PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
2008 | 26 | 1 |
Tytuł artykułu

Nucleotide sequence polymorphisms in the promoter region of bovine growth hormone receptor gene [GHR] have no effect on its expression level in liver

Warianty tytułu
PL
Polimorfizm sekwencji nukleotydowej w rejonie promotorowym genu receptora hormonu wzrostu [GHR] bydla nie wplywa na ekspresje tego genu w watrobie
Języki publikacji
EN
Abstrakty
EN
The gene coding for bovine GHR consists of nine protein-coding exons and untranslated, alternative exons 1A, 1B, and 1C in its 5’-region. Distinct promoters regulate transcription from each of the alternative exons. The P1 promoter which drives growth hormone receptor expression in the liver is associated with exon 1A. Earlier the nucleotide sequence polymorphisms have been identified in the bovine GHR gene promoter region, including several single nucleotide polymorphisms (SNPs) and one TG repeat (microsatellite) of variable length. Using computer-aided analysis in TESS programme it has also been shown that the A/G transition at position -154 (RFLP-NsiI) and the C/T transition at position -1104 (Fnu4HI), both located upstream the exon 1A, co-localized with putative transcription factor-binding sites. In light of this the authors decided to study possible effects of these polymorphisms on GHR gene expression in cattle of different GHR genotypes, using Real-time PCR. Interestingly, no difference was found in GHR mRNA accumulation in liver between young Black-and-White (BW) bulls carrying (+/+), (+/-) or (-/-) genotypes at RFLP-NsiI site, (+/-) or (+/+) genotypes at RFLP-Fnu4HI site, and TG17/17 or TG21/21 alleles at TGn microsatellite, located within the P1 promoter of the bovine GHR gene.
PL
Gen kodujący receptor hormonu wzrostu bydła zbudowany jest z dziewięciu eksonów kodujących białko i trzech eksonów (1A, 1B, i 1C) nie podlegających translacji, których transkrypcja prowadzi do powstania trzech typów mRNA, różniących się długością rejonu 5’-UTR. Ekspresją transkryptu występującego w wątrobie kieruje promotor P1, położony „powyżej” eksonu 1A. W rejonie promotorowym genu GHR bydła występuje kilka polimorfizmów typu SNP, a także polimorficzna sekwencja mikrosatelitarna TGn. W prezentowanej tu pracy, w wyniku analizy komputerowej w programie TESS stwierdzono, że niektóre z tych mutacji leżą w miejscu wiązania czynników transkrypcyjnych. Postanowiono zatem poszukiwać zależności między polimorfizmem sekwencji nukleotydów w rejonie promotorowym genu GHR bydła a ekspresją tego genu w wątrobie. Używano techniki Real-time, a jako matrycę stosowano RNA, wyizolowany z wątroby młodych buhajów cb o różnych genotypach GHR. Nie wykazano różnic w poziomie mRNA GHR w wątrobie między buhajami o genotypach (+/+), (+/-) i (-/-) w odniesieniu do tranzycji A/G w pozycji ‑154 (RFLP-NsiI), o genotypach (+/-) i (+/+) dla tranzycji C/T w pozycji ‑1104 (RFLP-Fnu4HI) ani o genotypach TG17/17 i TG21/21 w odniesieniu do sekwencji mikrosatelitarnej w promotorze P1.
Wydawca
-
Rocznik
Tom
26
Numer
1
Opis fizyczny
p.5-15,fig.,ref.
Twórcy
autor
  • Polish Academy of Sciences, Institute of Genetics and Animal Breeding, Jastrzebiec, 05-552 Wolka Kosowska, Poland
Bibliografia
  • ADAMOWICZ T., FLISIKOWSKI K., STARZYŃSKI R., ŚWITOŃSKI M., ZWIERZCHOWSKI L., 2006 – Mutation in the Sp1-motif on the bovine leptin gene effect on the expression level.Mammalian Genome 17(1), 77-82
  • AGGREY SE., YAO J., LIN CY., ZADWORNY D., HAYES FJ., KUHNLEIN U., 1999 – Markers within the regulatory region of the growth hormone receptor gene and their association with milkrelated traits in holsteins. Journal of Heredity 90, 148‑151.
  • ARGETSINGER LS., CARTERS U.C., 1996 – Growth hormone signalling mechanisms: involvement of the tyrosine kinase JAK2. Hormone Research 45, 22-24.
  • BURTON JL., MCBRIDE BW., BLOCK E., GLIMM DR., KENELLY JJ., 1994 – A review of bovine growth hormone. Canadian Journal of Animal Science 74, 167‑201.
  • CHOMCZYNSKI P., SACCHI N., 1987 − Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Analytical Biochemistry 162, 156–159.
  • FALAKI M., SNEYERS M., PRANDI A., MASSART S., CORRADINI C., FORMIGONI A.,BURNY D., PORTELLE D., RENAVILLE R., 1996 – TaqI growth hormone polymorphism and milk production traits in Holstein-Friesian cattle. Animal Science 63, 175-181.
  • FLISIKOWSKI K., STARZYŃSKI R., ZWIERZCHOWSKI L., 2004 – Promoter variant-dependent expression of the STAT5A gene in bovine liver. Biochimica et Biophysica Acta – Gene Structure and Expression 1679(2), 195-199.
  • GE W., DAVIS M.E., HINES H.C., IRVIN K.M., 1999 – Two-allelic DGGE polymorphism detected in the promoter region of the bovine GHR gene. Animal Genetics 30(1), 71-71.
  • GE W., DAVIS M.E., HINES H.C., IRVIN K.M., SIMMEN R.C., 2003 – Association of single nucleotide polymorphisms in the growth hormone and growth hormone receptor genes with blood serum insulin-like growth factor I concentration and growth traits in Angus cattle. Journal of Animal Science 81, 641-648.
  • HALE C.S., HERRING W.O., SHIBUYA H., LUCY M.C., LUBAHN D.B., KEISLER D.H.,JOHNSSON G.S., 2000 – Decreased growth in Angus steers with a short TG-microsatellite allele in the P1 promoter of the growth hormone receptor gene. Journal of Animal Science 78, 2099-2104.
  • JIANG H.L., LUCY M.C., 2001 – Variants of the 5’-untranslated region of the bovine growth hormone receptor mRNA: isolation, expression and effects on translational efficiency. Gene 265, 45-53.
  • JIANG H., OKAMURA C.S., LUCY M.C., 1999 – Isolation and characterization of a novel promoter for the bovine growth hormone receptor gene. Journal of Biological Chemistry 247(12), 7893-7900.
  • KANAI N., FUJII T., SAITO K., YOKOYAMA T., 1994 – Rapid and simple method for preparation of genomic DNA from easily obtained clotted blood. Journal of Clinical Pathology 47, 1043-1044.
  • KUSS A.W., GOGOL J., GELDERMANN H., 2003 – Associations of a polymorphic AP-2 binding site in the 5’-flanking region of the bovine beta-lactoglobulin gene with milk proteins. Journal of Dairy Science 6, 2213-2218.
  • LUCY M.C., JOHNSSON G.S., SHIBUYA H., BOYD C.K., HERRING W.O., WERIN M., 1998 – Rapid communication: Polymorphic (GT)n microsatellite in the bovine somatotropine receptor gene promoter. Journal of Animal Science 76, 2209-2210.
  • LUM LS., DOC P., MEDRANO J.F., 1997 – Polymorphisms of bovine beta-lactoglobulin promoter and differences in the binding affinity of activator protein 2 transcription factor. Journal of Dairy Science 80, 1389-1397.
  • MAJ A., KORCZAK M., OPRZĄDEK J., ZWIERZCHOWSKI E., DYMNICKI E., 2004a – TGrepeat length polymorphism in the 5’-noncoding region of the growth hormone receptor gene in cattle and its association with meat production traits. Animal Science Papers and Reports 22 (3),297-305.
  • MAJ A., OPRZADEK J., DYMNICKI E., ZWIERZCHOWSKI L., 2005a − Association of the polymorphism in the 5′-noncoding region of the bovine growth hormone receptor gene with meat production traits in Polish Black-and-White cattle. Meat Science 72 (3), 539-544.
  • MAJ A., PAREEK C.S., KLAUZIŃSKA M., ZWIERZCHOWSKI L., 2005b – Structure and polymorphism of the 5’‑noncoding region of the bovine growth hormone receptor gene. Journal of Animal Breeding and Genetics 122, 414-417.
  • MAJ A., STRZAŁKOWSKA N., SŁONIEWSKI K., KRZYŻEWSKI J., OPRZADEK J., ZWIERZCHOWSKI L., 2004b – Single nucleotide polymorphism (SNP) in the 5′-noncoding region of the bovine growth hormone receptor gene and its association with dairy production traits in Polish Black-and-White cattle. Czech Journal of Animal Science 49(10), 419-429.
  • MAJ A., ZWIERZCHOWSKI, L., OPRZĄDEK, J., OPRZĄDEK, A., DYMNICKI, E., 2004c – Polymorphism in the 5’-noncoding region of the bovine growth hormone receptor gene and its association with meat production traits in cattle. Animal Research 53(6) 503-514.
  • MARTIN P., SZYMANOWSKA M., ZWIERZCHOWSKI L., LEROUX C., 2002 – The impact of genetic polymorphisms on the protein composition of ruminant milks. Reproduction, Nutrition and Development 42, 433‑459
  • MOISIO S., ELO K., KANTANEN J., VILKKI J., 1998 – Polymorphism within the 3’ flanking region of the bovine growth hormone receptor gene. Animal Genetics 29, 55-57.
  • PARMENTIER I., PORTETELLE D., GENGLER N., PRANDI A., BERTOZZI C., VLEURICK L., GILSON R., RENAVILLE R., 1999 – Candidate gene markers associated with somatotropic axis and milk selection. Domestic Animal Endocrinology 17, 139-148.
  • PFAFFL M.W., MIRCHEVA GEORGIEVA T., PENCHEV GEORGIEV I., ONTSOUKA E.,HAGELEIT M., BLUM J.W., 2002 – Real-time RT-PCR quantification of insulin-like growth factor (IGF)-1, IGF-1 receptor, IGF-2, IGF-2 receptor, insulin receptor, growth hormone receptor, IGFbinding proteins 1, 2 and 3 in the bovine species. Domestic Animal Endocrinology 22, 91-102.
  • ROTWEIN P., GRONOWSKI A.M., THOMAS M.J., 1994 – Rapid nuclear actions of growth hormone. Hormone Research 42(4-5), 170-1755.
  • SCHWARTZBAUER G., MENON R.K., 1998 –Regulation of growth hormone receptor gene expression. Molecular Genetics and Metabolism 63(4), 243-253.
  • SZYMANOWSKA M, MALEWSKI T, ZWIERZCHOWSKI L., 2004 – Transcription factor binding to variable nucleotide sequences in 5’‑flanking regions of bovine casein genes. International Dairy Journal 14:103-115.
  • ZHOU Y., JIANG H., 2005 – Trait-associated sequence variation in the bovine growth hormone receptor 1A promoter does not affect promoter activity in vitro. Animal Genetics 36, 156-159.
Typ dokumentu
Bibliografia
Identyfikatory
Identyfikator YADDA
bwmeta1.element.agro-article-90b0b755-1af0-4898-941d-cabe8e51492c
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.