Genetic distance between the Polish Red, Czech Red and German Red cattle estimated based on selected loci of protein coding genes and DNA microsatellite sequences

• Autorzy: Zaton-Dobrowolska M. , Citek J. , Filistowicz A. , Rehout V. , Szulc T.

Warianty tytułu

PL

Dystans genetyczny między rasami polską czerwoną, czeską czerwoną a niemiecką czerwoną szacowany na podstawie wybranych loci genów kodujących białka i mikrosatelitarnych sekwencji DNA

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

The investigations covered the representatives of three red cattle breeds: Polish Red (PR, n = 65),Czech Red (CR, n = 54) and German Red (GR, n = 28). The allele frequency was analysed for five protein genes: CSN3, LGB, GH, PRL and Pit-1 as well as 13 microsatellite sequences. In the populations of PR and GR cattle the frequencies of protein loci were similar, with a clearly marked domination of one allele. Only in the CR cattle, allele frequencies were similar for all the protein loci analysed (with the exception of Pit-1) with no clear dominance of any one allele. Out of the 13 microsatellite sequences analysed six showed a similar distribution of the allele frequencies in all three breeds, while the remaining ones were characterized by a wide variation. On the basis of the results obtained the genetic distance was estimated between breeds. The smallest genetic distance was observed between the PR and GR population. In turn, between the PR and CR as well as CR and GR populations, the genetic distance proved to be similar, the most similar being obtained on the basis of Nei method.

PL

Badania obejmowały trzy rasy bydła czerwonego − polską czerwoną (PR, n = 65), czeską czerwoną (CR, n = 54) i niemiecką czerwoną (GR, n = 28). Przeanalizowano frekwencje alleli dla pięciu genów białek: CSN3, LGB, GH, PRL i Pit-1 oraz 13 sekwencji mikrosatelitranych. W populacjach PR i GR frekwencje w loci białek układały się podobnie, z wyraźnie zaznaczoną przewagą jednego z alleli. Jedynie w rasie CR we wszystkich analizowanych loci białek, oprócz Pit-1, frekwencje alleli były zbliżone i nie zaznaczała się wyraźna dominacja częstości występowania jednego z nich. Sześć z 13 sekwencji mikrosatelitarnych miało podobny rozkład frekwencji alleli we wszystkich trzech rasach, natomiast pozostałe charakteryzowały się znacznym zróżnicowaniem. Na podstawie uzyskanych wyników oszacowano dystans genetyczny między rasami. Najmniejszy stwierdzono między populacją PR a GR.Natomiast między populacjami PR a CR oraz CR a GR wielkości dystansu kształtowały się podobnie, a najbardziej wyrównane wyniki uzyskano metodą Nei’a.

• Wydawca: -
• Czasopismo: Animal Science Papers and Reports
• Rocznik: 2007
• Tom: 25
• Numer: 1
• Opis fizyczny: p.45-54,ref.

Twórcy

autor

Zaton-Dobrowolska M.

• Department of Genetics and Animal Breeding, Wroclaw University of Environmental and Life Sciences, Kozuchowska 7, 51-631 Wroclaw, Poland

autor

Citek J.

• Faculty of Agriculture, University of South Bohemia, Studentska 13, 370 05 Ceske Budejovice, Czech Republic

autor

Filistowicz A.

• Institute of Animal Breeding, Wroclaw University of Environmental and Life Sciences, Chelmonskiego 38c, 51-630 Wroclaw, Poland

autor

Rehout V.

• Faculty of Agriculture, University of South Bohemia, Studentska 13, 370 05 Ceske Budejovice, Czech Republic

autor

Szulc T.

• Institute of Animal Breeding, Wroclaw University of Environmental and Life Sciences, Chelmonskiego 38c, 51-630 Wroclaw, Poland

Bibliografia

• BISHOP M.D., KAPPES S.M., KEELE J.W., STONE R.T., SUNDEN S.L.F., HAWKINS G.A.,SOLINAS TOLDO S., FRIES R., GROSZ M.D., YOO J., BEATTIE C.,W. 1994 − A genetic linkage map for cattle. Genetics 136, 619-639.
• ČITEK J., ŘEHOUT V., HAJIČ F., KOŠVANEC K., NEBOLA M., ŠOCH M., 1997 − Genotyping of milk proteins in Czech Red breed cattle and their hybrids. Agriculture 43(7), 508-515.
• ČITEK J., FILISTOWICZ A., ŘEHOUT V., NEUBAUEROVÁ V., 2000 − Comparison of growth hormone and kappa-casein gene polymorphism in Polish Red and German Red cattle breeds. Journal of Applied Genetics 41(3), 181-185.
• ČITEK J., ŘEHOUT V., 2001 − Genetic diversity in cattle evaluated by microsatellites and protein markers. Czech Journal of Animal Science 46, 393-400.
• DYBUS A., 2002 − Associations between Leu/Val polymorphism of growth hormone gene and milk production traits in Black-and-White cattle. Archiv für Tierzucht 45(5), 421-428.
• DYBUS A., KMIEĆ M., SOBEK Z., PIETRZYK W., WIŚNIEWSKI B., 2003 − Associations between polymorphisms of growth hormone releasing hormone (GHRH) and pituitary transcription factor 1 (PIT1) genes and production traits of Limousine cattle. Archiv für Tierzucht 46 (6), 527-534.
• DYBUS A., SZATKOWSKA I., CZERNIAWSKA-PIĄTKOWSKA E., GRZESIAK W., WÓJCIK J., RZEWUCKA E., ZYCH S., 2004 − PIT1 – HinfI gene polymorphism and its associations with milk production traits in polish Black-and-White cattle. Archiv für Tierzucht 47 (6), 557-563.
• FELSENSTEIN J., 1993 − PHYLIP (Phylogeny Inference Package), version 3.5c. Department of Genetics, University of Washington, Seattle, WA.
• Ferretti L., LEONE L., PILLA F., ZHANG Y., NOCART M., GUERIN G., 1994 − Direct characterization of bovine microsatellites from cosmids polymorphism and synteny maping. Animal Genetics 25, 209-214.
• GEMMELL N., AKIYAMA S., 1996 − An efficient method for the extraction of DNA from vertebrates tissues. Trends in Genetics 12, 338-339.
• GRAML R., OHMAYER G., PIRCHNER F., ERHARD L., BUCHBERGER J., MOSTAGEER A.,1986 − Biochemical polymorphism in Egyptian Baladi cattle and their relationship with other breeds.Animal Genetics 17, 61-76.
• GROSCLAUDE F., AUPETIT R.Y., LEFEBVRE J., MERIAUX J.C., 1990 − Essai d’analyse des relations génétiques entre les races bovines françaises à l’aide du polymorphisme biochimique.Genetique, Selection, Evolution 22, 317-338.
• GRZYBOWSKI G., PRUSAK B., 2004a − Genetic variation in nine European cattle breeds as determined on the basis od microsatellite markers. II Gene migration and denetic distance. Animal Science Papers and Reports 22(1), 37-44.
• GRZYBOWSKI G., PRUSAK B., 2004b − Genetic variation in nine European cattle breeds as determined on the basis od microsatellite markers. III Genetic integrity of the Polish Red cattle included in the breeds preservation programme. Animal Science Papers and Reports 22(1), 45-56.
• JUSZCZAK J., ERHARDT G., KUCZAJ M., ZIEMIŃSKI R., PANICKE L., 2001 − Zusammenhang zwischwen κ-Casein und β-Lactoglobulin-Varianten mit der Milchleistung ind der nutzungsdauer von Rindern der Rassen Schwarzbuntes Rind und Polnisches Rotvieh. Archiv für Tierzucht 44 (3),239-249.
• KIDD K.K., CAVALLI-SFORZA L.L., 1974 − The role of genetic drift in the differentiations of Icelandic and Norwegian cattle. Evolution 28, 381-395.
• KLAUZIŃSKA M., 2002 − Polimorfizm regionów 5’-flankujących genów GH, GHRH, prolaktyny i miostatyny bydła (Polymorphism within 5’ flanking regions of GH, GHRH, prolactin and myostatin genes in cattle). In Polish. Thesis. Institute of Genetics and Animal Breeding, Polish Academy of Sciences, Jastrzębiec.
• LANG K.D., PLANTE Y., 1994 − Fifteen polymorphic bovine dinucleotide microsatellites. Animal Genetics 25(5), 373.
• LUBIENIECKA J., 2001 − Struktura genetyczna wybranych ras bydła hodowanych w Polsce określona na podstawie polimorfizmu loci mikrosatelitów DNA (Genetic structure of selected cattle breeds bred in Poland as estimated based on DNA microsatellites loci). In Polish. Thesis. Institute of Genetics and Animal Breeding, Polish Academy of Sciences, Jastrzębiec.
• MEDRANO J.F., AGUILAR-CORDOVA E., 1990 − Polymerase chain reaction − amplification of bovine beta-lactoglobulin genoic sequences and identification of genetic variants by RFLP analysis.Animal Biotechnology 1, 73.
• MICEIKIENÈ I., PEČIULAITIENÈ N., BALTRÈNAITÈ L., SKINKYTÈ R., INDRIULYTÈ R.,2006 − Association of cattle genetic markers with performance traits. Biologija 1, 24-29
• MITRA A., SCHLEE P., BALAKRISHMAN C.R., PIRCHNER F., 1995 − Polymorphisms at growth-hormone and prolactin loci in Indian cattle and buffalo. Journal of Animal Breeding and Genetics 112, 71-74.
• MOAZAMI-GOUDARZI K., LALOË D., FURET J.P., GROSCLAUDE F., 1997 − Analysis of genetic relationships between 10 cattle breeds with 17 microsatellites. Animal Genetics 28, 338-345.
• MOORE S.S., BARENDSE W., BERGER K.T., ARMITAGE S.M., HETZEL D.J., 1992 − Bosine and ovine DNA microsatellites from the EMBL and GENBANK databases. Animal Genetics 23(5),463- 467.
• MOORE S.S., BYRNE K., BERGER K.T., BARENDSE W., MCCARTHY F., WOMACK J.E., 1994 − Characterization of 65 bovine microsatellites. Mammalian Genome 5, 84-90.
• ŘEHOUT V., ČITEK J., MAŠKOVÁ J., 1998 − Genetické distance mezi analyzovanými plemeny skotu. XVIII Genetics Days, Book of Abstracts, Ceske Budejovice, 169.
• RENAVILLE R., GENGLER N., BERTOZZI C., MORTIAUXF., BURNY A., PORTETELLE D.,1997 − Pit-1 gene polymorphism, milk yield, and conformation traits for Italian Holstein-Friesian bulls. Journal of Dairy Science 80, 3431-3438.
• SCHLEE P., ROTTMANN O., BUCHBERGER J., GRAML R., AUMANN J, BINSER R., PIRCHNER F., 1992 − Die Milchproteingene des Fleckviehbullen „Haxl“ und dessen Einfluss auf die Allelfrequenzen. Züchtungskunde 64, 312-322.
• SKINKYTÈ R., ZWIERZCHOWSKI L., RIAUBAITÈ L., BALTRÈNAITÈ L., MICEIKIENÈ I.,2005 − Distribution of allele frequencies important to milk production traits in Lithuanian Black-and-White and Lithuanian Red cattle. Veterinarija ir Zootechnika 31(53), 93-97.
• SØRENSEN P., GROCHOWSKA R., HOLM L., HENRYON M., LØVENDAHL P., 2002 −Polymorphism in the bovine growth hormone gene affects endocrine release in dairy calves. Journal of Dairy Science 85, 1887-1893.
• WOOLLARD L., SCHMITZ C.B., FREEMAN A.E., TUGGLE C.K., 1994 − HinfI polymorphism at the bovine Pit 1 locus. Journal of Animal Science 72, 3267.
• ZWIERZCHOWSKI L., KRZYŻEWSKI J., STRZAŁKOWSKA N., SIADKOWSKA E.,RYNIEWICZ Z., 2002 − Effects of polymorphism of growth hormone (GH), Pit-1, and leptin (LEP)genes, cow’s age, lactation stage and somatic cell count on milk yield and composition of Polish Black-and-White cows. Animal Science Papers and Reports 20(4), 213-227.