PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
2013 | 12 | 1 |

Tytuł artykułu

Mikroflora drożdżowa naturalnie fermentowanych warzyw

Warianty tytułu

EN
Yeasts microflora of naturally fermented vegetables

Języki publikacji

PL

Abstrakty

PL
W prezentowanej pracy postanowiono ustalić, które gatunki drożdży zasie­dlają domowe fermentowane produkty: kiszone ogórki, kiszoną kapustę oraz kiszone mie­szane warzywa. Z wybranych do badań kiszonek wyizolowano 75 szczepów drożdży, które identyfikowano na podstawie o testu API (bioMerieux), amplifikacji wybranych regionów genów rDNA (NS3-ITS4) i analizy restrykcyjnej oraz skanowania genomu w poszukiwaniu sekwencji mikrosatelitarnych. Za dominującą mikroflorę wszystkich kiszonych produktów uznano drożdże Saccharomyces cerevisiae (38,7% izolatów) i Yarrowia lipolytica (25,6% izolatów). Z kiszonych produktów wyizolowano także szczepy należące do następujących gatunków: Pichia etchellsii, P. ohmerii, Candida holmii, C. pelliculosa i Shizosaccharomy- cesjaponicus. Wykorzystując API 32C, niektóre izolaty zidentyfikowano tylko do rodzaju, a z uwagi na ubogie bazy danych szczepów wzorcowych nie wszystkie izolaty udało się jednoznacznie zidentyfikować na poziomie gatunku technikami molekularnymi. Wyniki badań pozwoliły na rozbudowanie tworzonej bazy danych o nowe szczepy drożdży (szcze­py o odmiennych profilach restrykcyjnych), co w przyszłości powinno ułatwić prowadze­nie prac identyfikacyjnych.
EN
This research aims at determining which yeast types can be encountered in the following home products: pickled cucumbers, sauerkraut and mixed pickled vegetables. Seventy-five strains of yeast have been isolated from the pickles selected for the research. These strains have been identified on the basis of API tests (bioMerieux), amplification of the selected regions of rDNA genes (NS3-ITS4) and restrictive analysis, as well as genome scanning, performed in order to detect microsatellite sequences. Yeast Saccharomyces cer- evisiae (38.7% isolates) and Yarrowia lipolytica (25.6% isolates) have been determined as a dominant microflora for the pickles. There have been also isolated strains belonging to the following types: Pichia etchellsii, P. ohmerii, Candida holmii, C. pelliculosa and Shizo- saccharomyces japonicus. With the use of API 32C, some isolates have been identified merely in accordance to their type, and due to a limited data base of model strains, not all the isolates have been possible to be classified on the level on their type with the support of molecular techniques. The obtained results of the research allowed to supply the database with new yeast strains (strains of different restrictive profiles), which should consequently facilitate conducting the identifying works.

Wydawca

-

Rocznik

Tom

12

Numer

1

Opis fizyczny

s.19-35,rys.,tab.,fot.,bibliogr.

Twórcy

autor
  • Katedra Biotechnologii i Mikrobiologii Żywności, Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, ul.J.Chełmońskiego 37/41, 51-630 Wrocław
autor
  • Katedra Biotechnologii i Mikrobiologii Żywności, Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, ul.J.Chełmońskiego 37/41, 51-630 Wrocław
autor
  • Państwowa Wyższa Szkoła Zawodowa im.Witelona w Legnicy, Legnica
  • Katedra Biotechnologii i Mikrobiologii Żywności, Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, ul.J.Chełmońskiego 37/41, 51-630 Wrocław
autor
  • Katedra Biotechnologii i Mikrobiologii Żywności, Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, ul.J.Chełmońskiego 37/41, 51-630 Wrocław

Bibliografia

  • Abriouel H., Omar N.B., Pulido R.P., Lopez L.R., Ortega E., Canamero M.M, Galvez A., 2008. Vegetable fermentations [in:] Molecular techniques in the microbial ecology of fermented foods, (eds.) Cocoli L., Ercolini D., Springer, NY. 145-161.
  • Andrighetto C., Psomas E., Tzanetakis N., Suzzi G., Lombardi A., 2000. Randomly amplified poly­morphic DNA (RAPD) for the identification of yeasts isolated from dairy products. Letters in Applied Microbiology, 30, 5-9.
  • Baleiras-Couto M.M., Eijsma B., Hofsta H., Huisin't Veld J.H., van der Vossen J.M. B.M.,1996. Evaluation of molecular typing techniques to assign genetic diversity among Saccharomyces cerevisiae strains. Applied and Environmental Microbiology, 62, 41-46.
  • Barszczewski W., Robak M., 2004. Differentiation of contaminating yeasts in brewery by PCR-based techniques. Food Microbiology 21, 227-231.
  • Barszczewski W., Robak M., 2006. PCR-based differentiation and homology of brewing and type strains of the genus Saccharomyces. J. Inst. Brew., 112(2), 165-172.
  • Bougnoux M-E., Aanensen D.M., Morand S., Theraud M., Spratt B.G., d'Enfert Ch., 2004. Multilocus sequence typing of Candida albicans: strategies, data exchange and applications. Infec­tion, Genetics and Evolution, 4, 243-252.
  • Cocolin L., Campolongo S., Gorra R., Rolle L., Rantsiou K., 2011. Saccharomyces cerevisiae bio­diversity during the brewing process of an artisanal beer: A preliminary study. J. Inst. Brew. 117(3), 352-358.
  • de Barros Lopes M., Soden A., Henschke P.A., Langridge P., 1996. PCR differentiation of com­mercial yeast strains using intron splice site primers. Applied and Environmental Microbiology, 62, 4514-4520.
  • Giraffa G., Carminati D., 2008. Molecular techniques in food fermentation: principles and applica­tions [in:] Molecular techniques in the microbial ecology of fermented foods (eds.) Cocolin L., Ercolini D., Springer, NY. 1-30.
  • Fakharedine N., Ouadghiri M, Amar M., Winterton P., Hafidi M., Ouhdouch Y., 2011. Isolation and identification of a yeast strain involved in the degradation of Marrakech olive mill wastewater. Eurasia J. Biosci. 5, 127-137.
  • Gromadka R., Rytka J., 2000. Ribosome biogenesis and nucleolar function in yeast. Cellular and Molecular Biology Letters, 5, 191-216.
  • Guenaoui C., Mang S., Figliuolo G., Neffati M., 2013. Diversity in Allium ampeloprasum: from small and wild to large and cultivated. Genet. Resour. Crop Evol. 60, 97-114.
  • Hublot C., Guyot J-P., 2008. Other fermentations [in:] Molecular techniques in the microbial ecology of fermented foods (eds.) Cocolin L., Ercolini D., Springer, NY. 208-224.
  • Jacobsen M.D., Bougnoux M-E., d'Enfert Ch., Odds F.C., 2008. Multilocus sequence typing of Candida albicans isolates from animals, Research in Microbiology, 159, 436-440.
  • Las Heras-Vazquez F.R., Mingorance-Cazorla L., Clemente-Jimenez C., Rodriguez-Vico F., 2003. Identification of yeast species from orange fruit and juice by RFLP and sequence analysis of the 5.8S rRNA gene and the two internal transcribed spacer. FEMS Yeast Research, 3, 3-9.
  • Lopandic K., Zelger S., Banszky L.K., Eliskases-Lechner F., Prillinger H., 2006. Identification of yeasts associated with milk products using traditional and molecular techniques. Food Micro­biology, 23(4), 341-350.
  • Loureiro V., Querol A., 1999. The prevalence and control of spoilage yeasts in food and beverages. Trends in Food Science and Technology, 10, 356-365.
  • Marciniak M., Robak M., 2012. PCR jako narzędzie do identyfikacji i różnicowania drobnous­trojów. Acta Sci. Pol. Biotechnologia 11(2), 5-16.
  • Mercado L., Dalcer A., Masuelli R., Combina M., 2007. Diversity of Saccharomyces strains on grapes and winery surfaces: Analysis of their contribution to fermentative flora of Malbec wine from Mendoza (Argentina) during two consecutive years. Food Microbiology, 24(4), 403-412.
  • Perez M.A., Gallego F.J., Hidalgo P., 2001. Evaluation of molecular techniques for the genetic char­acterization of Saccharomyces cerevisiae strains. FEMS Microbiology Letters, 205, 375-378.
  • Pham T., Wimalasena T., Box W.G., Koivuranta K., Storgards E., Smart K.A., Gibson B.R., 2011. Evaluation of ITS PCR and RFLP for differentiation and identification of brewing yeast and brewery 'Wild' yeast contaminants. J. Inst. Brew. 117(4), 556-568.
  • Piegza M., Barszczewski W., Witkowska D., Stempniewicz R., Robak M., 2006. Scanning of Geotrichum candidum genome by RFLP-PCR of rDNA and RAPD. EJPAU, Biotechnology, 9(3), art. 21.
  • Pitarch A., Abian J., Carrascal M., Sanchez M., Nombela C., Gil C., 2004. Proteomics-based identi­fication of novel Candida albicans anti-gens for diagnostic of systematic candidiasis in patient with underlying hematological malignancies. Proteomics, 10, 3084-3106.
  • Połomska X., Juszczyk P., Cadez N., Raspor P., Robak M., Wojtatowicz M., 2007. Comparison of physiological and PCR-RFLP rDNA identification of yeast species commonly fund in cheese. Pol. J. Food Nutr. Sci., 57(2), 221-226.
  • Rantsiou K., Cocolin L., 2008. Fermented meat products [in:] Molecular techniques in the micro­bial ecology of fermented foods (eds.) Cocolin L., Ercolini D., Springer, NY. 91-118.
  • Robak M., Baranowska K., Barszczewski W., Wojtatowicz M., 2005. RAPD jako metoda różnicowania i identyfikacji drożdży. Biotechnologia, 4(71), 143-156.
  • Senses-Ergul S., Agoston R., Belak A., Deak T., 2006. Characterization of some yeasts isolated from foods by traditional and molecular tests. Int. J. Food Microbiol., 108(1), 120-124.
  • Souciet J-L. i wsp., 2000. A set of yeast species for molecular evolution studies. FEBS Letters, 487, 1-10.
  • Tominaga T., 2004. Rapid identification of pickle yeasts by fluorescent PCR and microtemperature­gradient gel electrophoresis. FEMS Microbiology Letters, 238(1), 43-48.
  • Tornai-Lehoczki J., Dlauchy D., 2000. Delimination of brewing yeast strains using different mo­lecular techniques. Int. J. Food Microbiol., 62, 37-45.
  • Vogel R.F., Ehrmann M.A., 2008. Sourdough fermentations, [in:] Molecular techniques in the mi­crobial ecology of fermented foods. (eds) Cocolin L., Ercolini D., Springer, NY. 119-144.
  • Walczak E., Czaplińska A., Barszczewski W., Wilgosz M.,Wojtatowicz M., Robak M., 2007. RAPD with microsatellite as a tool for differentiation of Candida genus yeasts isolated in brewing. Food Microbiology, 24, 305-312.
  • Yamagishi H., Otsuta Y., Funahashi W., Ogata T., Sakai K., 1999. Differentiation between brew­ing and non-brewing yeasts using a combination of PCR and RFLP. J. Appl. Microbiol., 86, 505-513.
  • Zaręba D., Ziarno M., 2011. Alternatywne probiotyczne napoje warzywne i owocowe. Bromat. Chem. Toksykol. XLIV(2), 160-168.

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikatory

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.agro-db40e189-09aa-422c-9bc6-9738ec08f321
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.