Współczynniki inbredu (FX) i współczynniki spokrewnienia (RXY) szacowano metodą Tiera. Dokonano również oceny efektywnej liczby założycieli (fe) i przodków (fa). Wykazano, że prawie 91% osobników było zinbredowanych (90% samców i 91,67% samic). W grupie samców wartości średniego inbredu wynosiły 0,0132 dla wszystkich i 0,0146 dla zinbredowanych, natomiast w grupie samic odpowiednio 0,0142 i 0,0155. W badanej populacji ponad 97% osobników było spokrewnionych. Spokrewnionych było ponad 99% par samców, przy średnim RXY wynoszącym 0,0610 i 0,0641 odpowiednio dla wszystkich i spokrewnionych. Analogiczne wartości dla klaczy to prawie 95% par spokrewnionych oraz nieco niższe wartości RXY, około 0,0590 dla wszystkich klaczy oraz 0,0591 dla spokrewnionych. Dla ponad 97% spokrewnionych par samiec x samica średnie RXY wynosiło 0,0622, a dla wszystkich 0,0607. W badanym stadzie koni fe wynosiła 121, natomiast fa − 26. Połowę puli genetycznej badanego stada wyjaśniały udziały jedynie 10 przodków, a 90% alleli badanych koni pochodziło od 39 przodków. Z powodu stałego importu materiału hodowlanego rasy American Quarter oraz racjonalnego doboru par do rozpłodu, poziom inbredu i pokrewieństwa w badanym stadzie jest stosunkowo niski.

EN

The study investigated inbreeding and relationship in American Quarter Horses (AQ) kept or bred on the Roleski Ranch stud farm (Stare Żukowice, Małopolska region). The data consisted of pedigrees of 76 AQ horses (40 stallions and 36 mares) born in 1993-2012. Coefficients of inbreeding (FX) and relationship (RXY) were calculated according to Tier. The effective number of founders (fe) and effective number of ancestors (fa) were calculated as well. Almost 91% of horses were found to be inbred – 90% of stallions and 91.67% of mares. In sex groups, FX averaged 0.0132 and 0.0142 for all stallions and all mares, and 0.0146 and 0.0155 for inbred stallions and inbred mares. About 97.37% of animal pairs were found to be related. Over 99% of male pairs were related, with RXY for all and inbred males averaging 0.0610 and 0.0641, respectively. In females, nearly 95% of pairs were related, but RXY values were slightly lower, averaging 0.0590 and 0.0591 for all and related pairs, respectively. Among mixed male-female pairs 97.5% were related, with RXY values averaging 0.0607 and 0.0622 for all and related pairs, respectively. The fe was 121 and the fa = 26. Half of the genetic pool was explained by contributions of only 10 ancestors, and 90% of alleles originated in 39 ancestors. Due to steady importation of stock AQ horses and careful mating plans, the inbreeding and relationship coefficients on the Roleski Ranch stud farm are relatively low.

Słowa kluczowe

PL

konie; konie American Quarter Horse; inbred; spokrewnienie; struktura genetyczna; stada zwierzat; stadnina Roleski Ranch

• Wydawca: -
• Czasopismo: Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego
• Rocznik: 2015
• Tom: 11
• Numer: 3
• Opis fizyczny: s.9-21,rys.,tab.,bibliogr.

Twórcy

autor

Kania-Gierdziewicz J.

• Katedra Genetyki i Metod Doskonalenia Zwierząt, Wydział Hodowli i Biologii Zwierząt, Uniwersytet Rolniczy w Krakowie, al.Mickiewicza 24/28, 30-059 Kraków

autor

Gierdziewicz M.

• Katedra Genetyki i Metod Doskonalenia Zwierząt, Wydział Hodowli i Biologii Zwierząt, Uniwersytet Rolniczy w Krakowie, al.Mickiewicza 24/28, 30-059 Kraków

autor

Stankowska-Zoladz E.

• Katedra Genetyki i Metod Doskonalenia Zwierząt, Wydział Hodowli i Biologii Zwierząt, Uniwersytet Rolniczy w Krakowie, al.Mickiewicza 24/28, 30-059 Kraków

Bibliografia

• 1. ÁLVAREZ I., ROYO L.J., PÉREZ-PARDAL L., FERNÁNDEZ I., PAYERAS L., GOYACHE F., 2010 – Assessing losses of genetic variability in the endangered Mallorquí horse. Czech Journal of Animal Science 10, 456-462.
• 2. American Quarter Horse Association, 2013 – Annual Report. Wyd. American Quarter Horse Association (AQHA), Amarillo, Texas, USA, pp.40.
• 3. BHATNAGAR A.S., EAST C.M., SPLAN R.K., 2011 – Genetic variability of the Norwegian Fjord horse in North America. Animal Genetic Resources 49, 43-49.
• 4. BOICHARD D., MAIGNEL L., VERRIER E., 1996 – Analyse généalogique des races bovines laitières françaises. INRA Production Animalés 9 (5), 323-335.
• 5. BOICHARD D., MAIGNEL L., VERRIER E., 1997 – The value of using probabilities of gene origin to measure genetic variability in a population. Genetics Selection Evolution 29, 5-23.
• 6. CASSELL B.G., ADAMEC V., PEARSON R.E., 2003 – Effect od incomplete pedigrees on estimates of inbreeding and inbreeding depression for days to first service and summit milk yield in Holsteins and Jerseys. Journal of Dairy Science 86, 2967-2976.
• 7. CERVANTES I., MOLINA A., GOYACHE F., GUTIÉRREZ J.P., VALERA M., 2008 – Population history and genetic variability in the Spanish Arab Horse assessed via pedigree analysis. Livestock Science 113, 24-33.
• 8. FALCONER D.S., 1996 – Introduction to Quantitative Genetics. 4th Edition. Longman Group Ltd.
• 9. GIERDZIEWICZ M., KANIA-GIERDZIEWICZ J., 2007 – A study of efficiency of recursive algorithm for estimating relationship coefficients. Acta Scientiarum Polonorum, Zootechnica 6 (4), 29-36.
• 10. GŁAŻEWSKA I., 2004 – Mating and selection in national Arabian horse breeding: inbreeding coefficients analysis. Electronic Journal of Polish Agricultural Universities 7 (1), #02.
• 11. GŁAŻEWSKA I., JEZIERSKI T., 2004 – Pedigree analysis of Polish Arabian Horses based on founder contributions. Livestock Production Science 90, 293-298.
• 12. GUTIÉRREZ J.P., MARMI J., GOYACHE F., JORDANA J., 2005 – Pedigree information reveals moderate to high levels of inbreeding and weak population structure in the endangered Catalonian donkey breed. Journal of Animal Breeding and Genetics 122, 378-386.
• 13. HAMANN H., DISTL O., 2008 – Genetic variability in Hanoverian warm blood horses using pedigree analysis. Journal of Animal Science 86, 1503-1513.
• 14. HASLER H., FLURY C., MENET S., HAASE B., LEEB T., SIMIANER H., PONCET P.A., RIEDER S., 2011 – Genetic diversity in an indigenous horse breed – implications for mating strategies and the control of future inbreeding. Journal of Animal Breeding and Genetics 128, 394-406.
• 15. JANSSENS S., STINCKENS A., SCHROYEN M., PEETERS L., DE KEYSER K., DE WAEL R., LAMBERIGTS C., LUYTEN T., ONS E., BUYS N., 2010 – Genetic diversity in the Belgian Draught Horse breed as revealed by pedigree analysis and molecular marker data. Animal Genetics 41 (Suppl. 2), 205-206.
• 16. JASTRZĘBOWSKI D., 2015 – W drodze na południe. Koń Polski 1 (365), 58-61.
• 17. LACY R.C., 1989 – Analysis of Founder representation in pedigrees. Founder Equivalents and Founder Genome Equivalents. Zoo Biology 8, 111-123.
• 18. LACY R.C., 1995 – Clarification of genetic terms and their use in the management of captive populations. Zoo Biology 14, 565-578.
• 19. KANIA-GIERDZIEWICZ J., 2006 – Analiza struktury genetycznej – udział założycieli w puli genów populacji. Wiadomości Zootechniczne, R. XLIV, 2, 27-34.
• 20. OLSEN H.F., KLEMENTSDAL G., RUANE J., HELFJORD T., 2010 – Pedigree structure and genetic variation in the two endangered Norwegian horse breeds: Døle and Nordland/ Lyngen. Acta Agriculturae Scandinavica, Sectio A, 60, 13-22.
• 21. PETERSEN J.L., MICKELSON J.R., CLEARY K.D., MCCUE M.E., 2014 – The American Quarter Horse: Population Structure and Relationship to the Thoroughbred. Journal of Heredity 105 (2), 148-162.
• 22. PJONTEK J., KADLEČÍK O., KASARDA R., HORNÝ M., 2012 – Pedigree analysis in four Slovak endangered horse breeds. Czech Journal of Animal Science 2, 54-64.
• 23. ROYO L.J., ÁLVAREZ I., GUTIÉRREZ J.P., FERNÁNDEZ I., GOYACHE F., 2007 – Genetic variability in the endangered Asturcón pony assessed using genealogical and molecular information. Livestock Science 107, 162-169.
• 24. SEVINGA M., VRIJENHOEK T., HESSELINK J.W., BARKEMA H.W., GROEN A.F., 2004 – Effect of inbreeding on the incidence of retained placenta in Friesian horses. Journal of Animal Science 82, 982-986.
• 25. SIDERITS M., BAUMUNG R., FUERST-WALTL B., 2013 – Pedigree analysis in the German Paint Horse: Genetic variability and the influence of pedigree quality. Livestock Science 151, 152-157.
• 26. TEEGEN R., EDEL C., THALLER G., 2009 – Population structure of the Trakehner Horse breed. Animal 3 (1), 6-15.
• 27. TIER B., 1990 – Computing inbreeding coefficients quickly. Genetics Selection Evolution 22, 419-430.
• 28. TIRSTRUP J.P., PERTOLDI C., LOESCHCKE V., 2008 – Genetic analysis, breed assignment and conservation priorities of three native Danish horse breeds. Animal Genetics 39, 496-505.
• 29. TORO M.A., MEUWISSEN T.H.E., FERNÁNDEZ I., SHAAT I., MÄKI-TANILA A., 2011 – Assessing the genetic diversity in small farm animals populations. Animal 5 (11), 1669-1683.
• 30. TUNNEL J.A., SANDERS J.O., WILLIAMS J.D., POTTER G.D., 1983 – Pedigree analysis of four decades of Quarter Horse Breeding. Journal of Animal Science 57, 585-593.
• 31. VALERA M., MOLINA A., GUTIÉRREZ J.P., GÓMEZ J., GOYACHE F., 2005 – Pedigree analysis in the Andalusian horse: population structure, genetic variability and influence of the Carthusian strain. Livestock Production Science 95, 57-66.
• 32. VICENTE A.A., CAROLINO N., GAMA L.T., 2012 – Genetic diversity in the Lusitano horse breed assessed by pedigree analysis. Livestock Science 148, 16-25.
• 33. WRIGHT S., 1922 – Coefficients of inbreeding and relationship. American Naturalist 56, 330-338.
• 34. WRIGHT S., 1931 – Evolution of Mendelian population. Genetics 16, 97-159.
• 35. ZECHNER P., SÖLKNER J., BODO I., DRUML T., BAUMUNG R., ACHMANN R., MARTI E., HABE F., BREM G., 2002 – Analysis of diversity and population structure in the Lipizzan horse breed based on pedigree information. Livestock Production Science 77, 137-146.