Nicienie powodujące straty w produkcji roślinnej w Polsce i metody ich szybkiej identyfikacji

• Autorzy: Wolny S. , Winiszewska G. , Dmowska E. , Malewski T.

Warianty tytułu

EN

Nematodes causing loss of production plant in Poland and methods of their rapid identification

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

EN

In Poland, it has been found so far about 260 species of plant and fungi parasitic nematodes. Among the nematodes feeding on plants there are species that have the status of quarantine pests. Before taking the decision to control nematodes, it is necessary to identify the pest species. The identification of nematodes is difficult because of the paucity of easily scorable diagnostic morphological characters. Consequently, molecular identification tools could solve this problem. For molecular identification of species are suitable different PCR-based methods, DNA barcoding and DNA microarrays. The mitochondrial cytochrome oxidase c subunit 1 (COI) gene is one of the most popular markers for species identification across the animal kingdom. Species identification based on COI sequence received name DNA barcoding. DNA microarrays, first created 20 years ago, are well established and able to differentiate hundreds of specimens simultaneously. Microarray technologies, which involve hybridization of short specific probes to target DNA and subsequent detection of the hybridization signal, have been widely used as diagnostic tools.

Słowa kluczowe

PL

barkoding DNA; czynniki srodowiska; dynamika rozwoju; identyfikacja; lancuchowa reakcja polimerazy; metody oznaczania; mikromacierze DNA; nicienie; rosliny uprawne; szkodniki roslin; wykaz gatunkow; wystepowanie; zagrozenia roslin

EN

DNA barcoding; environmental factor; development dynamics; identification; polymerase chain reaction; determination method; nematode; cultivated plant; plant pest; species composition; occurrence; plant threat

• Wydawca: -
• Czasopismo: Progress in Plant Protection
• Rocznik: 2010
• Tom: 50
• Numer: 4
• Opis fizyczny: s.1766-1775,tab.,bibliogr.

Twórcy

autor

Wolny S.

• Muzeum i Instytut Zoologii Polskiej Akademii Nauk, ul.Wilcza 64, 00-679 Warszawa

autor

Winiszewska G.

autor

Dmowska E.

autor

Malewski T.

Bibliografia

• Brzeski M.W. 1998. Nematodes of Tylenchina in Poland and Temperate Europe. Museum i Instytut Zoologii PAN, Warszawa, 397 ss.
• Chen W., Seifert K.A., Levesqu C.A. 2009. A high density COX1 barcode oligonucleotide array for identification and detection of species of Penicillium subgenus Penicillium. Mol. Ecol. Resources 9 (s1): 114–129.
• Derycke S., Vanaverbeke J., Rigaux A., Backeljau T., Moens T. 2010. Exploring the use of cytochrome oxidase c subunit 1 (COI) for DNA Barcoding of Free-Living Marine Nematodes. PLoS One. 2010; 5(10): e13716.
• Elsasser S.C., Floyd R., Hebert P.D.N., Schulte-Hostedde A.I. 2009. Species identification of North American guinea worms (Nematoda: Dracunculus) with DNA barcoding. Mol. Ecol. Resources 9: 707–712.
• Floyd R., Rogers A.D., Lambshead P.J.D., Smith C.R. 2005. Nematode-specific PCR primers for the 18S small subunit rRNA gene. Mol. Ecol Notes 5 (3): 611–612.
• Nicolaisen M., Justesen A.F., Thrane U., Skouboe P., Holmstrom K. 2005. An oligonucleotide microarray for the identification and differentiation of trichothecene producing and nonproducing Fusarium species occurring on cereal grain. J. Microbiol Methods 62 (1): 57–69.
• Ratnasingham S., Hebert P.D.N. 2007. BOLD : The Barcode of Life Data System (www.barcodinglife.org). Mol. Ecol. Notes 7: 355–364.
• Rozporządzenie Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi z dnia 21 lutego 2008 r. w sprawie zapobiegania wprowadzaniu i rozprzestrzenianiu się organizmów kwarantannowych (Dz. U. Nr 46, poz. 272).
• Rozporządzenie Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi z dnia 12 maja 2010 r. zmieniające rozporządzenie w sprawie wymagań dotyczących roślin, produktów roślinnych lub przedmiotów pochodzących z Republiki Portugalskiej podatnych na porażenie przez Bursaphelenchus xylophilus (Steiner et Buhrer) Nickle et al. (węgorka sosnowca), przemieszczanych lub wprowadzanych na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej (Dz. U. nr 87 poz. 570).
• Rozporządzenie Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi z dnia 13 października 2010 r. w sprawie szczegółowych sposobów postępowania przy zwalczaniu i zapobieganiu rozprzestrzeniania się mątwika ziemniaczanego (Globodera rostochiensis) i mątwika agresywnego (Globodera pallida) (Dz. U. nr 196, poz. 1303).