Natura obdarowała Kraków licznymi wodami mineralnymi i akratopegami (wody o mineralizacji 0,5 - 1 g/dm³). Do celów balneologicznych wykorzystywane są od 600 lat wody siarczkowe ze Swoszowic, a od 1905 r. także wody siarczkowe Mateczny. Są one stosowane m. in. w leczeniu reumatoidalnego zapalenia stawów, chorób pourazowych, schorzeń skóry, systemu nerwowego i zatruć przemysłowych. Natomiast mieszkańcy Krakowa nają dostęp do zdrowej czystej wody pochodzącej ze zdrojów o charakterze artezyjskim. Są to akratopegi pochodzące z odwiertów o głębokości 80-100 m w pięciu punktach miasta.