Wstępne badania nad tworzeniem mapy genetycznej Salix z wykorzystaniem markerów RAPD

• Autorzy: Przyborowski J.A. , Sulima P. , Jozwik M.

Warianty tytułu

EN

Preliminary studies on the construction of genetic map of Salix using the RAPD markers

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W pracy prezentowane są wstępne wyniki badań nad tworzeniem mapy genetycznej Salix, których podstawą jest populacja mapująca, składająca się z 70 mieszańców F1 wyprowadzonych z krzyżówki dwóch odmian szwedzkich: żeńskiej Tordis [(5. schwerinii x S. viminalis) x S. viminalis] i męskiej Torhild [(S. schwerinii x S. viminalis) x S. viminalis]. Zastosowano 32 startery RAPD i otrzymano łącznie 186 produktów amplifikacji, z czego 44,08% stanowiły produkty polimorficzne. Z uzyskanych 82 polimorficznych produktów, 45 wykazywało wymaganą segregację 1:1, a 28 z 45 spełniało dodatkowe kryterium obecności lub jej braku u jednej z form rodzicielskich mieszańców tworzących populację (pseudo testcross). Przeprowadzone z użyciem programu JoinMap®4.0 grupowanie wstępne pozwoliło na wyodrębnienie dwóch grup, zawierających odpowiednio 4 i 2 markery, zaś pozostałe markery spełniające kryteria mapowania wykazywały zbyt słaby stopień sprzężenia i nie zostały na tym etapie badań przyporządkowane do jakiejkolwiek grupy.

EN

The work describes preliminary results of the investigations on the construction of the genetic map of Salix. The basis of the investigations was a mapping population consisting of 70 F1 hybrids after the cross of two Swedish cultivars: female Tordis [(S. schwerinii x S. viminalis) x S. viminalis] and male Torhild [(S. schwerinii x S. viminalis) x S. viminalis]. 32 RAPD primers were applied and totally 186 amplification products were obtained, 44% of which were polymorphic. From the total of 82 polymorphic products, 45 showed the required segregation 1:1, and 28 from 45 met the additional requirements of the presence or lack of product in one of the parental form (the pseudo testcross). The preliminary grupping using JoinMap®4.0 software permitted to distinguish two groups, containing respectively 4 and 2 markers. The remaining markers complying the requirements of mapping showed the weak degree of linkage and at this stage of investigations they were not assigned to any group.

Słowa kluczowe

PL

hodowla roslin; mapy genetyczne; markery DNA; markery molekularne; markery RAPD; Salix; wierzba

EN

plant breeding; gene map; DNA marker; molecular marker; RAPD marker; Salix; willow

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2010
• Tom: 555
• Opis fizyczny: s.621-627,tab.,bibliogr.

Twórcy

autor

Przyborowski J.A.

• Katedra Hodowli Roślin i Nasiennictwa, Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie, Plac Łódzki 3, 10-724 Olsztyn-Kortowo

autor

Sulima P.

autor

Jozwik M.

Bibliografia

• Björkman C., Högland S., Eklund K., Larsson S. 2000. Effects of leaf beetle damage on stem wood production in coppicing willow. Agric. for Entomol. 2: 131-139.
• Gullberg U. 1993. Towards making willows pilot species for coppicing production. Fo Chron 69: 721-726.
• Hanley S., Barker J.H.A., Ooijen W.V., Adam C., Harris S.L., Ahman I., Larsson S., Karp A. 2002. A genetic linkage map of willow (Salix viminalis) based on AFLP and microsatellite markers. Theor. Appl. Genet. 105: 1087-1096.
• Larsson S. 2001. Commercial varieties from the Swedish willow breeding programme. Aspects of App. Bio.: Biomass and Energy Crops II. 65: 193-198.
• Li C., Yeh F.C. 2002. QTLs for western gall rust (Endocronartium herknessii) resistance in lodgepole pine (P. contoria spp. latifolia). For. Genet. 9(2): 137-144.
• Lindegaard K.N., Barker J.H.A. 1997. Breeding willows for biomass. Aspects Appl. Biol. 49: 155-162.
• Lindegaard K.N., Parfitt R.I., Donaldson G., Hunter T., Dawwson W.M., Forbes E.G.A., Carter M.M., Whinney C.C., Whinney J.E., Larsson S. 2001. Comparative trials of elite Swedish and UK biomass willow varieties. Aspects of App. Bio.: Biomass and Energy Crops II. 65: 183-192.
• Newcombe G., Bradshaw H.D. 1996. Quantitative trait loci conferring resistance in hybrid poplar to Septoria populicola the cause of leaf spot. Can. J. For. Res. 26: 1943-1950.
• Pei M.H., Ruiz C., Bayon C., Hunter T. 2004. Rust resistance in Salix to Melampsora larici-epitea. Plant Pathology 53: 770-779.
• Rönnberg-Wästljung A.C., Tsarouhas V., Semerikov V., Lagercrantz U.: 2003. A genetic linkage map of a tetraploid Salix viminalis x Salix dasyclados hybrid based on AFLP markers. For. Genet. 10(3): 185-194.
• Rönnberg-Wästljung A.C., Glynn C., Weih M. 2005. QTL analyses of drought tolerance and growth for a Salix dasyclados x Salix viminalis hybrid in contrasting water regimes. Theor. Appl. Genet. 110: 537-549.
• Semerikov V., Lagercrantz U., Tsarouhas V., Rönnberg-Wästljung A.C., Alstrom-Rapaport C., Lascaux M. 2003. Genetic mapping of sex-linked markers in Salix viminais L. Heredity 91: 293-299.
• Stam P. 1993. Construction of integrated genetic linkage maps by means of a new computer package: JoinMap. The Plant Journal 3: 739-744.
• Sulima P., Przyborowski J.A., Załuski D. 2009. RAPD markers reveal genetic diversity in Salix purpura L. Crop Sci. 49: 857-863.
• Szczurowski S., Stolarski M., Tworkowski J., Przyborowski J., Klasa A. 2005. Productivity of willow coppice plants grown in short rotations. Plant Soil Environ. 51(9): 423-430.
• Tharakan P.J., Volk T.A., Lindley C.A., Abrahamson L.P., White E.H. 2005. Evaluating the impact of three incentive programs on co-firing willow biomass with coal in New York State. Energy Policy 33(3): 337-347.
• Tsarouhas V., Gullberg U., Lagercrantz U. 2002. An AFLP and RFLP linkage map and quantitative trait locus (QTL) analysis of growth traits in Salix. Theor. Appl. Genet. 105: 277-288.
• Tsarouhas V., Gullberg U., Lagercrantz U. 2004. Mapping of quantitative trait loci (QTLs) affecting autumn freezing resistance and phenology in Salix. Theor. Appl. Genet. 108: 1335-1342.
• Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V. 1990. DNA polymorphism amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucl. Acid Res. 18: 6531-6535.