Genetic variation in nine European cattle breeds as determined on the basis of microsatellite markers. II. Gene migration and genetic distance

• Autorzy: Grzybowski G , Prusak B.
• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

Basing on the polymorphism at 26 DNA microsatellite loci an estimation was made of the mean number of genes migrating in one generation (Nem) between populations of nine cattle breeds maintained in Germany, Switzerland and Poland: Angler, German Simmental, Brown Swiss, Swiss Simmental, Holstein, Eringer, Polish Red (PR – included in the National Rare Livestock Breeds Preservation Programme), Polish Black-and-White (PBW) and Polish Red-and-White (PRW). The Nem value for the whole population amounted to 2.048. When the breeds were grouped according to the country of origin the greatest flow of genes was observed within the Polish (2.023), while the lowest within the German population (1.214). The Nem values estimated when comparing each breed with each show that the greatest exchange of genetic material took place between breeds from the same geographic regions. On the phylogenetic N-J tree, constructed on the basis of genetic distance DA, the PR were classified together with PBW and PRW cattle. However, when evaluating the relations between breeds on the basis of values estimated for the DSW genetic distance, the PR cattle were classified together with the Angler breed. Bootstrap values were higher when the tree was constructed on the basis of the DA and not the DSW distance, what indicates a higher reliability of the genealogical structure determined on the basis of the former. In turn, the DSW distance gave a more precise information about the common background of the German and Swiss Simmentals, as well as about the share of the Angler breed used in the past for upgrading the PR.

PL

Na podstawie polimorfizmu w 26 loci mikrosatelitów DNA, oszacowano średnią liczbę migrantów wymienionych w jednym pokoleniu (Nem) między populacjami bydła dziewięciu ras hodowanych w Niemczech, Szwajcarii i w Polsce: angler, simmental niemiecki, szwyc, simmental szwajcarski, holsztyn, eringer, polska czerwona (PR) z hodowli zachowawczej, cb (PBW) i czb (PRW).Wartość Nem dla całej populacji wyniosła 2,048. Przy pogrupowaniu ras w zależności od kraju pochodzenia, największy przepływ genów zanotowano w populacji polskiej (2,023), a najmniejszy w niemieckiej (1,214). Wartości Nem oszacowane przy porównaniu każdej rasy z każdą, wskazują na największą wymianę materiału genetycznego między rasami pochodzącymi z tych samych regionów geograficznych. W drzewie filogenetycznym N-J zbudowanym na podstawie dystansu genetycznego DA,wystąpiło grupowanie rasy pc z rasami cb i czb. Natomiast przy ocenie relacji między rasami na podstawie wartości oszacowanych dla dystansu genetycznego DSW, stwierdzono grupowanie się rasy pc (PR) z rasą angler. Wyższe wartości bootstrapu w drzewie DA, aniżeli w drzewie DSW wskazują na większą wiarygodność struktury genealogicznej ras ustalonej na podstawie dystansu DA.

Słowa kluczowe

EN

microsatellite marker; animal genetics; cattle breed; gene migration; cattle; genetic distance; European breed; genetic variation

• Wydawca: -
• Czasopismo: Animal Science Papers and Reports
• Rocznik: 2004
• Tom: 22
• Numer: 1
• Opis fizyczny: p.37-44,fig.,ref.

Twórcy

autor

Grzybowski G

• Polish Academy of Sciences, Jastrzebiec, 05-552 Wolka Kosowska, Poland

autor

Prusak B.

Bibliografia

• 1. ANONYMOUS, 1996a – Domestic Animal Diversity Information System (DAD-IS) Database. Ford and Agriculture Organization of the United Nations. http://dad.fao.org/en/Home.htm
• 2. ANONYMOUS, 1996b – CaDBase – Cattle Diversity DataBase, – The Analysis of Genetic Diversity in Cattle to Preserve Future Breeding Options – European Concerted Action Project under Food, Agriculture and Agro-Industry Research (FAIR) Programme. Roslin Institute, Edinburgh. http://www.ri.bbsrc.ac.uk/cdiv_www/
• 3. BARTON N.H., SLATKIN M., 1986 – A quasi-equilibrium theory of the distribution of rare allele in a subdivided population. Heredity 56, 409-415.
• 4. CZAJA H., 1991 – Polskie bydło czerwone – wielowiekowa historia bez “happy endu” (Polish Red cattle – a history of many centuries but without a happy end). In Polish. Przegląd Hodowlany 10, 5-8.
• 5. FELSENSTEIN J., 1985 – Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution 29, 783-791.
• 6. FORBES S.H., HOGG J.T., BUCHANAN F.C., CRAWFORD A.M., ALLENDORF F.W., 1995 – Microsatellite evolution in congeneric mammals: domestic and bighorn sheep. Molecular Biology and Evolution 12 (6), 1106-1113.
• 7. GOLDSTEIN D.B., RUIZ LINARES A., CAVALLI-SFORZA L.L., FELDMAN M.W., 1995 – An evaluation of genetic distances for use with microsatellite loci. Genetics 139, 463-471.
• 8. LUBIENIECKA J., GRZYBOWSKI G., LUBIENIECKI K., 2001 – Genetic variation in nine European cattle breeds as determined on the basis of microsatellite markers. I. Within-breed variation. Animal Science Papers and Reports 19 (4), 249-264.
• 9. MINCH E., 1998 – MICROSAT (version 1.5e). Standford University Medical Center, Standford,CA.
• 10. NEI M., TAJIMA F., TATENO Y., 1983 – Accuracy of estimated phylogenetic Teres from molecular data. II. Gene frequency data. Journal of Molecular Evolution 19, 153-170.
• 11. OTA T., 1993 – DISPAN. Pennsylvania State University, Institute of Molecular Evolutionary Genetics.
• 12. RAYMOND M., ROUSSET F., 1995 – A population genetics software for exact tests and ecumenicism.Journal of Heredity 86, 248-249.
• 13. SAITOU N., NEI M., 1987 – The neighbour-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular Biology and Evolution 4, 406-425.
• 14. SHRIVER M.D., JIN L., BOERWINKLE E., DEKA R., FERRELL R.E., CHAKRABORTY R., 1995 – A novel measure of genetic distance for highly polymorphic tandem repeat loci. Molecular Biology and Evolution 12(5), 914-920
• 15. SLATKIN M., 1985 – Rare alleles as indicators of gene flow. Evolution 39, 53-65.