Ocena zroznicowania genetycznego rozanecznikow [Rhododendron sp.] na podstawie markerow RAPD

• Autorzy: Czernicka M , Czernicki W , Klein M , Grzebelus D

Warianty tytułu

EN

Evaluation of genetic relationship of rhododendrons [Rhododendron sp.] based on RAPD markers

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Oceniono pokrewieństwa różaneczników otrzymanych z kolekcji w Tomaszkowicach na Pogórzu Wielickim. Badaniami objęto trzy zimozielone gatunki botaniczne pochodzące z kontynentu azjatyckiego: R. aureum, R. brachycarpum, R. purdomii, sześć odmian hodowlanych należących do grupy mieszańców R. catawbiense: Catharine van Tol, Nova Zembla, Album Novum, Boursoult, Old Port, Hachmann’s Charmant oraz jedną odmianę hodowlaną z grupy mieszańców R. yakushimanum: Koichiro Wada. Testowano po dwie rośliny z każdego obiektu. Do izolacji DNA zastosowano technikę opisaną przez Ziegenhagen i Scholz [1998], przeznaczoną dla gatunków, dla których szczególnie trudno jest uzyskać DNA zadowalającej jakości. Różaneczniki należą bowiem do gatunków trudnych pod względem izolacji DNA. Następnie prowadzono reakcje PCR. Przebadano 19 starterów RAPD, które pozwoliły na otrzymanie 255 markerów. Na podstawie uzyskanych wyników opracowano dendrogram, który odzwierciedlał stopień pokrewieństwa genetycznego testowanych roślin. Badania potwierdziły występowanie bliskich powiązań genetycznych między różanecznikami z grupy mieszańców katawbijskich. Dwie osobne grupy tworzyły R. aureum i R. purdomii oraz R. brachycarpum i odm. Koichiro Wada.

EN

The aim of our study was to evaluate the genetic relationship of Rhododendrons from Rhododendron collection at Tomaszkowice in Pogórze Wielickie. Leaves and leaf buds of three evergreen Asiatic species: R. aureum, R. brachycarpum, R. purdomii, six cultivars from Catawbiense Hybridum group (R. catawbiense): Catharine van Tol, Nova Zembla, Album Novum, Boursoult, Old Port, Hachmann’s Charmant and one cultivar from Yakushimanum Hybridum group: Koichiro Wada were investigated. Two plants from each accession were analysed. DNA was isolated by Ziegenhagen and Scholz [1998] protocol, dedicated to the difficult species in terms of high quality DNA extraction. After isolation, DNA was amplified with 19 RAPD primers. We obtained 255 RAPD markers and worked out a dendrogram, which illustrated the level of genetic diversity among the tested plants. Our study confirmed a close relationship between rhododendrons from Catawbiense Hybridum group. Another group was constituted by R. aureum and R. purdomii. The third group consisted of R. brachycarpum and Koichiro Wada cv.

Słowa kluczowe

PL

izolacja DNA; taksony; roznorodnosc genetyczna; markery RAPD; genetyka roslin; Rhododendron; rozanecznik

EN

DNA isolation; taxonomy; genetic diversity; RAPD marker; plant genetics; Rhododendron

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2007
• Tom: 517
• Numer: 1
• Opis fizyczny: s.225-233,rys.,tab.,bibliogr.

Twórcy

autor

Czernicka M

• Katedra Genetyki, Hodowli i Nasiennictwa, Akademia Rolnicza, Al.29 listopada 54, 31-425 Krakow

autor

Czernicki W

• Katedra Genetyki, Hodowli i Nasiennictwa, Akademia Rolnicza, Al.29 listopada 54, 31-425 Krakow

autor

Klein M

• Katedra Genetyki, Hodowli i Nasiennictwa, Akademia Rolnicza, Al.29 listopada 54, 31-425 Krakow

autor

Grzebelus D

• Katedra Genetyki, Hodowli i Nasiennictwa, Akademia Rolnicza, Al.29 listopada 54, 31-425 Krakow

Bibliografia

• Chen L-F.O., Kuo H-Y., Chen M-H., Lai K-N., Chen S-C.G. 1997. Reproducibility of the differential amplification between leaf and root DNAs in soybean revealed by RAPD markers. Theor. Appl. Genet. 95: 1033-1043.
• Crawford D.J. 2000. Plant macromolecular systematics in the past 50 years: one view. Taxon 49: 479-501.
• Csaikl U.M., Bastian H., Brettschneider R., Gauch S., Meier A., Schauerte M., Scholz F., Sperisen C., Vornam B., Ziegenhagen B. 1998. Comparative analysis of different DNA extraction protocols: a fast, universal maxi-preparation of high quality plant DNA for genetic evaluation and phylogenetic studies. Plant Mol. Biol. Rep. 16: 69-86.
• De Schepper S., Leus L., Mertens M., Van Bockstaele E., DE Loose M., Debergh P., Heursel J. 2001. Flow cytometric analysis of ploidy in Rhododendron (subgenus Tsutsusi). Hort Science 36: 125-127.
• Devos K.M., Gale M.D. 1992. The use of random amplified polymorphic DNA markers in wheat. Theor. Appl. Genet. 84: 567-572.
• Greenwood M.S., Hopper C.A., Hutchison K.W. 1989. Mutation in Larch 1. Effect of age on shoot growth, foliar characteristics and DNA methylation. Plant Physiol. 90: 406-412.
• Iqbal M.J., Gray L.E., Paden D.W., Rayburn A.L. 1994. Research Note: Feasibility of Rhododendron DNA profiling by RAPD analysis. Plant Varieties and Seeds 7: 59-63.
• Iqbal M.J., Paden D.W., Rayburn A.L. 1995. Assessment of genetic relationships among Rhododendron species, varieties and hybrids by RAPD analysis. Scientia Hort. 63: 215-223.
• Jain A., Pandit M.K., Elahi S., Jain A., Bhaskar A., Kumar V 2000. Reproductive behaviour and genetic variability in geographically isolated populations of Rhododendron arboreum (Ericaceae). Current Science 79(9): 1377-1381.
• Karp A., Seberg O., Buiatti M. 1996. Molecular techniques in the assessment of botanical diversity. Ann. Bot. 78: 143-149.
• Kobayashi N., Akabane M., Handa T., Takayanagi K. 1996. Inheritance of morfological characters and RAPD markers in intersubgeneric hybrids of Azalea, (Rhododendron kiusianum Makino x R. indicum (L.) Sweet) x R. japonicum (A. Gray) Suringer f. flavum Nakai. Journal Japan. Soc. Hort. Sci. 65(1): 145-153.
• Masojć P. 2001. Diagnostyka molekularna roślin - ustalanie tożsamości genetycznej. Biotechnologia roślin. Praca zbiorowa pod redakcją S. Malepszego, Wydawn. Nauk. PWN Warszawa: 485-519.
• Parker P.G, Snow A.A., Schug M.D., Booton G.C., Fuerst P.A. 1998. What molecules can tell us about populations: choosing and using a molecular marker. Ecology 79(2): 36-382.
• Penner G.A., Bush A., Wise R., Kim W., Domier L., Kasha K., Laroche A., Scoles G, Molnar S.J., Fedak G. 1993. Reproducibility of random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis among laboratories. PCR Methods Appl. 2: 341-345.
• Rayburn A.L., Iqbal M.J., Paden D.W. 1993. Positive identification of Rhododendron through DNA fingerprinting. J. Am. Rhod. Soc. 47: 37-138.
• Rogers O.S., Benedich A.J. 1988. Extraction of DNA from plant tissue. Lant Molecular Biology Manual, Kulwer Academic Publishers. Londyn, A6: 1-10.
• Szklarczyk M., Simlat M., Jagosz B., Ba G. 2002. The use of cytoplasmic markers in onion hybrid breeding. Cell. Mol. Biol. Lett. 7: 625-634.
• Sztuba-Solińska J. 2005. Systemy markerów molekularnych i ich zastosowanie w hodowli roślin. Kosmos 54(2-3): 227-239.
• Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J, Rafalski J.A., Tingey S.V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 18: 6531-6535.
• Ziegenhagen B., Scholz F. 1998. Methods for difficult plant species/tissues. Molecular tools for screening biodiversity. Praca zbiorowa pod redakcją A. Karp, P.G. Isaac, D.S. Ingram, Chapman and Hall, London: 32-35.