Ocena podobienstwa genetycznego wybranych form Avena sterilis L. pochodzacych z Izraela, Syrii i Libanu

• Autorzy: Paczos-Grzeda E , Chrzastek M , Wacko S , Miazga D

Warianty tytułu

EN

Assessment of genetic similarity of Avena sterilis L. accessions originating form Israel, Syria and Lebanon

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W pracy przeprowadzono analizę podobieństwa genetycznego 14 form A. sterilis pochodzących z Izraela, Syrii i Libanu. W badaniach przeprowadzono analizę polimorfizmu markerów RAPD. Dla 18 wyselekcjonowanych starterów uzyskano 122 produkty, z których 93 były polimorficzne, zaś 19 było specyficznych dla pojedynczych obiektów. Określono podobieństwo genetyczne pomiędzy parami wszystkich badanych form. Średnie podobieństwo wyniosło 0,614 i wahało się od 0,441 pomiędzy CN 20304 i CN 20322 do 0,775 pomiędzy AVE 941 i PI 287211. Na podstawie matryc indeksów podobieństwa genetycznego wykonano analizę skupień metodą średnich połączeń UPGMA. Wewnątrzgatunkowe zróżnicowanie genetyczne Avena sterilis było wyższe, aniżeli stwierdzone we wcześniejszych badaniach u Avena sativa. Największym podobieństwem genetycznym charakteryzowały się formy pochodzące z Izraela, zaś największe zróżnicowanie stwierdzono wśród obiektów z Syrii. Formy z Libanu były bardziej podobne do obiektów z Izraela, aniżeli z Syrii.

EN

In present paper an analysis of genetic similarity of 14 A. sterilis accessions from Israel, Syria and Lebanon was conducted. Polymorphism of RAPD markers was studied. Selected primers produce 122 fragments out of which 93 were polymorphic and 19 were genotype-specific. RAPD-based genetic similarity was estimated between 0.441 (CN 20304 vs. CN 20322) and 0.775 (AVE 941 vs. PI 287211). The mean genetic similarity was calculated at 0.614. Genetic similarity matrix was applied for claster analysis through UPGMA method. Interspecific genetic diversity of Avena sterilis was higher than that evaluated on a base of molecular markers in previous studies with Avena sativa. The highest genetic similarity was estimated for accessions originating from Israel. The highest distance was noticed for accessions from Syria. Forms originating from Lebanon had a higher ressemblance to objects from Israel than those from Syria.

Słowa kluczowe

PL

hodowla roslin; gatunki obce; chwasty; Avena sterilis; podobienstwo genetyczne; biotechnologia; Izrael; Liban; metoda RAPD; markery molekularne; pochodzenie roslin; polimorfizm molekularny; Syria; Bliski Wschod

EN

plant breeding; alien species; weed; Avena sterilis; genetic similarity; biotechnology; Israel; Lebanon; RAPD method; molecular marker; plant origin; molecular polymorphism; Syria; Middle East

• Wydawca: -
• Czasopismo: Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
• Rocznik: 2007
• Tom: 517
• Numer: 2
• Opis fizyczny: s.559-567,rys.,tab.,bibliogr.

Twórcy

autor

Paczos-Grzeda E

• Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roslin, Akademia Rolnicza, ul.Akademicka 15, 20-934 Lublin

autor

Chrzastek M

• Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roslin, Akademia Rolnicza, ul.Akademicka 15, 20-934 Lublin

autor

Wacko S

• Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roslin, Akademia Rolnicza, ul.Akademicka 15, 20-934 Lublin

autor

Miazga D

• Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roslin, Akademia Rolnicza, ul.Akademicka 15, 20-934 Lublin

Bibliografia

• Baum B.R. 1977. Oats: wild and cultivated. A monograph of the genus Avena L. (Poaceae). Monogr. No. 14. Canada Dep. of. Agric. Supply and Services Canada, Ottawa, ON.
• Baum B.R., Fleischmann G., Martens J.W., Rajhaty T., Thomas H. 1972. Notes on the habitat and distribution of Avena species in the Mediterranean and Middle East. Can. J. Bot. 50: 1385-1397.
• Chrząstek M., Paczos-Grzęda E., Miazga D. 2004. Charakterystyka cytologiczna i molekularna niektórych gatunków z rodzaju Avena, w: Genetyka w ulepszaniu roślin użytkowych. P. Krajewski, Z. Zwierzykowski, P. Kachlicki (Red.), Rozprawy i Monografie, Instytut Genetyki Roślin PAN, Poznań: 67-74.
• Cox T.S., Murphy J.P. 1990. The effect of parental divergence on F₂ heterosis in winter wheat crosses. Theor. Appl. Genet. 79: 241-250.
• Frey K.J. 1986. Genetic resources and their use in oat breeding. Proc.of the 2nd Int Oat Conf. 1985, Lawes D. A., Thomas H. (Red.), Aberystwyth, U.K.: 9-15.
• Goffreda J.C., Barnquist W.B., Beer S.C., Tanksley S.D., Sorrels M.E. 1992. Aplication of molecular markers to assess genetic relationships among accessions of wild oat, Avena sierilis. Theor. Appl. Genet. 85: 146-151.
• Goodman M.M. 1990. Genetic and germ plasm stocks worth conserving. The Journal of Heredity 81(1): 11-16.
• Heun M., Murphy J.P., Phillips T.D. 1994. A comparison of RAPD and isozyme analyses for determining the genetic relationships among Avena sterilis L. accessions. Theor. Appl. Genet. 87: 689-696.
• Legget J.M. 1992. Classification and speciation in Avena, w: Oat science and technology. H.G. Marshall, S.E. Sorrells (Red.). American Society of Agronomy. Agronomy Monograf No. 33, Madison, Wis., USA: 29-52.
• Martens J.W., McKenzie R.I.H., Harder D.E. 1980. Resistance to Puccinia gramminis avenae and P. coronata avenae in the wild and cultivated Avena populations of Iran, Iraq, and Turkey. Can. J. Genet. Cytol. 22: 641-649.
• Milligan B.G. 1992. Plant DNA isolation, w: Molecular analysis of populations: a practical approach. IRL Press, Oxford, UK: 59-88.
• Nei M., Li W.H. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proc. Natl. Acad. Sci. 76: 5269-5273.
• Paczos-Grzęda E. 2004. Pedigree, RAPD and simplified AFLP-based assessment of genetic relationships among Avena sativa L. cultivars. Euphytica 138: 13-22.
• Rajhathy T., Thomas H. 1974. Cytogenetics of oats (Avena L.). Misc. Publ. Genet. Soc., Ottawa, ON: 1-90.
• Rivoal R., Cook R. 1993. Plant parasitic nematodes in temperate agriculture. K. Evans, J.M. Webster (Red.), CAB International, Wallingford, UK: 259-303.
• Rohlf F.J. 2001. NTSYS-pc numerical taxonomy and multivariate analysis system. Version 5.1. Exeter Publishing Ltd., Setauket, N.Y.
• Somody C.N., Nalewaja J.D., Miller S.D. 1984. Wild oat (Avena fatua) and Avena sterilis morphological characteristic and respons to herbicides. Weed. Sci. 32: 353-359.
• Takeda K. Frey K.J. 1977. Growth rate inheritance and association with other traits in backcross populations of Avena sterilis x A. sativa. Euphytica 26: 09-317.
• Thomas H. 1992. Cytogenetics of Avena, w: Oat science and technology. H.G. Marshall, Sorrells S.E. (Red.), American Society of Agronomy. Agronomy Monograf No. 33, Madison, Wis., USA: 473-507.
• Thro A.M., Frey K.J. 1985. Inheritance of groat-oil content and high-oil selection in oats (Avena sativa L.). Euphytica 34: 251-263.
• Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J., Rafalski J.A, Tingey S.V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucl. Acid. Res. 18: 6531-6535.
• Zhou X., Jellen E.N., Murphy J.P. 1999. Progenitor germplasm of domesticated hexaploid oat. Crop Sci. 39: 1208-1214.