An insertion-deletion polymorphism in the 3'UTR encoding region of the porcine prolactin [PRL] gene

• Autorzy: Babicz M , Pierzchala M. , Urbanski P. , Rozempolska-Rucinska I.

Warianty tytułu

PL

Polimorfizm typu insercja-delecja w rejonie kodujacym 3'UTR genu prolaktyny [PRL] swini

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

A novel mutation, insertion/deletion (InDel) was found in the porcine prolactin gene exon 5 coding for the 3’UTR. Polymorphism was detected and identified using PCR-MSSCP and DNA sequencing techniques, and then analysed with PCR-RFLP using HpyCH4III endonuclease. Inserted/deleted was an 11-bp TGTTTCTTAAC motive that occurred once or twice at position 201-222 in the amplified DNA fragment. The investigations covered 150 gilts of the Puławska breed from the herds under the Preserve Breeding Project. The frequencies of the inserted and deleted PRL gene variants were 0.34 and 0.66, respectively. The estimated value of heterozygosity (Ĥ) was 0.253 and the polymorphism information content (PIC) amounted to 0.348.

PL

Wykryto nowy polimorfizm w genie prolaktyny (PRL) świni. Mutacja typu insercja/delecja (InDel) została zidentyfikowana w 5 eksonie kodującym fragment 5’UTR. Polimorfizm wykryto i zidentyfikowano metodami PCR-MSSCP i sekwencjonowania DNA, a następnie analizowano metodą PCR-RFLP, za pomocą endonukleazy restrykcyjnej HpyCH4III. Allele Ins i Del genu PRL różniły się obecnością jednego z dwóch 11-nukleotydowych motywów TGTTTCTTAAC w pozycji 212-222 w amplifikowanym fragmencie DNA. Zgenotypowano 150 loszek rasy puławskiej, pochodzących ze stad objętych hodowlą zachowawczą. Frekwencja alleli Ins i Del wyniosła odpowiednio 0.34 i 0.66. Wartość wskaźnika heterozygotyczności (Ĥ) wyniosła 0,253, a współczynnika informatywności polimorfizmu (PIC) – 0,348.

Słowa kluczowe

EN

porcine prolactin; genetic variation coefficient; reproduction performance; pig; Pulawska breed; polymorphism; prolactin gene

• Wydawca: -
• Czasopismo: Animal Science Papers and Reports
• Rocznik: 2008
• Tom: 26
• Numer: 3
• Opis fizyczny: p.183-189,fig.,ref.

Twórcy

autor

Babicz M

• University of Life Sciences of Lublin, Akademicka 13, 20-950 Lublin, Poland

autor

Pierzchala M.

autor

Urbanski P.

autor

Rozempolska-Rucinska I.

Bibliografia

• BABICZ M., KURYŁ J., WALKIEWICZ A., 2003 – Evaluation of the genetic profile of the Pulawska breed. Journal of Applied Genetics 44(4), 497-508.
• BEN-JONATHAN N., MERSHON J.L., ALIEN D.L., STEINMETZ R.W., 1996 – Extrapituitary prolactin: Distribution, regulation, functions, and clinical aspects. Endocrinology Review 17, 639-669.
• BOTSTEIN D., WHITE R.L., SKOLNICK M., DAVIS R.W., 1980 – Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphism. American Journal of Human Genetics 32, 314-331.
• COPPIETERS W., VAN ZEVEREN A., VAN DE WEGHE A., PEELMAN L., BOUQUET Y.,1992 – Recht streekse genotypering von stress on gevoeligheid bij verkens met behulp met van DNA onderzoek. Vlaams Diergeneeskunding Tijdschrift 61, 68-72.
• KAWASAKI E.S., 1990 – Sample preparation from blood cells and other fluids. In: PCR protocols (ed. Innis M.A., Gelfand D.H., Sninsky J.J., White T.J.). Academic Press, New York, 146-152.
• KORWIN-KOSSAKOWSKA A., WYSZYŃSKA-KOKO J., SENDER G., 2006 – A novel polymorphism of the porcine prolactin gene (PRL). – Neuroendocrinology Letters 27, 241-246.
• MARTINEZ A.M., DELGADO J.V., RODERO A., VEGA-PLA J.L., 2000 – Genetic structure of the Iberian pig breed using microsatellites. Animal Genetics 31, 295-301.
• MEGENS H.J., CROOIJMANS R.P., SAN CRISTOBAL M., HUI X., LI N., GROENEN M.A.,2008 – Biodiversity of pigs breeds from China and Europe estimated from pooled DNA samples:differences in microsatellite variation between two areas of domestication. Genetic Selection Evolution 40, 103-128.
• OTT J., 1992 – Strategies for characterizing highly polymorphic markers in human gene mapping. American Journal of Human Genetics 51, 283-290.
• TRUONG A.T., DUEZ C., BELAYEW A., RENARD A., PICTET R., BELL G., MARTIAL J.,1984 – Isolation and characterization of the human prolactin gene. EMBO Journal 3, 429-437.
• VINCENT A., WANG L., TUGGLE C.K., ROTHSCHILD M.F., 1998 – Linkage and physical mapping of prolactin to porcine chromosome 7. Animal Genetics 29, 27-29.
• WALKIEWICZ A., BABICZ M., KASPRZYK A., KONDRACKI S., BLICHARSKI T., BAJDA Z., JASZCZYŃSKA M., 2005 – Preserve Breeding Program of Puławska Breed. National Research Institute of Animal Production.
• WEIR B.S., 1990 – Genetic data analysis. Sunderland, Massachusetts: Sinauer Associates.