Metylacja genów rRNA w tkankach kalusowych pszenicy

• Autorzy: Dabrowska G. , Zubek-Rzeplinska W. , Goc A. , Szechynska-Hebda M. , Filek M.

Warianty tytułu

EN

Methylation of rRNA genes in callus tissue of wheat

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Poziom metylacji DNA u roślin jest modyfikowany podczas rozwoju i różnicowania. Przeprowadzone badania miały na celu zbadanie poziomu metylacji cytozyny w sekwencjach kodujących rRNA. Materiał do badań stanowiły tkanki kalusowe regenerujące i nieregenerujące otrzymane z niedojrzałych kwiatostanów oraz zarodków pszenicy. DNA genomowe trawiono enzymami HpaII i MspI, różniącymi się wrażliwością na metylację rozpoznawanej sekwencji CCGG. Zastosowano metodę hybrydyzacji Southern dla uwidocznienia fragmentów hybrydyzujących do sond molekularnych 18S rRNA grochu oraz 25S rRNA pszenicy. Wyniki hybrydyzacji potwierdzają, że cytozyny w rRNA w tkankach kalusowych regenerujących i niezdolnych do regeneracji otrzymane z niedojrzałych kwiatostanów oraz zarodków pszenicy są zmetylowane. Nie wykazano różnic w poziomie metylacji pomiędzy poszczególnymi badanymi tkankami kalusowymi.

EN

Methylation level of DNA changes during plant development and differentiation. This study was undertaken to determinate methylocytosine in the sequence encoding rRNA. As an experimental system, the regenerating and nonregenerating callus originated from immature inflorescences and embryos was used. The genomic DNA was digested with HpaII and MspI, different in their sensitivity to methylation of the CCGG sequence. Southern hybridization was carried out with molecular probe of bean 18S rRNA and triticum 25S rRNA. Results confirmed that the cytosines in rRNA of regenerating and nonregenerating callus originated from immature inflorescences and embryos are methylated. The differences in the methylation level of various tissues were not detected.

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2009
• Tom: 534
• Opis fizyczny: s.23-30,fot.,bibliogr.

Twórcy

autor

Dabrowska G.

• Zakład Genetyki, Instytut Biologii Ogólnej i Molekularnej, Uniwersytet Mikołaja Kopernika, ul.Gagarina 9, 87-100 Toruń

autor

Zubek-Rzeplinska W.

autor

Goc A.

autor

Szechynska-Hebda M.

autor

Filek M.

Bibliografia

• Attwood J.T., Yung R.L., Richardson B.C. 2002. DNA methylation and the regulation of gene transcription. Cell Mol. Life Sci. 59: 241-257.
• Costello J.F., Plass C. 2001. Methylation matters. J. Med. Genet. 38: 285-303.
• Doyle J.J., Doyle J.L. 1987. Isolation of DNA from fresh plant tissue. Focus 12: 13-15.
• Feinberg A.P., Vogelstein B. 1983. A technique for radiolabeling DNA restriction endonuclease fragments to high specific activity. Anal. Biochem. 132: 6-13.
• Freitag M., Selker E.U. 2005. Controlling DNA methylation: many roads to one modification. Curr. Opin. Genet. Dev. 15: 1-9.
• Gerlach W.L., Bedbrook J.R. 1979. Cloning and characterization of ribosomal RNA genes from wheat and barley. Nucl. Acids Res. 7: 1869-1885.
• Jorgensen R.A., Cuellar R.E., Thompson W.F., Kavanagh T.A. 1987. Structure and variation in ribosomal RNA genes of pea. Plant Mol. Biol. 8: 3-12.
• Koetsier P.A., Schorr J., Doerfler W. 1993. A rapid optimizer protocol for downward alkaline southern blotting of DNA. BioTechniques 15: 260-262.
• Kozłowska W., Rybczyński J.J. 1994. Somatyczna embriogeneza u traw i zbóż. Prace Ogrodu Botanicznego PAN 5/6: 131-138.
• Lo Schiavo F., Pitto L., Ginliano G., Tortii G., Nutri-Ronchi V., Marazziti D., Vergaro R., Orselli S., Tezzi M. 1989. DNA methylation of embryogenic carrot cell cultures and its variations as caused by mutation, differentiation, hormones and hypomethylating drugs. Theor. Appl. Genet. 77: 325-331.
• Marcińska I., Szechyńska-Hebda M., Biesaga-Kościelniak J., Filek M. 2001. Applicability of Polish winter wheat (Triticum aestivum L.) cultivars to long-term in vitro culture. Cereal Res. Comm. 29: 127-134.
• Morrish F.M., Vasil I.K. 1989. DNA Methylation and embryogenic competence in leaves and callus of napiergrass (Pennisetum purpureum Schum.). Plant Physiol. 90: 37-40.
• Murashige T., Skoog F. 1962. A revised medium for rapid growth and bioassays with tobacco tissue cultures. Physiol. Plant. 15: 473-497.
• Olszewska M., Sakowicz T. 1991. Metylacja DNA u roślin. Post. Biol. Kom. 4: 253-262.
• Palmgren G., Mattson O., Okkels F.T. 1991. Specific levels of DNA methylation in various tissues, cell lines, and cell types of Daucus carota. Plant Physiol. 95: 174-178.
• Pedrali-Noy G., Bernacchia G., do Rosario Alvelos M., Cella R. 2003. Daucus carota cells contain specific DNA methyltransferase inhibitors that interfere with somatic embryogenesis. Plant Biol. 5: 383-392.
• Prakash A.P., Kush A., Lakshmanan P., Kumar P.P. 2003. Cytosine methylation occurs in a CDC48 homologue and a MADS-box gene during adventitious shoot induction in Petunia leaf explants. J. Exp. Bot. 54: 1361-1371.
• Rabinowicz P.D., Palmer L.E., May B.P., Hemann M.T., Lowe S.W., McCombie W.R., Martienssen R.A. 2003. Genes and transposons are differentially methylated in plants, but not in mammals. Genome Res. 13: 2658-2664.
• Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. 1989a. Molecular cloning: a laboratory manual. Wydanie 2. Cold Springer Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York: 1.38-1.39.
• Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. 1989b. Molecular cloning: a labolatory manual. Wydanie 2. Cold Springer Harbor Labolatory Press, Cold Spring Harbor, New York: 10.30-6.31.
• Sardana R., Odell M., Flavell R. 1993. Correlation between the size of the intergenic regulatory region, the status of cytosine methylation of rRNA genes and nucleolar expression in wheat. Mol. Gen. Genet. 236: 155-162.
• Tchorbadjieva M.I., Pantchev I.Y. 2004. DNA methylation and somatic embryogenesis of orchardgrass (Dactylis glomerata L.). Bulg. J. Plant Physiol. 30: 1-3.
• Woo H.R., Richards E.J. 2008. Natural variation in DNA methylation in ribosomal RNA genes of Arabidopsis thaliana. BMC Plant Biol. 8: 92.
• Wróblewski T.A. 1994. Process of somatic embryogenesis-detailed characteristics. Post. Biol. Kom. 4: 11-32.

Uwagi

PL

Rekord w opracowaniu