PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
2010 | 62 | 3 |

Tytuł artykułu

Typowanie szczepow Pseudomonas aeruginosa opornych na karbapenemy technika PCR-RAPD

Warianty tytułu

EN
PCR-RAPD typing of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa strains

Języki publikacji

PL

Abstrakty

PL
W związku ze znacznym wzrostem w 2007 roku liczby izolacji szczepów Pseudomonas aeruginosa opornych na karbapenemy, przeprowadzono ge- notypowanie techniką PCR-RAPD 16 wybranych izolatów z materiału od chorych leczonych w Szpitalu Uniwersyteckim nr 1 im. dr. A. Jurasza w Bydgoszczy. W roku objętym badaniem od 78 chorych izolowano 125 szczepów P. aeruginosa o fenotypie oporności na imipenem i meropenem. Wykazano, że wszystkie badane szczepy były odmienne, dowodząc przydatności techniki PCR-RAPD w typowaniu szczepów pałeczek ropy błękitnej.
EN
P. aeruginosa rods are opportunistic pathogens responsible generally for nosocomial infections. Resistance to carbapenems, observed among them, is a serious threat due to ability to be transmitted between bacterial species. The aim of our study was to evaluate the usefulness of PCR-RAPD technique in typing of 16 carbapenem-resistant P. aeruginosa strains isolated in 2007 from different patients of University Hospital No. 1 of dr A. Jurasz Collegium Medicum of L. Rydygier in Bydgoszcz Nicolaus Copernicus University in Toruń. Study shows increasing frequency of isolation that type of strains when compared to 2006. Percentage of carbapenem-resistant isolates raised from 12,4% in 2006 to 22,9% in 2007. The majority of examined strains were obtained from patients of the Intensive Care Units (25,0%) and were isolated from bronchoalveolar lavage (25,0%), urine (25,0%) and wound swabs ( 18,8%) samples. Examined P. aeruginosa strains demonstrated resistance to doripenem (81,3%) and piperacillin (75,0%) and susceptibility to Colistin ( 100,0%), amikacin (81,3%), netilmicin and norfloxacin (75,0% each). Using PCR-RAPD amplification with 208 and 272 primers, 14 and 16 DNA patterns were obtained, respectively. Usefulness of PCR-RAPD in carbapenem-resistant P. aeruginosa strains typing was proved in case of strains presenting similar and/or different antimicrobials susceptibility patterns.

Wydawca

-

Rocznik

Tom

62

Numer

3

Opis fizyczny

s.211-219,rys.,fot.,bibliogr.

Twórcy

autor
  • Collegium Medicum w Bydgoszczy, Uniwersytet Mikolaja Kopernika w Toruniu, ul.M.Sklodowskiej-Curie 9, 85-094 Bydgoszcz

Bibliografia

  • 1. Ben Haj Khalifa A, Vu-Thien H, Pourcel C i inni. Phenotypic and genotypie (randomly amplified polymorphic DNA analysis and multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis) charaterization of 96 clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in the F. Bourguiba hospital (Monastir, Tunisia). Pathol Biol (Paris). 2010; 58: 84-8.
  • 2. Budak A, Paluchowska P, Włodarczyk D i inni. Genetyczna charakterystyka szczepów Acinetobacter baumannii oraz Pseudomonas aeruginosa izolowanych od chorych z zapaleniem płuc hospitalizowanych w oddziale intensywnej terapii. Med Dosw Mikrobiol. 2010; 62: 67-75.
  • 3. Cardoso O, Alves AF, Leitão R. Metallo-beta-lactamase VIM-2 in Pseudomonas aeruginosa isolates from a cystic fibrosis patient. Int J Antimicrob Agents. 2008; 31: 375-9.
  • 4. Clarke L, Moore JE, Millar BC, Crowe M i inni. Molecular epidemiology of Pseudomonas aeruginosa in adult patients with cystic fibrosis in Northern Ireland. Br J Biomed Sci. 2008; 65: 18-21.
  • 5. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. Eighteenth informational supplement (M100-S18). CLSI Wayne, Pa 2008.
  • 6. Coban AY, Ciftci A, Onuk EE i inni. Investigation of biofilm formation and relationship with genotype and antibiotic susceptibility of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from patients with cystic fibrosis. Mikrobiyol Bui. 2009; 43: 563-73.
  • 7. Deligianni E, Pattison S, Berrar D i inni. Pseudomonas aeruginosa cystic fibrosis isolates of similar RAPD genotype exhibit diversity in biofilm forming ability in vitro. BMC Microbiol. 2010; 10:38.
  • 8. Dzierżanowska D. Patogeny zakażeń szpitalnych. W: Zakażenia szpitalne. Red. D. Dzierżanowska, α-medica press, Bielsko-Biała. 2007, 38-59.
  • 9. Fiett J, Trzciński K, Hryniewicz W, Gniadkowski M. The use of molecular biology in the modeling of Pseudomonas aeruginosa strains recovered from nosocomial infections Przegl Epidemiol. 1998; 52: 427-40.
  • 10. Fothergill JL, White J, Foweraker JE i inni. Impact of Pseudomonas aeruginosa genomic instability on the application of typing methods for chronic cystic fibrosis infections. J Clin Microbiol. 2010; 48: 2053-9.
  • 11. Freitas AL, Barth AL. Typing of Pseudomonas aeruginosa from hospitalized patients: a comparison of susceptibility and biochemical profiles with genotype. Braz J Med Biol Res. 2004; 37: 77-82.
  • 12. Gniadkowski M, Żabicka D, Hryniewicz W. Rekomendacje doboru testów do oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki i chemioterapeutyki 2009. Oznaczanie wrażliwości pałeczek Gram-ujemnych.
  • 13. Grundmann H, Schneider C, Hartung D i inni. Discriminatory power of three DNA-based typing techniques for Pseudomonas aeruginosa. J Clin Microbiol. 1995; 33: 528-34.
  • 14. Hafiane A, Ravaoarinoro M. Characterization of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from cystic fibrosis patients by different typing methods. Pathol Biol (Paris). 2009. (Epub ahead of print).
  • 15. Hoogkamp-Korstanje JA, Meis JF, Kissing J i inni. Risk of cross-colonization and infection by Pseudomonas aeruginosa in a holiday camp for cystic fibrosis patients. J Clin Microbiol. 1995; 33: 572-5.
  • 16. Iglesias NG, Marengo JM, Rentería F i inni. Molecular typification of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from patients with cystic fibrosis. Rev Argent Microbiol. 2008; 40: 3-8.
  • 17. Kersulyte D, Struelens MJ, Deplano A, Berg DE. Comparison of arbitrarily primed PCR and macrorestriction (pulsed-field gel electrophoresis) typing of Pseudomonas aeruginosa strains from cystic fibrosis patients. J Clin Microbiol. 1995; 33: 2216-9.
  • 18. Mahenthiralingam E, Campbell ME, Foster J i inni. Random amplified polymorphic DNA typing of Pseudomonas aeruginosa isolates recovered from patients with cystic fibrosis. J Clin Microbiol. 1996; 34: 1129-35.
  • 19. Nazik H, Ongen B, Erturan Z, Salcioglu M. Genotype and antibiotic susceptibility patterns of Pseudomonas aeruginosa and Stenotrophomonas maltophilia isolated from cystic fibrosis patients. Jpn J Infect Dis. 2007; 60: 82-6.
  • 20. Pellegrino FL, Casali N, Dos Santos KR i inni. Pseudomonas aeruginosa epidemie strain carrying bla(SPM) metallo-beta-lactamase detected in Rio de Janeiro, Brazil. J Chemother. 2006; 18: 151-6.
  • 21. Saitou K, Furuhata K, Fukuyama M. Genotyping of Pseudomonas aeruginosa isolated from cockroaches and human urine. J Infect Chemother. 2010. (Epub ahead of print).
  • 22. Welsh J, McClelland M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Res. 1990; 18:7213-8.
  • 23. Williams JG, Kubelik AR, Livak KJ i inni. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 1990; 18: 6531-5.

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikatory

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.agro-article-eeda2a87-5745-410d-a10c-97b3420e1976
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.