Assessment of morphological and genetic variability in chosen Nepeta accessions

• Autorzy: Smolik M , Jadczak D. , Glowczyk A.

Warianty tytułu

PL

Okreslenie morfologicznego i genetycznego zroznicowania u wybranych obiektow Nepeta

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

The aim of this study was to determine the morphological and genetic variability of four Nepeta genotypes: N. cataria var. citriodora, N. × faassenii, N. mussinii, and N. nuda from the Collection of Medical Plants in Dołuje, Vegetable Faculty, Agricultural University of Szczecin, Poland. Morphological variation among the examined catnip forms was determined using biometric measurements which included the plants height, the width of a leaf pair, the length and width of a leaf blade, the length of an inflorescence, the weights of fresh and dried green parts and the essential oils content. The DNA polymorphism within microsatellite sequences was determined using the ISSR-PCR technique. The conducted biometric measurements proved that the examined Nepeta plants differed significantly in all analysed features. Twenty microsatellite primers were used in ISSR reactions; clear products were generated in reactions with six of them. In general, 72 loci were amplified (110 amplicons); five of them (7%) turned out to be monomorphic, 20 (28%) polymorphic and 47 (65%) were specific for the examined accessions. Unique loci were amplified for each examined Nepeta genotype. A phylogenetic tree was constructed on the basis of a UPGMA cluster algorithm. It consisted of one similarity group ‘a’, in which N. × faassenii, N. mussinii and N. nuda were included.

PL

Celem badań było określenie zmienności morfologicznej i genetycznej czterech genotypów Nepeta: N. cataria var. citriodora, N. × faassenii, N. mussinii, N. nuda z Kolekcji Roślin Leczniczych Katedry Warzywnictwa w Dołujach Akademii Rolniczej w Szczecinie. Różnice morfologiczne między badanymi formami kocimiętki określono na podstawie pomiarów biometrycznych, którymi objęto: wysokość roślin, szerokość pary liści, długość i szerokość blaszki liściowej, długość kwiatostanu, masę świeżego i suszonego ziela oraz zawartość olejków eterycznych. Polimorfizm DNA w obrębie sekwencji mikrosatelitarnych określono przy pomocy techniki ISSR-PCR. Na podstawie przeprowadzonych pomiarów biometrycznych stwierdzono, że wszystkie analizowane cechy badanych obiektów Nepeta różniły się istotnie. Do reakcji ISSR zastosowano 20 mikrosatelitarnych starterów, spośród nich jedynie w reakcjach z 6 generowano produkty. Ogółem amplifikowano 72 loci (110 amplikonów) spośród nich 5 (7%) okazało się monomorficznymi, 20 (28%) polimorficznymi, 47 (65%) specyficznymi dla badanych obiektów. Dla każdego z badanych genotypów Nepeta amplifikowano unikatowe loci. Na podstawie algorytu skupień UPGMA wykreślono drzewo podobieństwa filogenetycznego. Składało się ono z jednej grupy podobieństwa: ‘a’ do której zaliczono: N. × faassenii, N. mussinii i N. nuda.

• Wydawca: -
• Czasopismo: Herba Polonica
• Rocznik: 2008
• Tom: 54
• Numer: 4
• Opis fizyczny: p.68-78,fig.,ref.

Twórcy

autor

Smolik M

• Agricultural University, Janosika 8, 71-424 Szczecin, Poland

autor

Jadczak D.

autor

Glowczyk A.

Bibliografia

• 1. Brunie G. Botanika. Könemann 2005:886–7.
• 2. Nowiński M. Dzieje upraw i roślin leczniczych. Warszawa 1983:150.
• 3. Mackú J, Krejcá J. Atlas roślin leczniczych. Wrocław 1989:276.
• 4. Bown D. 1999. Wielka encyklopedia ziół. Warszawa 1999:165-317.
• 5. Senderski ME. Prawie wszystko o ziołach. Podkowa Leśna 2004:339-41.
• 6. Zietkiewicz E, Rafalski A, Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) – anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics 1994; 20:176-83.
• 7. Nei M, Li HW. Mathematical model for study the genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proc Natl Acad Sci 1979 74:5267–73.
• 8. Van de Peer Y, De Wachter R. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment. Comput Appl Biosci 1994; 10,569-70.
• 9. Felsenstein J. Confidence limits on phylogenesis: An approach using the bootstrap. Evolution 1985; 39:783-91.
• 10. Rumińska A. Rośliny lecznicze. Warszawa 1973.
• 11. Seidler-Łożykowska K. Kierunki hodowli roślin zielarskich realizowane w Instytucie Roślin i Przetworów Zielarskich. Hodowla, nasiennictwo i szkółkarstwo roślin o podwyższonej jakości. Materiały VII Ogólnopolskiego Zjazdu Hodowców Roślin Ogrodniczych. Szczecin 1997:385-7.
• 12. Jambor J Uprawa i przetwórstwo zielarskie w Polsce. Herba Polonica 1999; 45:302-11.
• 13. Seidler-Łożykowska K, Kaźmierczak K. Rola odmian w kontrolowanych uprawach roślin leczniczych. Roczniki Akademii Rolniczej w Poznaniu CCCXXIII. Ogrodnictwo część II. Poznań 2000:335-7.
• 14. Biggs M, McVicarova J, Flowerdew B. Velká kniha zeleniny, bylin a ovoce. Volvox Glosator 2004:304.
• 15. Kvant C, Palmstierna I. Vår Trädgårdsbok. Prisma 2004:295.
• 16. Broda B, Mowszowicz J. Przewodnik do oznaczania roślin leczniczych, trujących i użytkowych. Warszawa 1997.
• 17. Héthelyi EB, Szabó LG, Marek E, Domokos J. Hazai mackamenták (Nepeta cataria L. és N. parviflora M. Bieb) illóolajának vizsgálata GC-, GC/MS módszerrel. Journal of Oil Soap Cosmetics – Olaj SzappanKozmetika 2000; 49:67.
• 18. Lanham P, Brennan R. Characterization of the genetic resource of red currant (Ribes rubrum: Subg. Ribesia) using anchored microsatellite markers. Theor. Appl. Genet. 1998; 96:917-21.
• 19. Moreno S, Martin JP, Ortiz JM. Inter-simple sequence repeats PCR for characterization of closely related grapevine germplasm. Euphytica 1998; 101:117-25.
• 20. Jadczak D, Smolik M, Rzepka-Plevneš D, Jurga B. Morphological and molecular characteristics of some Sanguisorba species. In: Nowaczyk P (ed.). Spontaneus and induced variation for the genetic improvement of horticultural crops. Bydgoszczs 2007:167-78.
• 21. Smolik M, Jadczak D, Rzepka-Plevneš D, Sękowska A. Morphological and genetic variability of chosen Mentha species. Herba Polonica 2007; 53: 90-7.
• 22. Pradeep Reddy M, Sarla N, Siddiq EA. Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding. Euphytica 2002; 128:9-13.