Identyfikacja wybranych gatunkow grzybow z rodzaju Fusarium z nasion niektorych gatunkow roslin uprawnych metoda tradycyjna i BIO-PCR

• Autorzy: Kulik T , Fordonski G , Pszczolkowska A , Plodzien K , Olszewski J

Warianty tytułu

EN

Identification of some Fusarium species from selected crop seeds using traditional method and BIO-PCR

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W pracy określono przynależność gatunkową grzybów z rodzaju Fusarium wcześniej wyizolowanych z nasion wybranych gatunków roślin uprawnych metodą tradycyjną i BIO-PCR. Zastosowanie metody BIO-PCR było podyktowane faktem, że nie wszystkie kultury zostały wstępnie poprawnie sklasyfikowane. Z przeprowadzonych analiz identyfikacji metodą tradycyjną i molekularną wykazano stosunkowo wysokie porażenie ziarna pszenicy przez F. poae. W badaniach wykazano, że kultura nr 40 (wyizolowana z nasion bobiku i oznaczona metodą tradycyjną jako mieszanka F. culmorum i F. graminearum) nie dawała wyniku pozytywnego w reakcji PCR z użyciem primerów OPT18F₄₇₀ OPT18R₄₇₀ specyficznych dla F. culmorum. Natomiast zastosowanie dodatkowej pary primerów Fc01F, Fc01R pozwoliło na wiarygodne oznaczenie F. culmorum.

EN

We identified a species level of the fungal cultures isolated from selected crop seeds using traditional method and BIO-PCR. The use of BIO-PCR did not correspond completely to the morphological analyses. Both methods showed increased infection with F. poae in winter wheat seed sample originated from north Poland. Fungal culture No 40 (isolated from faba bean and identified with traditional method as mixed culture with F. culmorum and F. graminearum) did not produce expected product after PCR reaction with species specific primers OPT18F₄₇₀ OPT18R₄₇₀ However, the use of additional primers Fc01F, Fc01R allowed for reliable identification of F. culmorum in the culture.

Słowa kluczowe

PL

Fusarium graminearum; Fusarium culmorum; Fusarium poae; metoda BIO-PCR; lancuchowa reakcja polimerazy; cechy morfologiczne; Fusarium avenaceum; identyfikacja; grzyby chorobotworcze

EN

Fusarium graminearum; Fusarium culmorum; Fusarium poae; polymerase chain reaction; morphological trait; Fusarium avenaceum; identification; pathogenic fungi

• Wydawca: -
• Czasopismo: Acta Agrobotanica
• Rocznik: 2005
• Tom: 58
• Numer: 2
• Opis fizyczny: s.33-54,fot.,tab.,bibliogr.

Twórcy

autor

Kulik T

• Katedra Diagnostyki i Patofizjologii Roślin, Uniwersytet Warminsko-Mazurski w Olsztynie, Plac Lodzki 5, 10-727 Olsztyn

autor

Fordonski G

• Katedra Diagnostyki i Patofizjologii Roślin, Uniwersytet Warminsko-Mazurski w Olsztynie, Plac Lodzki 5, 10-727 Olsztyn

autor

Pszczolkowska A

• Katedra Diagnostyki i Patofizjologii Roślin, Uniwersytet Warminsko-Mazurski w Olsztynie, Plac Lodzki 5, 10-727 Olsztyn

autor

Plodzien K

• Katedra Diagnostyki i Patofizjologii Roślin, Uniwersytet Warminsko-Mazurski w Olsztynie, Plac Lodzki 5, 10-727 Olsztyn

autor

Olszewski J

• Katedra Diagnostyki i Patofizjologii Roślin, Uniwersytet Warminsko-Mazurski w Olsztynie, Plac Lodzki 5, 10-727 Olsztyn

Bibliografia

• Booth C., 1971. The Genus Fusarium. Comm. Myc. Inst., Kew, Surr., England.
• Edel V., Steinberg C., N. Gautheron N. and Alabouvette C., 2000.Ribosomal DNA-targeted oligonucleotide probe and PCR assay specific for Fusarium oxysporum. Mycol. Res. 104 (5) : 518-526.
• Ferreira A.V.B. & Louise G.N., 1996. PCR from fungal spores after microwave treatment. http://www.fgsc.net/fgn43/ferreir.html.
• Gibb A.P., Wong S., 1998. Inhibition of PCR by Agar from Bacteriological Transport Media. J. Clinic. Microbiol., 36, 1, 275-276
• Hue F.-X., Huerre M., Rouffault M. A., Bievre C., 1999. Specific Detection of Fusarium Species in Blood and Tissues by PCR Technique. J. Clinic. Microbiol. 37, 8, 2434-2438.
• Kwaśna H., Chełkowski J., Zajkowski P., 1991. Grzyby. Tom XXII. Polska Akademia Nauk. Warszawa - Kraków.
• Leslie J. F., Zeller K. A., Summerell B. A., 2001. Icebergs and species in populations of Fusarium. Mini-Review. Physiol. Molec. Plant Pathol. 59, 107-117.
• Möller E.M., Chełkowski J., Geiger H.H., 1999. Species - specific PCR assays for the fungal pathogens Fusarium moniliforme and Fusarium subglutinans and their application to diagnose maize ear rot disease. Phytopathology 147, 497-508.
• Nelson P. E., Toussoun T. A., and Marasas W. F. 0., 1983. Fusarium species: an illustrated manual for identification. Pennsylvania State University Press, University Park.
• Nelson P.E., Dignani M.C., Anaissie E.J., 1994. Clinic. Microbiol. Rev. 7, 4, 479-504.
• Nicholson P., Lees A. K., Maurin N., Parry D. W., Rezanoor H. N., 1996. Development of PCR assay to identify and quantify Microdochium nivale var. nivale and Microdochium nivale var. majus in wheat. Physiol. Molec. Plant Pathol., 48, 257-271.
• Nicholson P., Simpson D.R., Weston G., Rezanoor H.N., Lees A.K., Parry D.W. and Joyce D., 1998. Detection and quantification of Fusarium culmorum and Fusarium graminearum in cereals using PCR assays. Physiol. Molec. Plant Pathol. 53, 17-37.
• O’Donnell K., 1992. Ribosomal DNA internal transcribed spacers are highly divergent in the phytopathogenic ascomycete Fusarium sambucinum (Giberella pulicaris). Curr. Genet., 22: 213-220.
• O’Donnell K., Cigelnik E., 1997. Two Divergent Intragenomic rDNA ITS2 Types within a Monophyletic Lineage of the Fungus Fusarium Are Nonorthologous. Molec. Phylogenet. Evol., 7, 1, 103-116.
• Parry D.W., Nicholson P., 1996. Development of a PCR assay to detect Fusarium poae in wheat. Plant Pathol. 45, 383-391.
• Paveley N.D., Rennie W.J., Reeves J.C., Wray M.W., Slawson D.D., Clark W.S., Cockerell V., Mitchell A.G., 1997. Cereal Seed Flealth Strategies in the UK. Seed Health Testing, 95-106.
• Schaad N.W., Bonde M.R., Hatziloukas E., 1997. BIO-PCR: A Highly Sensitive Technique for Detecting Seedbome Fungi and Bacteria. Seed Health Testing, 159-164.
• Schilling A.G., Möller E.M., Geiger H. H., 1996. Polymerase Chain Reaction - Based Assays for Species - Specific Detection of Fusarium culmorum, F. graminearum, and F. avenaceum. Phytopathology 86, 5, 515-523.
• Turner A.S., Lees A.K., Rezanoor H.N., Nicholson P., 1998. Refinement of PCR-detection of Fusarium avenaceum and evidence from DNA marker studies for phenetic relatedness to Fusarium tricinctum. Plant Pathol. 47, 278-288.
• Yoder W.T., Christianson L.M., 1997. Species-Specific Primers Resolve Members of Fusarium Section Fusarium. Taxonomic Status of the Edible “Quorn” Fungus Reevaluated. Fungal Genet. Biol. 23, 68-80.