PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
2000 | 52 | 3 |

Tytuł artykułu

Porownawcza ocena identyfikacji bakterii z rodzaju Acinetobacter przy uzyciu komercyjnego systemu API 20NE oraz technika PCR i RFLP

Warianty tytułu

Języki publikacji

PL

Abstrakty

PL
Zidentyfikowano bakterie z rodzaju Acinetobacter systemem API 20NE oraz techniką PCR/RFLP. Wykryty gen recA poddano trawieniu endonukleazami restrykcyjnymi Mbol i Hinfl. Restrykcyjna analiza umożliwiła określenie gatunków genowych wszystkich badanych szczepów.
EN
A study was carried out for identification of 50 Acinetobacter strains isolated from various clinical materials. Using classic methods the following species were identifies: Acinetobacter sp. (68%), Acinetobacter baumanii (24%) and Acinetobacter lwofä (8%). In all strains the recA gene was found of 435-500 pz size which confirms their belonging to that genus. Amplification products were digested with restriction enzymes Mbol and Hinfl (RFLP) and their detection was carried out on agarose gel by electrophoresis methods, owing to that the arrangement of gene fragment characteristic of each strain was obtained. After careful analysis restriction patterns were obtained corresponding to the following genome species: Acinetobacter baumanii (60%), Acinetobacter sp. 3 (28%) and Acinetobacter Iwoffii (12%). The methods of molecular biology made possible a more precise classification of the studied strains according to species. Certain strains determined as Acinetobacter sp. by the API 20NE system were found to be Acinetobacter baumanii, Acinetobacter sp. 3 or Acinetobacter Iwofii when determined by the PCR/RFLP method.

Wydawca

-

Rocznik

Tom

52

Numer

3

Opis fizyczny

s.267-273,fot.,bibliogr.

Twórcy

autor
  • Akademia Medyczna, 41-200 Sosnowiec, ul.Jagiellonska 4
autor
autor
autor
autor

Bibliografia

  • 1. Fleischer M, Przondo-Mordarska A. Występowanie gatunków rodzaju Acinetobacter w materiale od chorych i w środowisku szpitalnym. Med Dośw Mikrobiol 1993; 45: 213—17.
  • 2. Gospodarek E, Kania I. Występowanie gatunków z rodzaju Acinetobacter w materiale klinicznym i innych źródłach. Med Dośw Mikrobiol 1992; 44: 41-8.
  • 3. Holt JG, Krieg NR, Sneath PH i inni. Bergey's Manual of Deteminative Bacteriology. Williams & Wilkins. Wydanie IX, Baltimore 1994, 129.
  • 4. Ibrahim A, Gerner Smidt P, Liesack W. Phylogenetic reationship of the twenty-one groups of the genus Acinetobacter as revealed by 16S ribosomal DNA sequence analysis. Int J Syst Bacteriol 1997; 47: 837-41.
  • 5. Koelem JG, Stoof J, Biesmans i inni. Comparison of amplified ribosomal DNA restriction analysis, random amplified polymorphic DNA analysis, and amplified fragment length polymorphism fingerprinting for identification of Acinetobacter genomic species and typing of Acinetobacter haumannii. J Clin Microbiol 1998; 36: 2522-9.
  • 6. Lui PY, Wu WL. Use of different PCR-based DNA fingerprinting techniques and pulsed- field gel electrophoresis to investigate the epidemiology of Acinetobacter calcoaceticus Acinetobacter baumannii complex. Diagn Microbiol Infect Dis 1997; 29: 19-29.
  • 7. Nowak A, Gospodarek E, Kur J. Próba wykorzystania analizy plazmidowego DNA do identyfikacji gatunków z rodzaju Acinetobacter. Med Dośw Mikrobiol 1993; 45: 469-76.
  • 8. Nowak A, Kur J. Genomic species typing of acinetobacters by polymerase chaing reaction amplification ofthe recA gene. FEMS Microbiol Lett 1995; 130: 327-32.
  • 9. Nowak A, Kur J. Differentiation of seventeen genospecies of Acinetobacter by multiplex polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism analysis. Mol Cell Probes 1996; 10: 405-11.
  • 10. Seifert H, Dijkshoorn L, Gerner Smidt P i inni. Distribution of Acinetobacter species on haman skin: comparison of phenotypic and genotypic identification methods. J Clin Microbiol 1997; 35: 2819-25.
  • 11. Towner KJ, Bergogne-Berezin E, Fewson CA. The biology of Acinetobacter. Taxonomy, clinical importance molecular biology, physiology industrial relevance. Plenum Press New York, London 1991.
  • 12. Veneechoutte M, Dijkshoorn L, Tjernberg I i inni. Identification of Acinetobacter Genomic Species by Arnplified Ribosomal DNA Restriction Analysis. J Clin Microbiol 1995; 33: 11-15.
  • 13. Yamamoto S, Harayama S. Phylogenetic analysis of Acinetobacter strains based on the nucleotide sequences of gyrB genes and on the aminoacid sequences of their products. Int J Syst Bacteriol 1996; 46: 506-11.
  • 14. Zaremba ML, Borowski J. Mikrobiologia lekarska. Wydawnictwo Lekarskie PZWL. Wydanie II, Warszawa 1997, 221-3.

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikatory

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.agro-article-e27ac22b-df8f-4515-813a-934604acbe19
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.