The level of inbreeding in three subspecies of leopard (Panthera pardus)

• Autorzy: Sternicki T. , Goral K. , Olech W. , Szwaczkowski T.

Warianty tytułu

PL

Poziom inbredu u trzech podgatunków lamparta (Panthera pardus)

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

The level of inbreeding in three subspecies of leopard (Panthera pardus). The estimation of inbreeding level is one of the most important task in captive breeding. The rising of inbreeding coefficient can caused reduction of traits value. It caused deterioration of trait connected with reproduction and immunity. The aim of this paper was to estimate the level of inbreeding coefficient and its changes in time within three leopard Panthera pardus captive populations: Panthera pardus japonensis, Panthera pardus saxicolor and Panthera pardus orientalis. All subspecies are included in European Endangered Species Programme (EEP). The material for analysis was pedigree data taken from the ISIS data base covered information about animals born between year 1915 and 2003. The inbreeding coefficient was calculated using additive matrix method. In the first years (until 1979) average inbreeding was on the high level reachingthe 0.25. Specimens born in the last period (2001- -2003) have smaller inbreeding average on the level 0.043. The percentage of inbred specimens within subspecies was equal to: 13.1% (japonensis), 24.7% (orientalis) and 28.6% (saxicolor).

PL

Poziom inbredu u trzech podgatunków lamparta (Panthera pardus). Szacowanie poziomu inbredu jest bardzo ważną częścią hodowli populacji zwierząt utrzymywanych w niewoli. Wzrastający współczynnik inbredu objawia się jako depresja inbredowa. Jest odpowiedzialna za redukcję cech związanych z rozrodem i odpornością. Celem tych badań było oszacowanie poziomu inbredu i jego zmian w czasie wśród trzech podgatunków lamparta objętych programem EEP (Panthera pardus japonensis, Panthera pardus saxicolor, Panthera pardus orientalis). Materiał stanowiły dane rodowodowe dotyczące osobników urodzonych w latach 1915-2003, skatalogowane w bazie ISIS. Współczynnik inbredu oszacowano na podstawie macierzy spokrewnień addytywnych. W pierwszych analizowanych latach (do 1979 roku) średni współczynnik inbredu osiągał wysoką wartość 0,25. Osobniki urodzone w latach 2001-2003 charakteryzowały się znacznie niższą wartością parametru 0.043. Procent zwierząt zinbredowanych w obrębie każdego podgatunku wynosił 13,1% (japonensis), 24.7% (orientalis) and 28,6% (saxicolor).

• Wydawca: -
• Czasopismo: Annals of Warsaw University of Life Sciences - SGGW. Animal Science
• Rocznik: 2010
• Tom: 47
• Opis fizyczny: p.205-212,fig.,ref.

Twórcy

autor

Sternicki T.

• Department of Genetics and Animal Breeding, University of Life Sciences Poznan, Wolynska 33, 60-635 Poznan, Poland

autor

Goral K.

autor

Olech W.

autor

Szwaczkowski T.

Bibliografia

• BOYCE A.J., 1983: Computation of inbreeding and kinship coefficients on extended pedigrees. Heredity 74: 400-404.
• DE BOER L.E.M., 1995: Genetics and breeding programmes. EEP Coordinators manual. Amsterdam.
• ELRIDGE M.D.B., KING J.M., LOUPIS A.K., SPENCER P.B.S., TAYLOR A.C., HALL G.P., 1999: Unprecedented low levels of genetic variation and inbreeding depression in an island population of black-footed rock-wallaby. Conserv. Biol. 13: 531-541.
• FRAKHAM R., 1997: Do island populations have less genetic variation than mainland populations? Heredity 78:311-327.
• GIBSON J.P., VAN ARENDONK J.A.M., 1998: Introduction to the design and economics of animal breeding strategies. Warsaw Agr. Univ. August 10-21. Warszawa. Lecture notes.
• HEDRICK P.W., 1987: Estimation of the rate of partial inbreeding. Heredity 58: 161-166.
• HENDERSON C.R., 1988: Theoretical basis and computational methods for a number of different animal models. J. Dairy Sci. 71: 1-16.
• KELLER L.F., JEFFERY K.J., ARCESE P., BEAUMONT M.A., HOCHACHKA W.M., SMITH J.N., BRUFORD M.W., 2001: Immigration and the ephemerality of a natural population bottleneck: evidence from molecular markers. Proc. Royal Soc. London B. Biol. Sci. 268: 1387-1394.
• LAIKRE L., ANDREN R., LARSSON H.O., RYMAN N., 1996: Inbreeding depression in brown bear (Ursus arctos). Biol. Conserv. 76: 69-72.
• LAIKRE L., 1999: Conservation genetics of Nordic carnivores: lessons from zoos. Heredity 130:203-216.
• LEROY G., ROGNON X., VARLET A., JOFFRTN C, VERRIER E., 2005: Genetic variability in French dog breeds assessed by pedigree data. J. Anim. Breed. Genet. 123: 1-9.
• MEAGHER S., PENN D.J., POTTS W.K., 2000: Male-male competition magnifies inbreeding depression in wild house mice. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 97: 3324-3329.
• MITHTHAPALA S., SEIDENSTICKER J., O'BRIEN S.J., 1996: Phylogeographic subspecies recognition in leopards (Pantherapardus): molecular genetic variation. Conserv. Biol. 10: 1115-1132.
• NOWICKI B., 1985: Genetyka i metody doskonalenia zwierząt. PWRiL. Warszawa.
• OLECH W., 2003: Wpływ inbredu osobniczego i inbredu matki na przeżywalność cieląt żubra (Bison bonasus). Rozprawy naukowe i monografie. Wyd. SGGW. Warszawa.
• QUAAS R.L., 1976: Computing the diagonal elements and inverse of a large numerator relationship matrix. Biometrics 32: 949-953.
• SHOEMAKER A.H., 1981: International leopard studbook. Columbia. South Carolina. Riverbanks Park.
• SHOEMAKER A.H., 1983: Population dynamic of pedigree leopards, panther parous ssp. In captivity. Zoo Biology 2: 79-91.
• STERNICK1 T., 2002: Poziom zinbredowania a długość życia jelenia milu (Elaphurus davidianus; Milne Edwards 1866). Praca magisterska. Bibl. Gł. AR. Poznań.
• STERNICKI T., SZABLEWSKI P., SZWACZKOWSKI T., 2003: Inbreeding effects on lifetime in David's deer (Elaphurus davidianus. Milne Edwards 1866) population. J. Appl. Genet. 44: 175-183.
• STERNICKI T, 2006: Uwarunkowania genetyczne i pozagenetyczne długości życia lamparta (Pantera pardus) i pantery śnieżnej (Uncia uncia). Rozprawa doktorska. Bibl. Gł. AR. Poznań.
• SZABLEWSKI P., 2003: Zmienność genetyczna w populacjach wybranych gatunków zwierząt utrzymywanych w ogrodach zoologicznych. Rozprawa doktorska. Bibl. Gł. AR. Poznań.
• WRIGHT S., 1922: Coefficients of inbreeding and relationship. Amer. Nat. 56: 330-338.
• WRIGHT S., 1931: Evolution in Mendelian populations. Genetics 16: 97-159.
• ZHU J., NESTOR K.E., MORITSU Y., 1996: Relationship between band sharing levels of DNA fingerprints and inbreeding coefficients and estimation of true inbreeding in turkey lines. Poult. Sci. 75: 25-28.

Uwagi

Rekord w opracowaniu