Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników

Znaleziono wyników: 18

Liczba wyników na stronie
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 1 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych:  DNA barcoding
help Sortuj według:

help Ogranicz wyniki do:
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 1 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników
DNA barcoding is a practical tool for species identification, when morphological classification of an organism is difficult. Herein we describe the utilisation of this technique in a case of ophthalmomyiasis interna. A 12-year-old boy was infested during a summer holiday in northern Norway, while visiting an area populated with reindeer. Following medical examination, a Diptera larva was surgically removed from the boy’s eye and tentatively identified from its morphological traits as Hypoderma tarandi (L.) (Diptera: Oestridae). Ultimately, DNA barcoding confirmed this impression. The larval cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) DNA sequence was matched with both profiles of five adult H. tarandi from the same region where the boy was infested, and other established profiles of H. tarandi in the Barcode of Life Data Systems (BOLD) identification engine.
ThepsbA-trnH intergenic region is among the most variable regions in the gymnosperm chloroplast genome. It is proposed as suitable for DNA barcodmg studies and is useful in phylogenetics at the species level. This region consists of two parts differing in their evolutionary characteristics: 1) the psbA 3'UTR (untranslated region) and 2) the psbA-trnH intergenic spacer. We compared the sequence and RNA secondary structure of the psbA 3'UTR across gymnosperms and found consensus motifs corresponding to the stem portions of the RNA stem-loop structures and a consensus TGGATTGTTATGT box. The psbA-trnH spacer is highly variable in length and composition. Tandem repeats that form stem-loop structures were detected in both the psbA 3' UTR and the psbA-trnH spacer. The presence of promoters and stem-loop structures in the psbA-trnH spacer and high sequence variation in this region suggest that psbA and trnH in some gymnosperms are independently transcribed. A comparison of chloroplast UTRs across gymnosperms offer clues to the identity of putative regulatory elements and information on selective constraints imposed on the chloroplast non-coding regions. The present study should inspire researchers to explore the full potential of the psbA-trnH non-coding sequence and to further stimulate its application in a broader spectrum of studies, not limited to phylogenetics and DNA barcoding.
15
63%
Muzeum i Instytut Zoologii PAN w Warszawie koordynuje badania wykorzystujące kod paskowy DNA, wykonywane w ramach powstałego Krajowego Banku DNA Roślin, Grzybów i Zwierząt.W skład tego konsorcjum naukowego wchodzi na razie 5 instytutów. Barkoding może przynosić nieocenioną pomoc w badaniach gatunkowej różnorodności biologicznej, w botanice, zoologii, mikologii oraz w naukach aplikacyjnych: rolnictwie, leśnictwie, medycynie, weterynarii, naukach o żywności, ochronie przyrody i innych.
17
Artykuł dostępny w postaci pełnego tekstu - kliknij by otworzyć plik
Content available

Oko oko z imperatorem

44%
Wszechświat
|
2010
|
tom 111
|
nr 07-09
229-233
In Poland, it has been found so far about 260 species of plant and fungi parasitic nematodes. Among the nematodes feeding on plants there are species that have the status of quarantine pests. Before taking the decision to control nematodes, it is necessary to identify the pest species. The identification of nematodes is difficult because of the paucity of easily scorable diagnostic morphological characters. Consequently, molecular identification tools could solve this problem. For molecular identification of species are suitable different PCR-based methods, DNA barcoding and DNA microarrays. The mitochondrial cytochrome oxidase c subunit 1 (COI) gene is one of the most popular markers for species identification across the animal kingdom. Species identification based on COI sequence received name DNA barcoding. DNA microarrays, first created 20 years ago, are well established and able to differentiate hundreds of specimens simultaneously. Microarray technologies, which involve hybridization of short specific probes to target DNA and subsequent detection of the hybridization signal, have been widely used as diagnostic tools.
Pierwsza strona wyników Pięć stron wyników wstecz Poprzednia strona wyników Strona / 1 Następna strona wyników Pięć stron wyników wprzód Ostatnia strona wyników
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.