Conformation polymorphism in myogenin gene in pigs

• Autorzy: Nowak Z , Hermanowicz-Swierczek A. , Charon K.M. , Kulisiewicz J.
• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

Conformation polymorphism (SSCP) in exons 1-3 of myogenin gene was analysed in two groups of fatteners, both out of crossbred sows (Polish Large White × Polish Landrace) sired by Duroc (group I) or Duroc × Pietrain (group II) boars. The total DNA was isolated from a whole blood using phenol/chloroform extraction. Amplifications of exons was carried out using PCR method and primers designed by computer software “Primer 3” (www.genome.wi.mit.edu).Exon 1 showed low polymorphism with two SSCP patterns: A (two bands) in 98% of group I and 94% of group I, and E (three bands) in 2% of group I and 6% of group II fatteners. Exon 2 in all fatteners was found monomorphic. Exon 3 showed high polymorphism with four SSCP patterns:A, B, C and D (one to three bands). Most frequently observed was pattern A (88% in group I and 82% in group II), while the remaining patterns occurred in 2-10% of fatteners. Sequence analysis of conformation patterns did not show any mutation sites.

PL

Analizowano polimorfizm konformacyjny (SSCP) eksonów 1, 2 i 3 genu miogeniny w dwóch grupach tuczników mieszańcowych, będących potomstwem matek mieszańcowych wbp × pbz krytych knurami rasy duroc (grupa I) lub knurami mieszańcowymi duroc × pietrain (grupa II). DNA izolowano z pełnej krwi metodą ekstrakcji fenolowo-chloroformowej. Eksony amplifikowano metodą PCR, stosując startery opracowane za pomocą programu komputerowego „Primer 3” (www.genome.wi.mit.edu). Ekson 1 wykazywał mały polimorfizm – stwierdzono dwa wzory SSCP: A (dwa prążki) u 98% zwierząt z grupy I i 94% z grupy II oraz E (trzy prążki) u 2% tuczników z grupy I i 6% z grupy II. Ekson 2 okazał się monomorficzny u wszystkich badanych zwierząt. Ekson 3 wykazywał największy polimorfizm – stwierdzono cztery wzory SSCP: A, B, C i D – z jednym, dwoma lub trzema prążkami. W grupie I i II najczęściej występował wzór A (odpowiednio 88 i 82% zwierząt). Pozostałe wzory występowały u 2-10% tuczników. Analiza sekwencyjna badanych wzorów nie wykazała miejsc mutacyjnych.

Słowa kluczowe

EN

pig; fattener; hybrid; polymorphism; conformation polymorphism; SSCP method; myogenin gene; muscle mass; sequence analysis; animal genetics

• Wydawca: -
• Czasopismo: Animal Science Papers and Reports
• Rocznik: 2003
• Tom: 21
• Numer: 4
• Opis fizyczny: p.277-282,fig.,ref.

Twórcy

autor

Nowak Z

• Warsaw Agricultural University, Ciszewskiego 8, 02-786 Warsaw, Poland

autor

Hermanowicz-Swierczek A.

autor

Charon K.M.

autor

Kulisiewicz J.

Bibliografia

• 1. BUCHBERGER A., RAGGIE K., ARNOLD H.H., 1994 – The myogenin gene is activated during monocyte differentiation by pre- existing, not newly synthesized transcription factor MEF-2. Journal of Biological Chemistry 269 (25), 17289-17196.
• 2. CIEŚLAK D., KAPELAŃSKI W., BLICHARSKI T., PIERZCHAŁA M., 2000 – Restriction fragment length polymorphism in myogenin and Myf3 genes and their influence on lean meat content In pigs. Journal of Animal Breeding and Genetics 117, 43-55.
• 3. KITZMANN M., CARNAC G., VANDROMME M., PRIMIG M., LAMB N.J.C., 1998 – The muscle regulatory factors MyoD and Myf-5 undergo distinct cell cycle-specific expression in muszle cells. Journal of Cell Biology 142 (6), 1447-1459.
• 4. LARZUL C., LEFAUCHEUR L., ECOLAN P., GOGUE J., TALMANT A., SELLIER P., LE ROY P., MONIN G., 1997 – Phenotypic and genetic parameters for longissimus muscle fiber characteristics in relation to growth, carcass and meat quality traits in Large White pigs. Journal of Animal Science 75, 3126-3137.
• 5. SOUMILLION A., ERKENS J.H.F., LENSTRA J.A., RETTENBERGER G., TE PAS M.F.W.,1997 – Genetic variation in the porcine myogenin gene locus. Mammalian Genome 8, 564-568.
• 6. TE PAS M.F.W., HARDERS F.L., SOUMILLION A., BORN L., MEUWISSEN T.H.E., 1994 – Genetic variation at the porcine MYF-5 gene locus. Lack of association with meat production traits. Mammalian Genome. 10, 123-127.