Mimo nierównomiernego rozwoju krajów kontynentu produkty rybołówstwa i akwakultury są obecne na rynkach UE. Głównymi producentami ryb z połowów morskich są: Maroko, Senegal i RPA, natomiast z połowów słodkowodnych Tanzania, Uganda, Egipt i Nigeria. Afryka zwiększyła jednak swój wkład w światową produkcję akwakultury z 1,2 do 2,2% w ciągu ostatnich dziesięciu lat, głównie w wyniku szybkiego rozwoju hodowli ryb słodkowodnych w Afryce subsaharyjskiej. Główni producenci to Nigeria, Egipt i Uganda. Oprócz tradycyjnie importowanych, głównie z RPA i Namibii, gatunków morszczuków, na rynku UE mogą pojawić się nowe gatunki zwierząt wodnych - nie tylko ryb. Kilka ostrzeżeń umieszczonych w systemie RASFF wskazuje na wciąż istniejący problem jakości administracji odpowiedzialnej w krajach Afryki za nadzór weterynaryjny i jakość produktów w eksporcie na rynki krajów UE.