Exploration of molecular variability in Rhizoctonia bataticola, the incitant of root rot disease of pulse crops

• Autorzy: Sundravadana S. , Thirumurugan S. , Devadason A.

Warianty tytułu

PL

Badania nad molekularną zmiennością grzyba Rhizoctonia bataticola, czynnika sprawczego zgnilizny korzeni roślin motylkowatych

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

The present study explored pathogenic and genetic variability among the eleven isolates of Rhizoctonia bataticola (Taub.) Butler from different pulse crops. Based on morphological characters, 11 isolates were categorized into three groups viz., linear, fluffy, and linear at the end with fluffy growth at the center. Isolates also showed variability in sclerotial characters (intensity and shape) and intensity of pigment synthesis. All isolates were more aggressive on the original host from which it was isolated, which was shown by the variability in pathogenic characters. RAPD-PCR analysis has shown that genetic clustering agreed with the above findings in dendrogram analysis (2 clusters A and B). The black gram root isolates showed a maximum genetic similarity of 73 % with soya bean shoot isolate. Red gram shoot isolate showed 61% genetic similarity with green gram isolates. The findings from this study confirm the variability in R. bataticola isolates from pulses, according to their pathological as well as genetic characters. In the future, variability in pathogens will determine effective management practices.

PL

Badano patogeniczność i genetyczną zmienność 11 izolatów grzyba Rhizoctonia bataticola (Taub.) Butler pochodzących z różnych upraw roślin motylkowatych. Biorąc pod uwagę cechy morfologiczne 11 izolatów patogena sklasyfikowano je w trzech grupach: o liniowym wzroście, puszystym oraz liniowym zakończonym puszystym centrum wzrostu. Izobaty grzyba wykazywały także różnice w procesie wytwarzania sklerot (częstotliwość i kształt), a także różniły się intensywnością syntezy pigmentu. Wszystkie badane izobaty były bardziej agresywne w stosunku do roślin gospodarzy, z których zostały pierwotnie wyizolowane, co potwierdza zmienność cech patogeniczności. Wyniki analizy RAPD-PCR wykazały, że klastrowanie genów było zgodne z dendrogramem wyżej wymienionych cech (2 klastry A i B). Izobaty patogena pochodzące z korzeni fasoli mango wykazywały najsilniejsze genetyczne podobieństwo rzędu 73% do izolatów z łodyg fasoli sojowej. Natomiast izolat patogena z nikli indyjskiej wykazał 61% genetycznego podobieństwa do izolatów pochodzących z roślin fasoli złotej. Wyniki prezentowanych badań potwierdziły występowanie zmienności izolatów grzyba R. bataticola pochodzących z upraw roślin motylkowatych w zależności od ich cech genetycznych i patogeniczności. Poznanie zmienności patogenów pozwoli w praktyce na wybór efektywniejszych metod ich zwalczania.

• Wydawca: -
• Czasopismo: Journal of Plant Protection Research
• Rocznik: 2011
• Tom: 51
• Numer: 2
• Opis fizyczny: p.184-189,fig.,ref.

Twórcy

autor

Sundravadana S.

• Department of Plant Pathology, Centre for Plant Protection Studies, Tamil Nadu Agricultural University, Coimbatore-641 003, India

autor

Thirumurugan S.

autor

Devadason A.

Bibliografia

• Almeida A. M. R., Abdelnoor R. V., Arias C. A. A., Carvalho V. P., Filho D. S. J., Marin S. R. R., Benato L. C., Pinto M. C., Carvalho C. G. P. 2003. Genotypic diversity among Brazilian isolates of Macrophomina phaseolina revealed by RAPD. Fitopatol. Braselaria 28 (3): 279-285.
• Byadgi A. S., Hedge R. 1985. Variation among the isolates of Rhizoctonia from different host plants. Indian Phytopathol. 38 (2): 297-301.
• Chiocchetti A., Ghignone S., Minuto A., Gullino M. L., Garibaldi A., Migheli Q. 1999. Identification of Fusarium oxysporum f. sp. basilici isolated from soil, basil seed and plants by RAPD analysis. Plant Dis. 83 (6): 576-581.
• Dhingra O. D., Sinclair J. B. 1978. Location of Macrophomina phaseolina on soybean plants related to cultural characteristics and virulence. Phytopathology 63 (10): 934-936.
• Franco M. C. R., Delgedo S. H., Fernandez R. B., Fernandez M. M., Simpson J., Perez M. N. 2006. Pathogenic and genetic variability within Macrophomina phaseolina from Mexico and other countries. Phytopathology 154 (7-8): 447-453.
• Jain N. K., Khare M. N., Sharma H. C. 1973. Variation among the isolates of Rhizoctonia bataticola from arid plant parts and soils. Mysore J. Agric. Sci. 7: 411-418.
• Janar T., Sharma T. R., Prasad R. D., Arora D. K. 2003. Molecular characterization of Macrophomina phaseolina and Fusarium species by a single primer RAPD technique. Microbiol. Res. 158 (3): 249-257.
• Latha J., Mathur K., Mukherjee P. K., Chakarbarti A., Rao V. P., Thakur R. P. 2002. Morphological, pathogenic and genetic variability amongst sorghum isolates of Colletotrichum graminicola from India. Indian Phytopathol. 55 (1): 19-25.
• Manici L. M., Cerato C., Caputo F. 1992. Pathogenic and biologic variability of Macrophomina phaseolina (Tassi.) Goid isolates in different areas of sunflower cultivation in Italy. p. 779-784. In: Proc. 1992 Sunflower Conference Italy, 1720 pp.
• Meena S., Sharma R. C., Sujay R., Poonam Y., Lokendra S., Ram D. 2006. Genetic variability in Macrophomina phaseolina incident of charcoal rots of maize in India. Indian Phytopathol. 59 (4): 453-459.
• Monga D., Raj S. 1994. Cultural and pathogenic variations in the isolates of Rhizoctonia sp causing root rot of cotton. Indian Phytopathol. 47 (4): 403-408.
• Monga D., Rathore S. S., Mayee C. D., Sharma T. R. 2004. Differentiation of isolates of cotton root pathogens Rhizoctonia solani and Rhizoctonia bataticola using pathogenicity and RAPD markers. J. Plant Biochem. Biotechnol. 13 (1): 135-139.
• Prameela T., Singh R. H. 1998. Cultural variation of Macrophomina phaseolina isolates collected from Vigna mungo. Indian Phytopathol. 51 (1): 292-293.
• Purkayastha S., Kaur B., Dilbaghi N., Chaudhury S. 2006. Characterization of Macrophomina phaseolina the charcoal rot pathogen of cluster bean using conventional techniques and PCR based molecular markers. Plant Pathol. 55 (1): 106-116.
• Riker A. J., Riker R. S. 1936. Introduction of Research on Plant Disease. John Swift Co., St. Lousi, 117 pp.
• Sharma Y. K., Gaur R. B., Bisnoi H. R. 2004. Cultural, morphological and physiological variability in Macrophomina phaseolina. J. Mycol. Plant Pathol. 34 (2): 532-534.
• Shekhar M., Sharma R. C., Rakshit S., Yadav P., Ram Dutta. 2006. Genetic variability in Macrophomina phaseolina (Tassi.) Goid incitant of charcoal rot of maize in India. Indian Phytopathol. 59 (3): 453-459
• Sobti A. K., Sharma L. C. 1992. Cultural variability among three isolates of Rhizoctonia bataticola from groundnut. Indian Phytopathol. 41 (1): 149-151.
• Thirumalaisamy P. P., Singh D. V., Aggarwal R., Srivastava K. 2006. Pathogenic variability in Tilletia indica the causal agent of karnal bunt of wheat. Indian Phytopathol. 59 (1): 22-26
• Ulukus I. 1984. A suitable medium for production of soluble red pigments by some strains of Macrophomina phaseolina. J. Turkish Phytopathol. 13 (1): 53-61.
• Williams J. G. K., Kubelik A. R., Livak K. J., Rafalski J. A., Tingey S. V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful genetic markers. Nucleic Acids Res. 18 (22): 6531-6535.

Uwagi

Rekord w opracowaniu